拟南芥脱水应答原件结合蛋白及其编码基因与应用

摘要

本发明涉及一个拟南芥中脱水应答原件结合蛋白2A基因(AtDREB2A)的克隆、重组及应用。它具有SEQ ID No.1所示的核苷酸序列。从拟南芥叶片中提取总RNA，做逆转录PCR，得到AtDREB2A基因并将其连接到PBS-TII载体，得到中间载体PBS-TII-AtDREB2A。以PBS-TII-AtDREB2A为模板，用折叠延伸PCR(SOE-PCR)方法PCR扩增得到拟南芥脱水应答原件结合蛋白2A组成型激活基因(AtDREB2A-CA)，并将扩增产物连接到植物表达载体，得到植物表达载体pH7m24GW，3-Prd29A-AtDREB2A-CA。用电击法将此载体导入农杆菌C58细胞，用这种细胞浸染烟草，得到了转入AtDREB2A-CA的烟草，通过测试，发现了转基因烟草抗盐性得到很大提高。

权利要求

1.一种拟南芥来源的脱水应答原件结合蛋白2A组成型激活基因(AtDREB2A-CA)，其特征在于它为SEQ ID No.1所示的核苷酸序列。

2.权利要求1所述的拟南芥脱水应答原件结合蛋白2A组成型激活基因编码的蛋白质，其特征在于所述的蛋白质为SEQ ID No.2所示的氨基酸序列。

3.一种重组载体，其特征在于含有权利要求1所述的拟南芥脱水应答原件结合蛋白2A组成型激活基因(AtDREB2A-CA)全序列。

4.一种权利要求1所述的拟南芥脱水应答原件结合蛋白2A组成型激活基因(AtDREB2A-CA)的应用，其特征在于它用于制备转基因烟草。

说明书

拟南芥脱水应答原件结合蛋白及其编码基因与应用

技术领域

[0001] 本发明属于分子生物学领域，特别涉及一种拟南芥(Arabidopsis thaliana)脱水应答原件结合蛋白及其编码基因与应用，具体涉及一个拟南芥中脱水应答原件结合蛋白2A基因(AtDREB2A)的克隆、重组及应用。

背景技术

[0002] 植物总是直接生活在复杂多变的自然环境中。干旱、盐碱、寒冷及高温等逆境会使植物受到生理伤害，严重时甚至导致植物死亡。为了适应这些逆境，植物在漫长的的进化过程中演化出了对这些非生物胁迫的抗性机制，例如：气孔关闭、细胞膜及胞质成分的改变等。植物在非生物胁迫的作用下，能够通过信号传导途径，使一些基因的表达受逆境调控，从而对胁迫作出应答(Shinozaki and Yamaguchi-Shinozaki，1996)。转录因子是一类能够特异地结合于特定DNA区，并对其下游基因的转录有激活或抑制作用的蛋白质。植物中的转录因子起着调控逆境胁迫应答，病原反应以及发育等相关基因表达的作用。其中的CBF/DREB(C-repeat-binding-factor/dehydration-responsive-element-binding)转录因子是植物非生物胁迫应答的重要成分，诱导表达后，可以激活许多下游抗逆基因的表达，从而增强植株的抗逆性。

[0003] 自从1997年，Stocking等人用酵母一元杂交的方法从拟南芥中分离了一个DRE/CRT结合蛋白CBF1以来(Stockinger et al.1997)，已经到了许多DREB相关基因(DREB-like)，这些基因产物能够结合启动子区的DRE/CRT元件，以启动一序列非生物抗性基因的表达，并赋予植物耐盐、干旱、寒冷、高温等能力。(Gilmour et al.1998；Liu et al.1998；Shinwari et al.1998)。

[0004] 一般认为，与植物抗病机制不同，植物对干旱和高盐等逆境的抗性受多基因控制，因此，利用基因工程技术导入单个功能基因很难大幅度地提高植物的抗逆性。而信号调控途径中的上游基因，如转录因子则能够基因启动子区域的顺式作用元件特异性结合，在诱导下游抗逆相关的功能基因表达中起到关键作用，因此利用转录因子增强植物抗逆性成为改良植物抗逆性的重要途径。在抗盐基因工程领域，DREB-直备受关注，研究者们通过转基因手段DREB导入植物基因组中，得到了许多抗性增强的转基因品种。

[0005] DREB2A基因是DREB基因家族的成员，它的全cDNA序列与35S启动子相连转入拟南芥，发现在非胁迫条件下DREB2A能够表达，但下游基因表达微弱，植株抗性没有得到明显提高，推测DREB2A需要经过转录后加工比如磷酸化等。生物信息学分析表明，DREB2A蛋白的136-165位氨基酸残基富含泛素化位点，这些位点的存在，使得该蛋白进入降解途径，因而不能长期稳定存在，发挥功能。这也许是植物体内存在的对这个蛋白的负调控机制。在国内，周淼平等人将拟南芥DREB2A与bar基因同时导入小麦，测定了共转化频率，但并未对转基因小麦的抗盐性做出评估。我们通过折叠延伸PCR的方法将DREB2A中第136-165位氨基酸删除，得到组成型激活的DREB2A-CA。通过农杆菌介导的转基因方法，在转基因烟草中验证其功能。发现该基因能够有效地提高植物的抗盐，抗旱，抗高温能力。

发明内容

[0006] 本发明的目的在于提供一种拟南芥来源的脱水应答原件结合蛋白2A组成型激活(constitutive activation/CA)基因(AtDREB2A-CA)。

[0007] 本发明的第二个目的是提供该重组基因编码的蛋白质。

[0008] 本发明的再一个目的还在于提供含有该重组基因的重组载体和宿主细胞。

[0009] 本发明的另一个目的在于提供该基因的用途。

[0010] 本发明提供了一种拟南芥脱水应答原件结合蛋白2A组成型激活基因(AtDREB2A-CA)，如序列表中SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列构成。

[0011] 本发明提供了一种上述拟南芥脱水应答原件结合蛋白2A组成型激活基因(AtDREB2A-CA)编码的蛋白质，如序列表中SEQ ID NO.2所示的氨基酸序列的蛋白质。

[0012] 本发明提供了一种上述拟南芥脱水应答原件结合蛋白2A组成型激活基因(AtDREB2A-CA)重组克隆载体pBS-T-AtDREB2A-CA。

[0013] 含有上述的拟南芥脱水应答原件结合蛋白2A组成型激活基因(AtDREB2A-CA)的重组载体，这些重组载体包括质粒和植物表达载体。

[0014] 所述的重组植物表达载体pH7m24GW，3-Prd29A-DREB2A-CA。

[0015] 含有上述拟南芥脱水应答原件结合蛋白2A组成型激活基因(AtDREB2A-CA)完整编码阅读框序列的宿主细胞，如含有上述重组载体的宿主细胞也属于本发明的保护范围。

[0016] 所述的宿主细胞选自大肠杆菌细胞、农杆菌细胞或烟草细胞。

[0017] 本发明提供了一种含有AtDREB2A-CA的基因工程菌。

[0018] 上述拟南芥脱水应答原件结合蛋白2A组成型激活基因(AtDREB2A-CA)的应用包括该基因编码的蛋白在植物中的应用；用所述的重组载体，如植物表达载体转化玉米细胞；或者用所述含有该基因的农杆菌与玉米、大豆、水稻、花生、向日葵、马铃薯、棉花、谷子、大麦以及花卉和蔬菜等细胞共培养，得到转基因的再生植株；或者用所述的AtDREB2A-CA遗传转化获得上述物种转基因植株。

[0019] 本发明的技术方案具体概述如下：

[0020] 一种拟南芥脱水应答原件结合蛋白2A组成型激活基因(AtDREB2A-CA)，如序列表中SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列，还包括SEQ ID No.1所示的核苷酸序列添加、取代、插入或缺失一个或多个核苷酸的70％以上同源序列或者其等位基因及其衍生的核苷酸序列。

[0021] 一种含有拟南芥脱水应答原件结合蛋白2A组成型激活基因(AtDREB2A-CA)重组载体pH7m24GW，3-Prd29A-DREB2A-CA的农杆菌C58。

[0022] 一种拟南芥脱水应答原件结合蛋白2A组成型激活基因(AtDREB2A-CA)编码的蛋白，如序列表中SEQ ID NO.2所示氨基酸序列。

[0023] 一种拟南芥脱水应答原件结合蛋白2A组成型激活基因(AtDREB2A-CA)编码的蛋白在烟草，玉米和大豆中的应用。

[0024] 所述的拟南芥脱水应答原件结合蛋白2A组成型激活基因(AtDREB2A-CA)还应用于制备转基因大豆、水稻、花生、向日葵、马铃薯、棉花、谷子、大麦以及花卉和蔬菜等植株。

[0025] 本发明的克隆方法由下述步骤组成：

[0026] 从拟南芥叶片中提取总RNA，根据GenBank中拟南芥脱水应答原件结合蛋白2A(AtDREB2A)的天然序列，设计由SEQ ID NO.3所示的上游引物P1，和由SEQ ID NO.4所示的下游引物P2，克隆得到AtDREB2A基因，将此基因连接PBS-TII载体。得到中间载体PBS-TII-AtDREB2A然后利用折叠延伸PCR(SOE-PCR)方法扩增得到拟南芥脱水应答原件结合蛋白2A组成型激活基因(AtDREB2A-CA)。

[0027] 本发明构建含拟南芥脱水应答原件结合蛋白2A组成型激活基因的植物表达载体pH7m24GW，3-Prd29A-DREB2A-CA，由下述步骤组成：

[0028] 设计由SEQ ID NO.5所示的上游引物F1，和由SEQ ID NO.6所示的下游引物R1，以PBS-TII-AtDREB2A为模板，进行PCR扩增，得到第一个PCR片段。再用SEQ ID NO.7所示的上游引物F2，和由SEQ ID NO.8所示的下游引物R2，以PBS-TII-AtDREB2A为模板，进行第二次PCR扩增，得到第二个PCR片段。然后将上诉两个片段做SOE-PCR得到一个融合DNA片段，即AtDREB2A-CA，将此PCR扩增产物经EcoRI和EcoRV酶切后，将植物表达载体pH7m24GW，3-Prd29A经EcoRI和EcoRV酶切，二者进行连接反应，得到植物表达载体pH7m24GW，3-Prd29A-DREB2A-CA。

[0029] 本发明提供了一种拟南芥脱水应答原件结合蛋白2A组成型激活基因基因及包括该基因的重组载体和宿主细胞及应用。然后连接到植物表达载体上，利用农杆菌侵染法转化烟草，获得的转基因植株，进行了抗盐性分析，结果表明转基因烟草抗盐能力得到提高。

附图说明

[0030] 图1用AtDREB2A引物对拟南芥cDNA的PCR电泳图。

[0031] 图2AtDREB2A连接PBS-TII载体的PCR验证验证结果。

[0032] 图3PBS-TII-AtDREB2A载体示意图。

[0033] 图4用SOE-PCR得到AtDREB2A-CA的电泳验证结果。

[0034] 图5植物表达载体pH7m24GW，3-Prd29A-DREB2A-CA用HindiIII酶切验证。

[0035] 图6植物表达载体pH7m24GW，3-Prd29A-DREB2A-CA示意图。

[0036] 图7烟草转基因过程。

[0037] 图8转基因烟草基因组PCR。

[0038] 图9转基因烟草的抗盐性能测试。

具体实施方式

[0039] 实施例1

[0040] 拟南芥脱水应答原件结合蛋白2A组成型激活基因AtDREB2A基因的克隆及中间载体pBS-T-AtDREB2A的构建

[0041] 以拟南芥RNA为模板，使用Reverse Transcription System(Promega公司)试剂盒进行反转录，合成cDNA第一链。

[0042] 1.将1μg(2μl)的总RNA置于1.5ml的离心管中，70℃加热10min，迅速在冰上冷却，短暂离心后，置于冰上；

[0043] 2.反转录-的反应体系如下：

[0044]

[0045] 3.混匀后，42℃温浴50min；

[0046] 4.95℃加热5min，4℃放置5min，使AMV逆转录酶失活，不再与cDNA链相结合；

[0047] 5.取1μLcDNA反应液为模板，进行PCR反应，用AtDREB2A基因特异引物，SEQ ID NO.3及SEQ ID NO.4：

[0048] F5′-GGGAAGGAGATGGCAGTTT-3′19nt

[0049] R5′-GTTGTGGGATTAAGGCAAATA-3′21nt

[0050] PCR反应体系如下：

[0051]

[0052] PCR扩增条件为：

[0053]

[0054]

[0055] 取5μL PCR产物进行凝胶电泳检测。电泳结果见图1所示。

[0056] 然后按照上述方法将DREB基因的PCR片段连接pBS-TII载体，

[0057] 将AtDREB2A基因与pBS-TII载体链接，

[0058] 反应体系如下：

[0059]

[0060] 反应条件：23℃，10min。连接产物转化大肠杆菌TOP10细胞(购买于天根公司)，涂布于含氨苄的LB平板。

[0061] 连接产物鉴定：

[0062] 挑取抗性菌落，在含有Amp 100mg/L的LB液体培养基中培养12h，提取质粒，进行PCR验证，PCR电泳验证结构见图2。由此，我们到的了中间载体pBS-T-AtDREB2A，载体示意图见图3。将该载体送往华大基因公司测序，我们得到了该基因的碱基序列，用ClustalX2软件进行序列比对，与Genbank所公布的序列完全一致。

[0063] 实施例2

[0064] 构建植物表达载体pH7m24GW，3-Prd29A-DREB2A-CA

[0065] 引物设计如F1，R1和F2，R2，序列见SEQ ID NO.5，SEQ ID NO.6，SEQ ID NO.7，SEQ ID NO.8。

[0066] 用拟南芥pBS-T-AtDREB2A为模板，分别以F1，R1和F2，R2为引物，用PFU酶分别做PCR。

[0067] 体系如下：

[0068]

[0069] 反应条件为：

[0070]

[0071] 以上两对引物PCR产物见图4中第1及第2泳道。

[0072] 切胶回收以上两种片段然后做连接：

[0073]

[0074]

[0075] 反应条件为：

[0076]

[0077] 于是得到连接产物。

[0078] 将此连接产物做全长延伸，体系如下：

[0079]

[0080] 反应条件为：

[0081]

[0082] 连接产物即AtDREB2A-CA，结构见图4中第3泳道。

[0083] PCR产物直接用EcoRI和EcoRV酶切，酶切体系为：

[0084]

[0085] 37℃12h进行完全酶切，酶切产物做切胶回收，确定浓度，连接植物表达载体，连接体系为：

[0086]

[0087] 反应产物与大肠杆菌感受态细胞Top10混合，做转化，并涂布于含壮观霉素Spe的抗性平板上，提取质粒，用HindIII做酶切检测，结构见图5。于是得到了植物表达载体pH7m24GW，3-Prd29A-AtDREB2A-CA，载体示意图见图6。将该载体送往华大基因公司测序，我们得到了拟南芥脱水应答原件结合蛋白2A组成型激活(constitutive activation/CA)基因AtDREB2A-CA的碱基序列，即SEQ ID No.1所示的核苷酸序列。

[0088] 实施例3

[0089] 用于植物转基因的农杆菌工程菌种C58：pH7m24GW，3-Prd29A-DREB2A-CA的构建。

[0090] 农杆菌感受态细胞制备

[0091] 1.将农杆菌C58单菌落接种于5mL YEP液体培养基中，28℃，180r/min振荡培养过夜；

[0092] 2.将上述菌液转入100mL YEP液体培养基中，28℃，180r/min，振荡培养(OD600值约为0.5)；

[0093] 3.冰浴30min后，4℃，4000r/min离心10min，收集菌体，重悬于20mL预冷的H2O中；

[0094] 4. 4℃，4000r/min离心10min，收集菌体，重悬于预冷的10％甘油中，每管200μL分装，液氮速冻，存于-80℃备用。、

[0095] 植物表达载体的电击转化

[0096] 1.将-80℃取出的C58感受态细胞置于冰上，使其缓慢融化；

[0097] 2.加入2μL质粒，混匀；

[0098] 3.转移至电击杯中，以上操作均在冰上进行；

[0099] 4.设置电击转化仪参数：25μF，400olm，1500V，5ms，电击转化；

[0100] 5.室温静置2min后加入1mL YEB液体培养基，28℃，180r/min振荡培养4h；

[0101] 6.取50μL菌液涂布于含100mg/L Ka抗性的YEB平板上，倒置平板，28℃培养48h，直至看到清晰的单菌落。

[0102] 菌落PCR

[0103] 1.挑取若干C58单菌落，分别溶于30μL ddH2O中，98℃煮沸10min；

[0104] 2.取上述菌液1μL作为模板，依照上述该基因的反应程序进行PCR反应。

[0105] 实施例5

[0106] 农杆菌介导的烟草遗传转化

[0107] 烟草苗的无菌培养：将烟草种子播种在培养基上，选饱满、健康的烟草种子，用75％乙醇浸泡1min 25％的安替福明(有效氯2.5％)水溶液灭菌8min，无菌水漂洗三次，将种子放在MS培养基中，25℃光培养，16h/8h光周期。

[0108]

[0109] (1)挑取阳性农杆菌单菌落，接种到含100mg/L卡那霉素的LB液体培养基中，于28℃、200r/min的摇床上过夜培养。

[0110] (2)当菌液处于旺盛生长期(OD600＝0.6-0.9)时，将菌液倒入50ml离心管，在4000r/min下离心15min，弃上清液，收集菌体。

[0111] (3)用无菌水清洗菌体2次。

[0112] (4)用侵染培养基重悬菌体，使OD600＝0.9-1.2。

[0113] 外植体浸染

[0114] 将烟草叶片去除主脉和叶边缘，然后将叶片切成1cm×1cm大小，浸入制备好的农杆菌菌液，浸泡8-15min，其间摇动2-3次，使叶片充分接触菌液，取出叶片，用无菌的滤纸吸净多余的菌液，叶面朝下、叶背朝上接种于共培养基中，25℃左右培养3-4天。

[0115] (2)将叶片转移至筛选培养基中，20天左右更换一次培养基，诱导抗性芽产生(图7a)，当抗性芽从愈伤组织上长到1cm左右(图7b)，从愈伤上切取抗性芽，接种于抗性苗生根培养基(图7c)。

[0116] 转基因苗移栽

[0117] 将根系生长良好、生命力旺盛的烟草组培苗从组培瓶中取出图，用自来水冲洗培养基(尽量减少根系损伤)，种植在蛭石和腐殖土的培养土中，覆盖薄膜保温保湿15天，然后揭开薄膜，定期浇水、施肥，使之在温室中正常生长(图7d)。

[0118] 实施例6

[0119] 转基因烟草的分子检测和抗盐性检测

[0120] 转基因烟草基因组DNA的PCR检测：1.CTAB法提取烟草总DNA；2.以基因组DNA为模板，进行PCR检测，引物为P5、P6，反应条件：

[0121] DREB2A检测引物

[0122] F TGACGGTACTACTGTGGCT

[0123] R TTCTACAATCCCTTGCTCC

[0124] PCR反应体系：

[0125]

[0126] PCR扩增条件：

[0127]

[0128] 取上述PCR产物5微升，进行电泳检测，如图8所示，说明AtDREBA2A-CA基因已成功转入烟草。

[0129] 转基因烟草的抗盐性检测

[0130] 将在温室正常生长的，5-7cm转基因烟草苗和野生型对照苗，分别浇上含300mmol/L及500mmol/L浓度的NaCl的水，在温室中保持85％的湿度。监测发现，在
300mmol/LNaCl的生长条件下，野生型的烟草生长缓慢，生物量较少。如此相反，转基因烟草能够开花结实，相对生物量较高。见图9a。在500mmol/LNaCl的生长条件下，生长一周以后，野生型烟草叶片发黄，萎蔫，组织坏死，不能正常生长。尽管转基因烟草的生长也受到一定程度的抑制，但远不像野生型烟草那样明显。见图9b。