一种鲤疱疹病毒2型的巢式PCR检测试剂盒转让专利

申请号 : CN201210378833.2

文献号 : CN102851403B

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相似专利:

发明人 : 徐进张辉曾令兵

申请人 : 中国水产科学研究院长江水产研究所

摘要 :

本发明公开了一种鲤疱疹病毒2型的巢式PCR检测试剂盒,其特征在于:盒体(1)内衬垫(2)上放置6个盛有试剂的1.5mL离心管,包括10×反应缓冲液:含Tris-HCl100mM,KCl500mM,MgCl215mM,dNTPs2mM(3),Taq酶1U/μL(4),引物P1:含CyHV-2P1F、CyHV-2P1R各10μM(5),引物P2:含CyHV-2P2F、CyHV-2P2R各10μM(6),纯水(7),阳性DNA10μg/mL(8)。外引物P1的序列为:CyHV-2P1F:TGAAATGTCAAAAGTGGATGG,CyHV-2P1R:TATTCCCAGACAGCCTTCAAA;内引物P2的序列为:CyHV-2P2F:GAACACCGCTGCTCATCATC,CyHV-2P2R:ACTCTTCGCAAGTCCTCACC。经过内外引物的两轮扩增,最终可获得357bp的DNA产物。本发明操作简单,方便快捷,检测限低,灵敏度高,检测结果准确可靠。

权利要求 :

1.一种鲤疱疹病毒2型的巢式PCR检测试剂盒,其特征在于:盒体(1)内衬垫(2)上放置6个盛有试剂的1.5mL离心管,包括10×反应缓冲液:含Tris-HCl100mM,KCl500mM,MgCl215mM,dNTPs2mM(3),Taq 酶 1U/μL(4),引 物 P1:含 CyHV-2P1F、CyHV-2P1R 各

10μM(5),引物P2:含CyHV-2P2F、CyHV-2P2R各10μM(6),纯水(7),阳性DNA10μg/mL(8);

上述各种液体试剂分别装在1.5mL离心管中,置于盒内;

CyHV-2P1F为:TGAAATGTCAAAAGTGGATGGCyHV-2P1R为:TATTCCCAGACAGCCTTCAAACyHV-2P2F为:GAACACCGCTGCTCATCATCCyHV-2P2R为:ACTCTTCGCAAGTCCTCACC。

说明书 :

一种鲤疱疹病毒2型的巢式PCR检测试剂盒

技术领域

[0001] 本发明涉及水产养殖动物病原检测领域,更具体涉及一种鲤疱疹病毒2型(Cyprinidherpesvirus 2,CyHV-2)的基因检测试剂盒,适用于水产养殖中鲤疱疹病毒病2型的诊断、进出口检验检疫中鲤疱疹病毒病2型的快速检测。

背景技术

[0002] 鲤疱疹病毒2型(CyHV-2)是造成金鱼大量死亡的疱疹病毒性造血器官坏死病(herpesviral haematopoietic necrosis,HVHN)的病原,故也称为金鱼造血器官坏死病毒(goldfish haematopoietic necrosis virus,GFHNV)。按照国际病毒系统分类委员会的系统命名规则,正式命名为鲤疱疹病毒2型(Cyprinid herpesvirus 2,CyHV-2)。该病毒于1992年秋季和1993年春季因造成日本西部养殖的金鱼大量死亡而被首次发现,其致死率高达100%。该病随后在美国,中国台湾,澳大利亚和英国相继爆发,给金鱼养殖造成了巨大的经济损失。近年来,我国鲫鱼(异育银鲫)主要养殖区的鲫鱼出现了大规模死亡,死亡率达
80%以上,经过电镜观察和分子检测,确定病原为CyHV-2。该病传播范围广、传染性强、发病快、致死率高,已给我国鲫鱼养殖业造成了巨大的经济损失,成为我国水产养殖中危害最为严重的病毒性疾病之一。
[0003] 细胞培养分离技术是病毒诊断的有效方法,通常是世界动物卫生组织(OIE)推荐的鱼类病毒检测的首选方法。但现有研究资料表明,CyHV-2很难在现有的鱼类细胞系中增殖。胖头鲤细胞(fathead minnow cells,FHM)、鲤鱼上皮瘤细胞(epithelioma papillosum cyprini,EPC)、鳗鱼肾细胞(eel kidney,EK-1)、鲑鱼胚胎细胞(chinook salmon embryo,CHSE-214)、虹鳟鱼性腺细胞(rainbow trout gonad,RTG-2)和罗非鱼卵巢细胞(tilapia ovary,TO-2)均对CyHV-2不敏感。仅锦鲤鳍细胞(koi fin 1,KF-1)能产生特征性的细胞病变效应(CPE),但可惜的是,病毒在KF-1细胞上传至第3代后,CPE消失。可见目前阶段,细胞培养不是CyHV-2诊断的有效方法,基于病毒基因检测的技术就成为了CyHV-2最有效的检测方法。聚合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction,PCR)扩增技术作为最基本的基因扩增技术,现在广泛应用于分子生物学的各个领域,在病毒鉴定领域也得到了广泛的应用。然而其扩增结果受限于检测对象的模板含量,当模板量很少时,常常获得阴性结果。在鱼病学领域,患病鱼体内的病毒量通常很低,使用传统的常规PCR检测技术通常由于其灵敏度不够而出现假阴性结果,无法满足水产养殖病害诊断以及口岸检疫工作的需要。巢式PCR扩增技术是一种建立在常规PCR技术上的新技术,其设计两套PCR引物(巢式引物)对模板进行两轮PCR扩增反应。在第一轮扩增中,外引物用以产生扩增产物,以此扩增产物作为模板用内引物进行第二轮扩增。由于巢式PCR反应有两次PCR扩增,从而降低了扩增多个靶位点的可能性(因为与两套引物都互补的模板很少)因而增加了检测的敏感性,同时又有两对PCR引物与检测模板的配对,增加了检测的可靠性。目前未见CyHV-2的巢式PCR试剂盒的报道。

发明内容

[0004] 针对现有技术的不足,本发明的目的是在于提供了一种鲤疱疹病毒2型的巢式PCR检测试剂盒,本发明操作简单,方便快捷,检测限低,灵敏度高,检测结果准确可靠。
[0005] 本发明以抽提自患病鱼组织的病毒DNA作为PCR扩增模板,用两对嵌套式引物对模板DNA进行扩增,可以在较短时间内完成整个PCR检测,不但极大地提高了检测灵敏度,而且缩短了检测时间,且结果准确可靠,是一种有效的鲤疱疹病毒2型分子生物学检测方法。
[0006] 为了实现上述的目的,本发明采用以下技术方案:
[0007] 一种鲤疱疹病毒2型的巢式PCR检测试剂盒,包括盒体,盒内衬垫上放置6个盛有试剂的1.5mL离心管,包括10×反应缓冲液,Taq酶(1U/μL),引物P1(含CyHV-2P1F、CyHV-2P1R各10μM),引物P2(含CyHV-2P2F、CyHV-2P2R各10μM),纯水(分子生物学级),阳性DNA(10μg/mL)。
[0008] 所述的10×反应缓冲液的配方为:Tris-HCl 100mM,KCl 500mM,MgCl215mM,dNTPs2mM。
[0009] 所述的Tris-HCl为三羟甲基氨基甲烷盐酸盐;KCl为氯化钾;MgCl2为氯化镁;dNTPs为合成DNA所需的四种脱氧核苷酸的等体积混合液。
[0010] 上述各种液体试剂分别装在1.5mL离心管中,置于盒内。
[0011] 所述的引物核苷酸序列为:
[0012] CyHV-2P1F为:TGAAATGTCAAAAGTGGATGG
[0013] CyHV-2P1R为:TATTCCCAGACAGCCTTCAAA
[0014] CyHV-2P2F为:GAACACCGCTGCTCATCATC
[0015] CyHV-2P2R为:ACTCTTCGCAAGTCCTCACC
[0016] 一种鲤疱疹病毒2型的巢式PCR检测试剂盒,其检测步骤是:
[0017] 1)检测前检测样本DNA的提取:取适量濒死的患病鱼鰓丝、脾脏、肾脏组织,用玻璃匀浆器匀浆,5000rpm于4℃离心10分钟,取适量匀浆上清液用DNA提取试剂提取DNA。
[0018] 2)外引物P1的PCR扩增:制备PCR反应体系20μL:10×PCR反应缓冲液2μL,Taq酶(1U/μL)1μL,外引物P10.5μL,DNA模板4μL,纯水补足至20μL。同时取阳性对照DNA模板做阳性对照,取纯水做阴性对照。PCR反应条件为:94℃预变性5分钟,94℃变性30秒,55℃退火30秒,72℃延伸40秒,30个循环后72℃5分钟。
[0019] 3)内引物P2的PCR扩增:取1μL外引物P1的扩增产物作为模板,以内引物P2为引物进行PCR扩增,其他反应成分和反应条件同第一次扩增。
[0020] 4)扩增产物检测与分析:1~2%(W/V)琼脂糖凝胶电泳检测目的条带并成像分析。
[0021] 5)结果判定:
[0022] A.当检测样本和阳性对照的扩增条带大小一致,为357bp时,结果为阳性;
[0023] B.当检测样本无条带或条带大小与阳性对照的扩增条带大小不一致,不为357bp时,结果为阴性;
[0024] C.当阳性对照无条带时,表明试剂盒中相关试剂降解,试剂盒失效;
[0025] D.当阴性对照出现条带时,操作过程中有试剂污染,检测结果无效。
[0026] 本发明的有益效果是:
[0027] 本发明检测鲤疱疹病毒2型的巢式PCR试剂盒,提供一种检测高致病性的鱼类病毒的分子检测技术,尤其是能快速、简便、准确的检测病原的试剂盒,能在8小时内完成检测。
[0028] 本发明提供了一种依赖PCR的分子检测试剂盒,克服细胞分离培养、电镜超薄切片观察、ELISA检测等病毒诊断方法繁琐、效率低、可靠性差、成本高的不足。该试剂盒能快速、灵敏、准确地检测到病原,并可直接从患病鱼组织中检测到病毒病原。大大简化了检测程序,提高了检测水平,同时为病害防治策略的制定提供了技术依据。
[0029] 通过对鲤疱疹病毒2型的特异性检测,经过外引物CyHV-2P1F和CyHV-2P1R,以及内引物CyHV-2P2F和CyHV-2P2R对目标病毒进行两轮PCR扩增,获得357bp的单一PCR产物,可以特异的检测目标病毒。但是对于锦鲤疱疹病毒(KHV)、大鲵虹彩病毒(GSIV)、斑点叉尾鮰病毒(CCV)、鳗鱼疱疹病毒(HVA)等4种DNA病毒,均无扩增产物。
[0030] 通过灵敏度的检测,对克隆有目的基因的T载体进行常规PCR和巢式PCR检测比3
较,发现常规PCR扩增的最低检测限为10 个拷贝,而巢式PCR最低检测限为10个拷贝。

附图说明

[0031] 图1为一种鲤疱疹病毒2型的巢式PCR检测试剂盒的示意图。
[0032] 其中1为盒体,2为衬垫,3为10×反应缓冲液,4为Taq酶,5为引物P1,6为引物P2,7为纯水,8为阳性DNA。
[0033] 图2是发明实施例患病鱼的CyHV-2检测结果示意图。
[0034] 其中M为Takara DL1000DNA Marker,1~5为检测样本,6为阳性对照,7为阴性对照。

具体实施方式

[0035] 以下结合实施例对本发明的原理与特征进行描述,所举实施例只用于解释本发明,并非用于限定本发明的范围。
[0036] 实施例1:
[0037] 一种鲤疱疹病毒2型的巢式PCR检测试剂盒,包括盒体(1),盒内衬垫(2)上放置6个盛有试剂的1.5mL离心管,包括10×反应缓冲液(3),Taq酶(1U/μL)(4),引物P1(包含CyHV-2P1F、CyHV-2P1R各10μM)(5),引物P2(包含CyHV-2P2F、CyHV-2P2R各10μM)(6),纯水(分子生物学级)(7),阳性DNA(10μg/mL)(8)。
[0038] 所述的10×反应缓冲液的配方为:Tris-HCl 100mM,KCl 500mM,MgCl215mM,dNTPs2mM。
[0039] 所述的Tris-HCl为三羟甲基氨基甲烷盐酸盐;KCl为氯化钾;MgCl2为氯化镁;dNTPs为合成DNA所需的四种脱氧核苷酸的等体积混合液。
[0040] 上述各种液体试剂分别装在1.5mL离心管中,置于盒内。
[0041] 所述的引物核苷酸序列为:
[0042] CyHV-2P1F为:TGAAATGTCAAAAGTGGATGG
[0043] CyHV-2P1R为:TATTCCCAGACAGCCTTCAAA
[0044] CyHV-2P2F为:GAACACCGCTGCTCATCATC
[0045] CyHV-2P2R为:ACTCTTCGCAAGTCCTCACC
[0046] 实施例2:
[0047] 一种鲤疱疹病毒2型的巢式PCR检测试剂盒,包括盒体1,盒内衬垫2上放置6个盛有试剂的1.5mL离心管,包括10×反应缓冲液3,Taq酶(1U/μL)4,引物P1(包含CyHV-2P1F、CyHV-2P1R各10μM)5,引物P2(包含CyHV-2P2F、CyHV-2P2R各10μM)6,纯水(分子生物学级)7,阳性DNA(10μg/mL)8。
[0048] 所述的10×反应缓冲液的配方为:Tris-HCl 100mM,KCl 500mM,MgCl215mM,dNTPs2mM。
[0049] 所述的Tris-HCl为三羟甲基氨基甲烷盐酸盐;KCl为氯化钾;MgCl2为氯化镁;dNTPs为合成DNA所需的四种脱氧核苷酸的等体积混合液。
[0050] 所述试剂盒的使用方法,包括以下步骤:
[0051] 1)检测前检测样本DNA的提取:取适量濒死的患病鱼鰓丝、脾脏、肾脏组织,用玻璃匀浆器匀浆,5000rpm于4℃离心10分钟,取适量匀浆上清液用DNA提取试剂提取DNA。
[0052] 2)外引物P1的PCR扩增:制备PCR反应体系20μL:10×PCR反应缓冲液2μL,Taq酶(1U/μL)1μL,外引物P10.5μL,DNA模板4μL,纯水补足至20μL。同时取阳性对照DNA模板做阳性对照,取纯水做阴性对照。PCR反应条件为:94℃预变性5分钟,94℃变性30秒,55℃退火30秒,72℃延伸40秒,30个循环后72℃5分钟。
[0053] 3)内引物P2的PCR扩增:取1μL外引物P1的扩增产物作为模板,以内引物P2为引物进行PCR扩增,其他反应成分和反应条件同第一次扩增。
[0054] 4)扩增产物检测与分析:1~2%(W/V)琼脂糖凝胶电泳检测目的条带并成像分析。
[0055] 5)结果判定:
[0056] E.当检测样本和阳性对照的扩增条带大小一致,为357bp时,结果为阳性;
[0057] F.当检测样本无条带或条带大小与阳性对照的扩增条带大小不一致,不为357bp时,结果为阴性;
[0058] G.当阳性对照无条带时,表明试剂盒中相关试剂降解,试剂盒失效;
[0059] H.当阴性对照出现条带时,操作过程中有试剂污染,检测结果无效。
[0060] 实施例3:
[0061] 对5个自然感染的患病鱼组织样本的检测:
[0062] 随机抽取患典型病症的鲫鱼,取适量鰓组织于玻璃匀浆器匀浆,取匀浆上清液0.25mL用DNAzol提取病毒DNA模板,用试剂盒中的试剂进行巢式PCR检测。检测结果用
1%(W/V)琼脂糖凝胶电泳及成像系统分析。结果表明(附图2),所检测的5个鲫鱼样本均为CyHV-2阳性,此结果和电镜超薄切片观察结果完全一致。
[0063] 以上所述仅为本发明的较佳实施例,并不用以限制本实施,凡在本发明的精神和原则之内,所作的任何修改、等同替换、改进等,均应包含在本发明的保护范围之内。