一种RNA及其在心血管系统疾病中的应用转让专利

申请号 : CN201310027785.7

文献号 : CN103114087B

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相似专利:

发明人 : 李子健张幼怡邢瑞杨承志吕志珍

申请人 : 北京大学第三医院

摘要 :

本发明公开了一种RNA及其在心血管系统疾病中的应用。本发明提供的一种RNA,一种RNA,其核苷酸序列为序列表中序列3。还提供了编码上述RNA的基因。所述RNA的基因的核苷酸序列为序列表中序列4。本发明的实验证明,本发明发现经异丙肾上腺素(ISO)诱导,在乳大鼠心肌成纤维细胞中应用RNAi方法knock down HIP-55明显促进心脏成纤维细胞增殖;而在Knock-down HIP-55心肌成纤维细胞中能够增强ISO诱导的P38MAPK的激活以及激酶活性;发现HIP-55是一种新的对心脏纤维化具有保护作用的蛋白质,为临床诊断、治疗及新药开发提供了新的靶点。

权利要求 :

1.一种RNA,其核苷酸序列为序列表中序列3。

2.编码权利要求1所述RNA的基因。

3.根据权利要求2所述的基因,其特征在于:所述RNA的基因的核苷酸序列为序列表中序列4。

4.含有权利要求2或3所述基因的重组载体、转基因细胞系或重组腺病毒。

5.根据权利要求4所述的载体,其特征在于:所述重组载体为重组腺病毒载体;

所述重组腺病毒载体具体为将编码权利要求2或3所述的基因插入pAd/PL-Dest中得到的载体。

6.HIP-55蛋白抑制剂在制备具有如下1)和/或2)功能的产品中的应用:

1)促进心脏成纤维细胞增殖;

2)提高P38MAPK激酶活性;

所述HIP-55蛋白的氨基酸序列为序列表中的序列2;

所述HIP-55蛋白抑制剂为权利要求1所述RNA、权利要求2或3所述基因或权利要求

4或5所述的重组载体或权利要求4所述的转基因细胞系或重组腺病毒。

7.根据权利要求6所述的应用,其特征在于:所述产品为药物。

8.根据权利要求6或7所述的应用,其特征在于:所述心脏成纤维细胞为离体心脏成纤维细胞。

说明书 :

一种RNA及其在心血管系统疾病中的应用

技术领域

[0001] 本发明涉及生物技术领域,尤其涉及一种RNA及其在心血管系统疾病中的应用。

背景技术

[0002] HIP-55(hematopoietic progenitor kinase 1[HPK1]-interacting protein of55 kDa;也称为drebrin-like protein、mAbp1或SH3P7)是一个包含多功能域的蛋白质。
其结构主要包含着N端的F-actin蛋白结合结构域和C端SH3结构域。HIP-55参与突触发生、受体内吞、骨架重排及信号转导。目前对HIP-55功能了解较少尚无对HIP-55在心血管系统方面的研究报道。
[0003] 心血管疾病是中国居民健康的“头号杀手”,每年主要用于心血管病的直接医疗费用已达1300亿元人民币。心肌纤维化是心脏重塑的重要病理改变,是指在心肌的正常组织结构中心肌成纤维细胞过度分裂,胶原纤维过量积聚、心脏组织中胶原浓度显著升高或胶原成分发生改变,引起心肌僵硬度增加、舒缩功能受限,严重影响心脏的功能。这种病理变化在多种心血管疾病中存在,与心律失常、心功能障碍甚至心脏性猝死密切相关。心肌纤维化是心功能由代偿期向失代偿期转变的关键,其严重程度和疾病的发生发展及预后密切相关。因此,预防和逆转心肌纤维化具有重要的意义。大量研究表明儿茶酚胺-肾上腺素系统过度激活是促心肌纤维化的重要因素,儿茶酚胺(如异丙肾上腺素isoproteronol,Iso)通过β-ARs促进心肌成纤维细胞增殖和胶原合成增加,从而导致心肌纤维化、心脏功能的恶化和心衰的形成。同时β-ARs阻滞剂能够显著改善患者的预后。

发明内容

[0004] 本发明的目的是提供一种RNA及其在心血管系统疾病中的应用。
[0005] 本发明提供的RNA,其核苷酸序列为序列表中序列3。
[0006] 编码上述RNA的基因也是本发明保护的范围。
[0007] 上述RNA的基因的核苷酸序列为序列表中序列4。
[0008] 含有上述基因的重组载体、转基因细胞系或重组腺病毒也是本发明保护的范围。
[0009] 上述重组载体为重组腺病毒载体;所述重组腺病毒载体具体为将上述的基因导入腺病毒载体中,得到表达RNA的重组腺病毒载体。
[0010] 上述腺病毒载体为pAd/PL-Dest,上述重组腺病毒载体具体为将编码上述RNA的基因(序列4)插入pAd/PL-Dest中得到的载体,将该质粒命名为shpAd-HIP-55[0011] HIP-55蛋白抑制剂在制备具有如下1)和/或2)功能的产品中的应用也是本发明保护的范围:
[0012] 1)促进心脏成纤维细胞增殖;
[0013] 2)提高P38MAPK激酶活性;
[0014] 所述HIP-55蛋白的氨基酸序列为序列表中的序列2。
[0015] 上述促进心脏成纤维细胞增殖具体通过如下1)或2)体现:
[0016] 1)在ISO诱导下增加心脏成纤维细胞Brdu参入量;
[0017] 2)在ISO诱导增加心脏成纤维细胞CCK8吸光值。
[0018] 上述提高P38MAPK激酶(为两种亚型,其氨基酸序列为序列表中的序列8或序列9)活性通过提高P38MAPK激酶底物ATF-2的磷酸化水平。
[0019] 上述应用中,所述HIP-55蛋白抑制剂为上述RNA、上述基因或上述重组载体、转基因细胞系或重组腺病毒。
[0020] 上述应用中,所述产品为药物。
[0021] 上述应用中,所述心脏成纤维细胞为离体心脏成纤维细胞。
[0022] HIP-55蛋白在筛选、开发和/或设计具有如下1)和/或2)功能的产品中的应用也是本发明保护的范围:1)抑制心脏成纤维细胞增殖;2)抑制P38MAPK激酶活性;所述HIP-55蛋白的氨基酸序列为序列表中的序列2。
[0023] 本发明的实验证明,本发明发现经异丙肾上腺素(ISO)诱导,在乳大鼠心肌成纤维细胞中过表达HIP-55明显抑制心脏成纤维细胞增殖,与之相反,应用RNAi方法knock down HIP-55明显促进心脏成纤维细胞增殖;在过表达HIP-55心脏成纤维细胞中能够抑制ISO诱导的P38MAPK的激活以及激酶活性,而在Knock-down HIP-55心肌成纤维细胞中能够增强ISO诱导的P38MAPK的激活以及激酶活性;发现HIP-55是一种新的对心脏纤维化具有保护作用的蛋白质,为临床诊断、治疗及新药开发提供了新的靶点。

附图说明

[0024] 图1为过表达HIP-55蛋白质表达水平的检测
[0025] A为携带Dserd-HIP-55基因腺病毒及携带Dserd基因的对照腺病毒转染效率的检测;B为过表达HIP-55蛋白质表达水平的检测
[0026] 图2为HIP-55shRNA敲减HIP-55蛋白质表达水平的检测
[0027] 图3为HIP-55抑制心肌成纤维细胞增殖(Brdu法)
[0028] A为过表达HIP-55抑制心肌成纤维细胞增殖;B为敲减HIP-55促进心肌成纤维细胞增殖
[0029] 图4为HIP-55抑制心肌成纤维细胞增殖(CCK8法)
[0030] A为过表达HIP-55抑制心肌成纤维细胞增殖;B为敲减HIP-55促进心肌成纤维细胞增殖
[0031] 图5为ISO通过p38MAPK诱导的心脏成纤维细胞增殖
[0032] 图6为HIP-55抑制心脏成纤维细胞P38MAPK激酶活性
[0033] A和B为过表达HIP-55抑制心肌成纤维细胞P38MAPK激酶活性;C和D为敲减HIP-55增强心肌成纤维细胞P38MAPK激酶活性。

具体实施方式

[0034] 下述实施例中所使用的实验方法如无特殊说明,均为常规方法。
[0035] 下述实施例中所用的材料、试剂等,如无特殊说明,均可从商业途径得到。
[0036] 下述实施例中定量试验均重复三次,结果取平均值。
[0037] 鼠HIP-55蛋白的氨基酸序列为序列表中的序列2,编码该蛋白的基因的核苷酸序列为序列表中的序列1。
[0038] 下述实施例采用的离体乳大鼠心脏成纤维细胞通过如下方法获得:
[0039] 实验用SD乳大鼠购自北京大学医学部实验动物部,完全遵照北京大学医学部实验动物相关伦理学标准;采用酶消化和差速贴壁方法进行分离培养;细胞在含有10%胎牛血清(Biochrom AG,Berlin,Germany)的高糖DMEM(Hyclone,Logan,UT)培养基里,其中添加100μg/ml链霉素及100U/ml青霉素,置于37℃的5%CO2孵箱里培养,具体如下:
[0040] 出生1-3天内的SD乳大鼠,浸没于75%酒精;眼科剪开胸取心脏;置于冰冷的Hank’s缓冲液中剪除心房部分并洗涤两次。转移到10ml血清瓶中,剪碎组织后Hank’s缓冲液再洗涤两次。弃去上清;加入4mL0.1%胰蛋白酶置于37℃水浴中平缓搅动消化,每次4min,弃去前两次细胞悬液。继续进行6-8次消化,收集细胞悬液,加入含4mLDMEM完全培养基(含10%胎牛血清)的离心管中,1000rpm×5min离心,取4mL DMEM完全培养基洗涤细胞沉淀,再次重悬离心。最后合并收集细胞,接种于10cm培养皿,37℃、5%CO2培养箱静置培养2小时。吸取未贴壁的心肌细胞悬液,已贴壁的成纤维细胞用DMEM洗涤后,加入DMEM完全培养基进行培养。长满后传代,实验选用第二代离体心脏成纤维细胞。
[0041] 下面实施例采用的抗体如下:Anti-EIF5(Santa cruz公司;货号:c-282)、Anti-P38MAPK(santa cruz 公 司;货 号:sc-7194)、Anti-phospho-P38MAPK(cell signaling;货号:#9211s)。
[0042] 实施例1、HIP-55shRNA、过表达HIP-55的重组腺病毒和RNA干扰HIP-55表达的重组腺病毒的获得
[0043] 一、HIP-55shRNA的获得
[0044] 针对鼠HIP-55蛋白编码基因设计并合成如下HIP-55shRNA和对照Control shRNA如表1所示:
[0045] HIP-55shRNA,其核苷酸序列为序列表中序列3,其编码基因的核苷酸序列为序列表中序列4;
[0046] 设计Control shRNA:其核苷酸序列为序列表中序列5,其编码基因的核苷酸序列为序列表中序列6;
[0047] 表1为shRNA及其对照序列
[0048]
[0049] 二、过表达HIP-55重组腺病毒的构建及制备
[0050] 1、过表达HIP-55重组腺病毒载体的构建
[0051] 利用重叠延伸PCR扩增attB1-HIP-55-Flag-IRES/DesRed-attB2
[0052] 利用重叠PCR扩增:以序列表中序列1所示的HIP-55核苷酸为模板,使用引物attB1-HIP-55和HIP-55-Flag-IRES-R(序列见表2)进行PCR扩增;以IRES/DesRed为模板,使用引物Flag-IRES-F和DesRedE2-attB2(序列见表2)进行PCR扩增;分别回收两个PCR产物;再以两个PCR产物为模板,用引物:attB1-HIP-55和DesRedE2-attB2进行融合PCR,得到2656bp的PCR产物(该PCR产物的核苷酸序列为序列表中的序列7,序列表中序列7自5’末端第36-1334位核苷酸为序列1自5’末端第1-1299位核苷酸),命名为attB1-HIP-55-Flag-IRES/DesRed-attB2。
[0053] 表2为重叠PCR扩增引物
[0054]引物名称 oligo序列5’to3’
attB1-HIP-55 GGGGACAAGTTTGTACAAAAAAGCAGGCTGCCACCATGGCGGTGAACCTGAGCHIP-55-Flag-R CTACTTGTCATCGTCGTCCTTGTAGTCCTCTATGAGCTCCACATAGT
Flag-IRES-F ACGACGATGACAAGTAGGCCCCTCTCCCTCCCCC
DesRedE2-attB2 GGGGACCACTTTGTACAAGAAAGCTGGGTCTACTGGAACAGGTGGTGGC
[0055] 重叠PCR扩增反应体系及扩增程序如下:反应体系:
[0056]
[0057] 扩增程序:
[0058]
[0059] 6×loading buffer终止反应;
[0060] 将 上 述 2665bp 的 PCR 产 物 利 用 Gateway clone 构 建 重 组 载 体pDown-HIP-55-Flag-IRES/DesRedE2,具体如下:
[0061] 25℃,BP反应3h。
[0062] 反应体系:
[0063]
[0064] 加入蛋白酶K终止反应10min,得到BP反应产物,将BP反应产物转化到大肠杆菌Stbl3中,挑取单克隆摇菌并提取质粒,质粒为将attB1-HIP-55-Flag-IRES/DesRed-attB2(序列7)插入pDONR221中得到的中间载体,命名为pDown-HIP-55-Flag-IRES/DesRedE2。
[0065] 利用Gateway clone构建pAd-HIP-55-Flag-IRES/DesRedE2,具体如下:
[0066] 将中间载体pDown-HIP-55-Flag-IRES/DesRedE2和母载体质粒pAd/CMV/V5-DEST进行LR反应,体系如下:
[0067]
[0068] 25℃,LR反应3h,加入蛋白酶K终止反应10min,得到LR反应产物,将LR反应产物转化到大肠杆菌Stbl3中,挑取单克隆摇菌并提取质粒,质粒为将attB1-HIP-55-Flag-IRES/DesRed-attB2编码基因(序列7)插入pAd/CMV/V5-DEST中,得到腺病毒表达载体,命名为pAd-HIP-55-Flag-IRES/DesRedE2。
[0069] 2、对照病毒腺病毒表达载体pAd-CMV>flag/IRES/DsRed Express2的构建[0070] pAd-CMV>flag/IRES/DsRed Express2为将Flag-IRES/DesRedE2(序列表中序列7自5’末端第1335-2627位核苷酸)构建到pAd/CMV/V5-DEST中得到的载体;
[0071] 1)利用引物flag+DsRed-F和attB2+DsRed为引物(序列见表3),序列表中序列7自5’末端第1335-2627位核苷酸所示的DNA分子为模板PCR扩增获得1293bpflag-IRES-DsRed Express2片段;
[0072] 2)利用引物attB1-K-Flag和attB2+DsRed为引物,flag-IRES-DsRed Express2片段为模板PCR扩增获得1357bpattB1-flag-IRES-DsRed Express2-attB2片段。
[0073] 3)BP反应
[0074] 采用上述1的方法,将attB1-flag-IRES-DsRed Express2-attB2片段通过BP反应插入pDONR221载体中,构建pDown-flag/IRES/DsRed Express2;
[0075] 4)LR反应
[0076] 采用上述1的方法,将attB1-flag-IRES-DsRed Express2-attB2片段通过LR反应插入pAd/CMV/V5-DEST载体中得到pAd-CMV>flag/IRES/DsRed Express2。
[0077] 表3为引物序列
[0078]
[0079] 4、过表达HIP-55重组腺病毒的获得
[0080] 将上述获得的过表达HIP-55重组腺病毒载体pAd-HIP-55-Flag-IRES/DesRedE2转入HEK293A细胞(美国ATCC,产品目录号CRL-1573TM),包装得到过表达HIP-55重组腺病毒(命名简称:Dsred-HIP55)。
[0081] 将上述获得的空腺病毒载体pAd-CMV>Flag/IRES/DsRed Express2转染HEK293A细胞,包装得到pAd-CMV>Flag/IRES/DsRed Express2腺病毒(命名简称:Dsred)。
[0082] 5、验证
[0083] 1)转染
[0084] 将上述步骤4制备5×106pfu过表达HIP-55重组腺病毒(Dsred-HIP55)和5×106pfu pAd-CMV>Flag/IRES/DsRed Express2腺病毒(Dsred)转染离体心脏成纤维细胞,得到感染过表达HIP-55重组腺病毒的细胞和感染pAd-CMV>Flag/IRES/DsRedExpress2腺病毒细胞。
[0085] 2)倒置荧光显微镜观察转染效率
[0086] 应用倒置荧光显微镜选用绿色激发块(激发红色荧光)观察转染效率,结果如图1的A所示,过表达Dsred-HIP-55病毒及Dsred病毒转染效率达到95%以上。
[0087] 3)Western blot验证
[0088] A、心脏成纤维细胞蛋白提取
[0089] 分别收获感染过表达HIP-55重组腺病毒(Dsred-HIP55)的细胞、感染pAd-CMV>Flag/IRES/DsRed Express2腺病毒(Dsred)细胞和离体心脏成纤维细胞,冷PBS洗细胞二次(样本欲检测磷酸化AMPK时则不洗,直接加裂解液),60mm培养皿中加入100μl细胞裂解液(20mmol/L Tris-HCl PH7.4,150mmol/L NaCl,2.5mmol/LEDTA,50mmol/L NaF,0.1mmol/L Na4P2O7,1mmol/L Na3VO4,1%Triton X-100,10%glycerol,0.1%SDS,1%deoxycholic acid,1mmol/L PMSF,and1μg/ml aprotinin)裂解细胞10分钟,用细胞刮刮下并移入Ep管中,超声处理后于4℃,12,000g离心15min,所得上清液冻存于-70℃。蛋白定量采用BCA方法,所得上清液冻存于-70,得到感染过表达HIP-55重组腺病毒(Dsred-HIP55)的细胞蛋白、感染pAd-CMV>Flag/IRES/DsRed Express2腺病毒(Dsred)细胞蛋白和离体心脏成纤维细胞蛋白。
[0090] B、Western blot
[0091] 将上述A得到的感染过表达HIP-55重组腺病毒(简称:Dsred-HIP55)细胞蛋白、感染pAd.-CMV>Flag/IRES/DsRed Express2腺病毒(简称:Dsred)细胞蛋白和离体心脏成纤维细胞蛋白进行Western blot检测,一抗为Anti-HIP-55(BD公司;货号:612614,稀释度1:1000),二抗为辣根过氧化物酶标记(中杉金桥公司,货号ZB-2305,稀释度1:4000)。
[0092] 结果如图1B所示,与感染pAd.-CMV>Flag/IRES/DsRed Express2腺病毒(Dsred)细胞相比,感染过表达HIP-55重组腺病毒(Dsred-HIP55)的细胞内的HIP-55蛋白有强表达。
[0093] 感染pAd-CMV>Flag/IRES/DsRed Express2腺病毒(Dsred)细胞和离体心脏成纤维细胞结果无显著差异。
[0094] 三、shRNA干扰HIP-55表达的重组腺病毒
[0095] 1、shRNA干扰HIP-55表达的重组腺病毒载体的构建
[0096] shRNA的扩增引物为shHIP-55-F和shHIP-55-R;
[0097] 对照shRNA的扩增引物为Control-F和Control-R;
[0098] 表4为shRNA相关引物序列
[0099]oligo名称 oligo序列5’to3’
shHIP-55-F TCTTTGGCATGTTTCCTGCCAACTCGAGTTGGCAGGAAACATGCCAAAGTTTTTCshHIP-55-R TCGAGAAAAACTTTGGCATGTTTCCTGCCAACTCGAGTTGGCAGGAAACATGCCAAAGAControl-F TGCGCGCTTTGTAGGATTCGCTCGAGCGAATCCTACAAAGCGCGCTTTTTC
Control-R TCGAGAAAAAGCGCGCTTTGTAGGATTCGCTCGAGCGAATCCTACAAAGCGCGCA[0100] shpDwon-HIP-55的构建Oligo DNA的退火
[0101] a)把待退火DNA oligo用DEPC处理的水配置成50μM,溶解Annealing Buffer for DNA Oligos(5×),混匀备用。
[0102] b)设置反应体系:
[0103]
[0104] 设置PCR仪进行退火反应:
[0105] 95℃ 2min
[0106] 每8s下降0.1℃,降至25℃ 约90min
[0107] 4℃ 长时间保存
[0108] 退火产物-20℃保存,得到退火的shHIP-55Oligo DNA(核苷酸序列为序列4,)。
[0109] (2)、酶切载体shpDown-MCS
[0110] a)酶切体系:
[0111]
[0112] b)37℃酶切3h。
[0113] c)6×loading buffer终止反应,1%的琼脂糖凝胶电泳并切胶回收约3043bp的载体片段。
[0114] 3)连接
[0115] a)连接体系:
[0116]
[0117]
[0118] b)16℃连接过夜,将连接产物转化stb13感受态细菌,菌落PCR筛选阳性重组子。
[0119] PCR鉴定引物:
[0120] shpDown-flank-f:AGCTACATTTTACATGATAGGCTT
[0121] shpDown-flank-r:AGCGAGCTTATCGATACCGT
[0122] 得到234bp的为阳性重组子;提取质粒送去测序,测序引物:shpDown-flank-f:AGCTACATTTTACATGATAGGCTT,结果该质粒为将shRNA HIP-55(Rat)的编码基因(退火的shHIP-55Oligo DNA)插入shpDown-MCS中得到的载体,命名为shpDwon-HIP-55。
[0123] 2)shRNA干扰HIP-55表达重组腺病毒载体shpAd-HIP-55
[0124] 利用Gateway Technology构建shpAd-HIP-55,具体如下:
[0125] LR反应体系:
[0126]
[0127] 加入0.5ul蛋白酶K于37℃终止反应10min,得到LR反应产物。
[0128] 将LR反应产物转化到大肠杆菌Stbl3中,挑取挑取单克隆摇菌小量提取质粒,送去测序,测序引物:pAd/PL-flank-f:GGCCGCTAGCGACATCGATC和pAd/PL-flank-r:CCTTAAGCCACGCCCACAC,结果为该质粒为将shRNA HIP-55(Rat)的编码基因(退火的shHIP-55Oligo DNA)插入pAd/PL-Dest中得到的载体,将该质粒命名为shpAd-HIP-55。
[0129] 2、shRNA干扰HIP-55表达的重组腺病毒的获得
[0130] 将上述获得的shRNA干扰HIP-55表达重组腺病毒载体shpAd-HIP-55转入HEK293A细胞,包装得到shRNA干扰HIP-55表达重组腺病毒(简称KD1)。
[0131] 3、对照shRNA干扰重组腺病毒
[0132] 1)对照shRNA干扰重组腺病毒载体shpDown-Scramble的构建
[0133] (1)Oligo DNA的退火
[0134] a)把待退火DNA oligo用DEPC处理的水配置成50μM,溶解Annealing Buffer for DNA Oligos(5×),混匀备用。
[0135] b)设置反应体系:
[0136]
[0137]
[0138] c)退火产物-20℃保存,得到和退火Control Oligo DNA(核苷酸序列为序列6,)。
[0139] (2)酶切载体shpDown-MCS
[0140] a)酶切体系:
[0141]
[0142] b)37℃酶切3h;
[0143] d)6×loading buffer终止反应,1%的琼脂糖凝胶电泳并切胶回收3kb的载体片段。
[0144] 3)连接
[0145] a)连接体系:
[0146]
[0147] b)16℃连接过夜,将连接产物转化stb13感受态细菌,菌落PCR筛选阳性重组子。
[0148] PCR鉴定引物:
[0149] shpDown-flank-f:AGCTACATTTTACATGATAGGCTT
[0150] shpDown-flank-r:AGCGAGCTTATCGATACCGT
[0151] 得到230bp的为阳性重组子;提取质粒送去测序,测序引物:shpDown-flank-f:AGCTACATTTTACATGATAGGCTT,结果该质粒为将Control shRNA编码基因(退火Control Oligo DNA)插入shpDown-MCS中得到的载体,命名为shpDown-Scramble。
[0152] 2)Scramble干扰HIP-55表达重组腺病毒载体shpAd-Scramble
[0153] 利用Gateway Technology构建shpAd-Scramble,具体如下:
[0154] LR反应体系:
[0155]
[0156] 加入0.5ul蛋白酶K于37℃终止反应10min,得到LR反应产物。
[0157] 将LR反应产物转化到大肠杆菌Stbl3中,挑取挑取单克隆摇菌小量提取质粒,送去测序,测序引物:pAd/PL-flank-f:GGCCGCTAGCGACATCGATC和pAd/PL-flank-r:CCTTAAGCCACGCCCACAC,结果为该质粒为将Control shRNA编码基因(退火Control Oligo DNA)插入pAd/PL-Dest中得到的载体,将该质粒命名为shpAd-Scramble。
[0158] 3)、对照shRNA干扰重组腺病毒
[0159] 将上述步骤2)得到的获得的对照shRNA干扰重组腺病毒载体shpAd-Scramble转入HEK293A细胞,包装得到对照shRNA干扰重组腺病毒(简称scramble)。
[0160] 4、验证
[0161] 1)转染
[0162] 将上述步骤2制备shRNA干扰HIP-55表达重组腺病毒(KD1)和步骤3制备对照shRNA干扰重组腺病毒(scramble)、pAd/PL-Dest腺病毒(将空载体pAd/PL-Dest转入HEK293A细胞,包装得到的腺病毒)转染离体心脏成纤维细胞,得到shRNA干扰HIP-55表达重组腺病毒的细胞、感染对照shRNA干扰重组腺病毒细胞和感染pAd/PL-Dest腺病毒细胞。
[0163] 2)转录水平验证
[0164] 将上述shRNA干扰HIP-55表达重组腺病毒(KD1)细胞和感染对照shRNA干扰重组腺病毒(scramble)细胞分别提取RNA,反转录得到cDNA作为模板,用表5中的HIP-55)F和HIP-55)R为引物进行RT-PCR扩增。以感染pAd/PL-Dest腺病毒细胞和正常的离体心脏成纤维细胞为对照。
[0165] 表5为引物序列
[0166]引物名称 引物序列
HIP-55)F TGCGAAAAGGAGCATGTGCCAA
HIP-55)R GGCAACCTTCTCCATGATGCAC
内参GAPDH Forward CCTTCCGTGTTCCTACCC
内参GAPDH Reverse CCTTCCGTGTTCCTACCC
[0167] 结果如表6所示,可以看出,与感染对照shRNA干扰重组腺病毒(scramble)细胞相比,shRNA干扰HIP-55表达重组腺病毒(KD1)的细胞中的HIP-55表达受到抑制;表明HIP-55shRNA在成纤维细胞中敲减HIP-55。
[0168] 感染对照shRNA干扰重组腺病毒(scramble)细胞、感染pAd/PL-Dest腺病毒细胞和正常的离体心脏成纤维细胞结果无显著差异。
[0169] 表6为RT-PCR鉴定HIP-55shRNA干扰率
[0170]
[0171] 3)Western blot验证
[0172] A、心脏成纤维细胞蛋白提取
[0173] 分别收获感染shRNA干扰HIP-55表达重组腺病毒(KD1)的细胞、感染对照shRNA干扰重组腺病毒(scramble)细胞细胞、感染pAd/PL-Dest腺病毒细胞和离体心脏成纤维细胞,冷PBS洗细胞二次(样本欲检测磷酸化AMPK时则不洗,直接加裂解液),60mm培养皿中加入100μl细胞裂解液(20mmol/L Tris-HCl PH7.4,150mmol/L NaCl,2.5mmol/L EDTA,50mmol/L NaF,0.1mmol/L Na4P2O7,1mmol/L Na3VO4,1%Triton X-100,10%glycerol,0.1%SDS,1%deoxycholic acid,1mmol/L PMSF,and1μg/mlaprotinin)裂解细胞10分钟,用细胞刮刮下并移入Ep管中,超声处理后于4℃,12,000g离心15min,所得上清液冻存于-70℃。蛋白定量采用BCA方法,所得上清液冻存于-70,得到感染shRNA干扰HIP-55表达重组腺病毒(KD1)的细胞蛋白、感染对照shRNA干扰重组腺病毒(scramble)细胞蛋白、感染pAd/PL-Dest腺病毒细胞蛋白和离体心脏成纤维细胞蛋白。
[0174] B、Western blot
[0175] 将上述A得到的感染shRNA干扰HIP-55表达重组腺病毒(KD1)的细胞蛋白、感染对照shRNA干扰重组腺病毒(scramble)细胞蛋白、感染pAd/PL-Dest腺病毒细胞蛋白和离体心脏成纤维细胞蛋白进行Western blot检测,一抗为Anti-HIP-55(BD公司;货号:612614)、Anti-GAPDH(santa cruz公司;货号:sc-32233)(稀释度均1:1000),二抗为辣根过氧化物酶标记(中杉金桥公司,货号ZB-2305)(稀释度1:4000)。
[0176] 结果如图2所示,上图为电泳图,下图为定量统计结果;与感染对照shRNA干扰重组腺病毒(scramble)细胞相比,感染shRNA干扰HIP-55表达重组腺病毒(KD1)的细胞内的HIP-55蛋白表达明显减低,降低率在70%。感染对照shRNA干扰重组腺病毒(scramble)细胞、感染pAd/PL-Dest腺病毒细胞和正常的离体心脏成纤维细胞结果无显著差异。
[0177] 进一步表明HIP-55shRNA在心脏成纤维细胞中敲减HIP-55。
[0178] 实施例2、HIP-55的功能研究
[0179] 1、HIP-55与心脏成纤维细胞增殖的影响
[0180] 1)Brdu ELISA检测4
[0181] 将离体心脏成纤维细胞传代种于96孔板,细胞密度为3.5*10个/mL,100μl/孔,待细胞融合度达到60~70%时,换用无血清培养,感染腺病毒;上述腺病毒分别为由实施例1制备得到的过表达HIP-55重组腺病毒(Dsred-HIP55)、Des1d腺病毒(Dsred)、shRNA干扰HIP-55表达重组腺病毒(KD1)、对照shRNA干扰重组腺病毒(scramble)、pAd/PL-Dest腺-5病毒。培养24小时后,再给异丙肾上腺素(ISO,终浓度为10 mol/L)处理24小时后收样。
收样前6小时,掺入BrdU10μl/孔(终浓度10μmol/L)。收样时弃上清,拍干。
[0182] 使用Cell Proliferation ELISA,BrdU kit(Roche,Cat No.11647229001)测量BrdU掺入情况。具体步骤如下:加入200μl/孔Fix Denat室温(25℃)孵育30分钟;弃去,轻拍;加入100μl/孔anti-BrdU-POD工作液,室温孵育90分钟;弃去液体,加200μl/孔的洗涤液洗3次;拍干,加入100μl/孔底物溶液,室温孵育15分钟。加入25μl/孔2mol/L硫酸终止反应,在酶联免疫检测仪OD450nm波长测定吸光值。
[0183] HIP-55过表达结果表明HIP-55能够明显抑制心肌成纤维细胞增殖,如图3A所示:
[0184] 以感染Des1d腺病毒(Dsred)的细胞为对照,其BrdU参入量为1;经过ISO处理后的感染Des1d腺病毒(Dsred)细胞BrdU参入量为1.72;
[0185] 感染过表达HIP-55重组腺病毒(Dsred-HIP55)细胞BrdU参入量为0.84;经过ISO处理后的感染过表达HIP-55重组腺病毒(Dsred-HIP55)细胞BrdU参入量为1.36;
[0186] 可以看出,给予ISO刺激后能够明显诱导心脏成纤维细胞增殖(p<0.001),过表达HIP-55后能够明显抑制ISO诱导的心脏成纤维细胞增殖(p<0.05)。
[0187] HIP-55敲减结果进一步表明HIP-55能够明显促进心肌成纤维细胞增殖,结果如图3B所示:
[0188] 以感染对照shRNA干扰重组腺病毒(scramble)细胞为对照,其BrdU参入量为1;经过ISO处理后的感染对照shRNA干扰重组腺病毒(scramble)细胞BrdU参入量为1.41;
[0189] 感染shRNA干扰HIP-55表达重组腺病毒(KD1)细胞BrdU参入量为1.06;经过ISO处理后的感染shRNA干扰HIP-55表达重组腺病毒(KD1)细胞BrdU参入量为2.01;
[0190] 对照shRNA干扰重组腺病毒(scramble)和pAd/PL-Dest腺病毒结果无显著差异。
[0191] 以感染重组腺病毒(scramble)细胞为对照,给予ISO刺激后能够明显诱导心脏成纤维细胞增殖(p<0.001),敲减HIP-55后能够明显增强ISO诱导的心脏成纤维细胞增殖(p<0.01)。
[0192] 2)、Cell Counting Kit-8(CCK-8试剂盒)检测
[0193] 将离体心脏成纤维细胞传代种于96孔板,细胞密度为3.5×104个/mL,100μl/孔,待细胞融合度达到60~70%时,换用无血清培养,感染腺病毒;上述腺病毒为由实施例1制备得到的过表达HIP-55重组腺病毒(Dsred-HIP55)、Des1d腺病毒(Dsred)、shRNA干扰HIP-55表达重组腺病毒(KD1)、对照shRNA干扰重组腺病毒(scramble)和pAd/PL-Dest腺-5
病毒。培养24小时后,再给ISO(终浓度10 mol/L)处理24h后,每孔100μl不含血清培养液中加入CCK810μl,37°C,5%CO2培养箱静置培养2h。
[0194] 用CCK8细胞增殖试剂盒(dojindo公司(日本)货号ck04)检测增殖,在酶联免疫检测仪上490nm波长处测定光吸收值,用只加培养液的空白孔调零。
[0195] CCK8检测结果同样表明HIP-55过表达HIP-55能够明显抑制心肌成纤维细胞增殖,如图4A所示,
[0196] 以感染Des1d腺病毒(Dsred)的细胞为对照,CCK8吸光值为1;经过ISO处理后的感染Des1d腺病毒(Dsred)细胞CCK8吸光值为1.35;
[0197] 感染过表达HIP-55重组腺病毒(Dsred-HIP55)细胞CCK8吸光值为0.89;经过ISO处理后的感染过表达HIP-55重组腺病毒(Dsred-HIP55)细胞CCK8吸光值为1.16;
[0198] 可以看出,以感染腺病毒(Dsred)的细胞为对照,给予ISO刺激后能够明显诱导心脏成纤维细胞增殖(p<0.001),过表达HIP-55后能够明显抑制ISO诱导的心脏成纤维细胞增殖(p<0.05)。
[0199] HIP-55敲减结果进一步表明HIP-55能够明显促进心肌成纤维细胞增殖,结果如图4B所示:
[0200] 以感染对照shRNA干扰重组腺病毒(scramble)细胞为对照,其CCK8吸光值为1;经过ISO处理后的感染对照shRNA干扰重组腺病毒(scramble)细胞CCK8吸光值为1.45;
[0201] 感染shRNA干扰HIP-55表达重组腺病毒(KD1)细胞CCK8吸光值为1.24;经过ISO处理后的感染shRNA干扰HIP-55表达重组腺病毒(KD1)细胞CCK8吸光值为1.89;
[0202] 对照shRNA干扰重组腺病毒(scramble)和pAd/PL-Dest腺病毒结果无显著差异。
[0203] 以感染重组腺病毒(scramble)细胞为对照,给予ISO刺激后能够明显诱导心脏成纤维细胞增殖(p<0.001),敲减HIP-55后能够明显增强ISO诱导的心脏成纤维细胞增殖(p<0.01)。
[0204] 总之,上述Brdu ELISA和CCK8法检测细胞增殖结果表明,敲减HIP-55后心脏成纤维细胞的增殖明显增强。与之相反,过表达HIP-55后心脏成纤维细胞的增殖明显减弱。证明HIP-55能够明显抑制心脏成纤维细胞增殖。
[0205] 2、p38丝裂原活化蛋白激酶(p38MAPK)活性对心脏成纤维细胞增殖的影响[0206] 本实验采用p38MAPK选择性抑制剂SB202190(10μm)抑制p38MAPK激酶的活性,检测p38MAPK激酶的活性对ISO诱导的心脏成纤维细胞增殖的影响。
[0207] 方法按照上述1的1),将离体第二代心脏成纤维细胞传代种于96孔板,细胞密度4
为3.5*10个/mL,100μl/孔,待细胞融合度达到60~70%时,换用无血清培养24小时后,先给予P38抑制剂SB202190(10μM)孵育30min后,再给异丙肾上腺素(ISO,终浓度为-5
10 mol/L)处理24小时后收样。收样前6小时,掺入BrdU10μl/孔(终浓度10μmol/L),收样时弃上清,拍干。
[0208] 结果表明ISO能够明显诱导的心脏成纤维细胞增殖,p38MAPK选择性抑制剂SB202190能够明显抑制ISO诱导的心脏成纤维细胞增殖(图5)。说明ISO诱导心脏成纤维细胞增殖是通过激活p38MAPK活性引起的。
[0209] 3、HIP-55对心脏成纤维细胞P38MAPK激酶活性的影响
[0210] 1)心脏成纤维细胞体外P38MAPK激酶活性分析本实验采用非放射性P38MAPK激酶分析试剂盒检测体外P38MAPK激酶(为两种亚型,其氨基酸序列为序列表中的序列8或序列9)活性,试剂盒购自(cell signaling公司货号#9820);具体如下:
[0211] (1)配制1×lysis buffer;从-20℃取出10×lysis buffer,冰上融化;加入1mmol/l PMSF,用dd H2O配制;
[0212] (2)将细胞接种在100mm培养皿,加入终浓度为10μM ISO孵育培养10分钟;
[0213] (3)用上述lysis buffer裂解细胞,细胞裂解液离心收集上清液即为总蛋白;BCA法检测总蛋白含量;上清液-80℃冻存。
[0214] (4)每个样品取500μg总蛋白,用lysis buffer调整体积至600μl。
[0215] (7)分别加入磷酸化P38MAPK抗体小珠悬液20μl,4℃,旋转孵育过夜。
[0216] (8)4℃,14000g离心,30s,小心弃上清液。
[0217] (9)用500μl lysis buffer清洗小珠,共2次。
[0218] (10)用1×kinase buffer再洗2次。
[0219] (11)最后用50μl kinase buffer重悬。
[0220] (12)各样加入1μl ATP(200μmol/l)以及1μl ATF-2融合蛋白(ATF-2是P38MAPK激酶底物,p-ATF2水平代表了P38MAPK激酶活性)。
[0221] (13)30℃,孵育30min。
[0222] (14)加入25μl3×SDS上样缓冲液终止反应。
[0223] (15)混匀,14000g离心,30s。
[0224] (16)100℃,煮沸5min。-80℃冻存。
[0225] (17)用抗ATF-2磷酸化抗体(Thr76)进行western blot,样本离心后取体积25μl上清液上样,检测P38MAPK激酶活性。
[0226] 上述细胞为感染过表达HIP-55重组腺病毒(Dsred-HIP55)的细胞、感染pAd-CMV>Flag/IRES/DsRed Express2腺病毒(Dsred)的对照细胞、感染shRNA干扰HIP-55表达重组腺病毒(KD1)的细胞、感染对照shRNA干扰重组腺病毒(scramble)对照细胞、感染pAd/PL-Dest腺病毒细胞。
[0227] 结果如图6所示,其中,A为HIP-55过表达的结果;B为HIP-55过表达定量结果;C为HIP-55shRNA干扰结果;“-”号表示没有ISO诱导;“+”号表示10μM ISO诱导;D为HIP-55shRNA干扰定量结果;
[0228] 图6B中可以看出,以感染Des1d腺病毒(Dsred)的细胞为对照,p-ATF2相对表达量为1;经过ISO处理后的感染Des1d腺病毒(Dsred)细胞p-ATF2相对表达量为2.45;
[0229] 感染过表达HIP-55重组腺病毒(Dsred-HIP55)细胞p-ATF2相对表达量为1.03;经过ISO处理后的感染过表达HIP-55重组腺病毒(Dsred-HIP55)细胞p-ATF2相对表达量为1.63;
[0230] 图6D中可以看出,以感染对照shRNA干扰重组腺病毒(scramble)细胞为对照,p-ATF2相对表达量1;经过ISO处理后的感染对照shRNA干扰重组腺病毒(scramble)细胞p-ATF2相对表达量为1.57;
[0231] 感染shRNA干扰HIP-55表达重组腺病毒(KD1)细胞p-ATF2相对表达量为1.24;经过ISO处理后的感染shRNA干扰HIP-55表达重组腺病毒(KD1)细胞p-ATF2相对表达量为2.16;
[0232] 对照shRNA干扰重组腺病毒(scramble)和pAd/PL-Dest腺病毒结果无显著差异。
[0233] 从图6A/B和6C/D上可以看出,与感染pAd-CMV>Flag/IRES/DsRed Express2腺病毒(Dsred)的对照细胞相比,感染过表达HIP-55重组腺病毒(Dsred-HIP55)细胞的P38MAPK激酶底物ATF-2磷酸化(p-ATF2)水平明显减弱,说明抑制P38MAPK激酶活性。与之相反,与感染shRNA干扰重组腺病毒(scramble)对照细胞相比,感染shRNA干扰HIP-55表达重组腺病毒(KD1,敲减HIP-55)的ATF-2磷酸化(p-ATF-2)水平明显增强,说明促进P38MAPK激酶活性。
[0234] 以上结果表明,在心脏成纤维细胞中过表达HIP-55能够明显抑制P38MAPK激酶活性(以ATF2做为底物检测,其磷酸化水平反映P38MAPK激酶活性),相反,在心脏成纤维细胞中敲减HIP-55则明显增强P38MAPK激酶活性。因此,HIP-55在心脏成纤维细胞中抑制P38MAPK激酶活性。