一种基于SSR分子标记鉴别扁桃属植物种质的方法转让专利

申请号 : CN201510870315.6

文献号 : CN105512513B

文献日 :

基本信息:

PDF:

法律信息:

相似专利:

发明人 : 曾斌李疆田嘉夏江宏刘梦雯李伟阳刘楠楠

申请人 : 新疆农业大学

摘要 :

本发明涉及一种基于SSR分子标记鉴别扁桃属植物种质的方法,该方法通过选择多态性高的SSR引物,对55份扁桃属植物种质材料进行SSR-PCR扩增反应、电泳检测、统计分析。结果表明:使用筛选自核果类的100对SSR引物中的10对多态性强的引物,对扁桃属植物种质材料的基因组DNA进行SSR‑PCR扩增,共扩增出63条扩增条带,其中多态带60条,多态率为95.2%,获得了较好的扩增结果。通过进行相似系数和聚类分析,遗传相似系数为0.4133-0.9600,平均相似系数为0.6867;55份扁桃类植物种质间的遗传差异表明:不同种以及不同品种间的遗传距离不同,在相似系数小于0.68时,大多数栽培品种聚为一类,同一种源区的大多数栽培品种能聚类在一起。为进一步区分扁桃类植物种质资源亲缘关系远近提供了重要途径。

权利要求 :

1.一种基于SSR分子标记鉴别扁桃属植物种质的方法,其特征在于按下列步骤进行:准备扁桃属植物种质材料:

a、早春季,选取健壮、无病虫害的扁桃属植物55份样本的新鲜嫩叶,每份样本以液氮冷冻后放入温度-70℃超低温冰箱中保存备用;

扁桃属植物种质DNA的提取:

b、迅速加入1000μL,温度65℃预热的含2%十六烷基三甲基溴化铵,1.4M氯化钠,20mM四乙酸二氨基乙烯,100 mM三羟甲基氨基甲烷,pH8.0的缓冲液和8%巯基乙醇的缓冲液,轻轻摇匀;置于温度65℃水浴锅中温浴60 min,其间每隔10 min 轻轻上下晃动摇匀1次,使溶液充分裂解;采用台式离心机离心,温度21℃,转速10000 r/min,时间15 min,吸取上清液,将上清液平均分配转入另外两个新的1500μL离心管中,其中每个离心管中均含有480μL上清液;将每个含有上清液的离心管中加入等体积的氯仿:异戊醇=24:1,轻轻上下晃动摇匀,离心,温度21℃,转速10000 r/min,时间15 min,吸取上清液,将每个离心管中的上清液合并,转入另一个新的1500μL离心管中,离心管中含有600μL上清液;将装有600μL上清液的离心管中加入等体积的氯仿:异戊醇=24:1,轻轻上下晃动摇匀,离心,温度21℃,转速10000 r/min,时间15 min,再吸取上清液,将上清液转入另一个新的1500μL离心管中,离心管中含有

400μL上清液;将装有400μL上清液的离心管中加入2倍体积的冷冻无水乙醇,放入温度-20℃冷冻冰箱,时间30min,离心,温度21℃,转速10000 r/min,时间15min后有清晰乳白色的DNA白絮沉淀,去除上部液体;再将乳白色的DNA白絮沉淀用浓度为70%的乙醇洗涤2-3 次,自然风干后,溶于50μL 含有10 mM三羟甲基氨基甲烷,1mM四乙酸二氨基乙烯,pH8.0的缓冲溶液中,温度-20℃冰箱保存;

c、用1.5%的琼脂糖凝胶电泳检测DNA纯度;将步骤b得到的DNA浓度稀释至50ng/μl后,置于温度-20℃冰箱中备用;

d、SSR引物筛选:

根据NCBI数据库上搜索,从来源于核果类果树作物的100对SSR引物中通过初筛和复筛,最终选出10对产物主带明显并且多态性较好的引物进行SSR微卫星分子标记分析,其中SSR 10对标记为:标记1  BPPCT002,其上游引物5’TCGACAGCTTGATCTTGACC,下游引物5’CAATGCCTACGGAGATAAAAGAC;

标记2  BPPCT004,其上游引物5’  CTG  AGT  GATCCATTTGCAGG,下游引物5’AGGGCATCTAGACCTCATTGTT;

标记3  BPPCT032,其上游引物5’TTAAGCCACAACATCCATGAT,下游引物5’AATGGTCTAAGGAGCACACG;

’ ’

标记4  BPPCT036,其上游引物5 AAGCAAAGTCCATAAAAACGC,下游引物5GGACGAAGACGCTCCATT;

标记5  BPPCT040,其上游引物5’ATGAGGACGTGTCTGAATGG,下游引物5’AGCCAA ACCCCTCTTATACG;

’ ’

标记6  Pchgms1,其上游引物5 GGGTAAATATGCCCATTGTGCAATC,下游引物5GGATCATTGAACTACGTCAATCCTC;

标记7  Pchgms3,其上游引物5’ACGGTATGTCCGTACACTCTCCATG,下游引物5’CAACCTGTGATTGCTCCTATTAAAC;

标记8  Pchgms10,其上游引物5’CGTCACGCATCCTTTCATTT,下游引物5’GACACCTCCATTTGTATCAAAGC;

标记9  Pchgms11,其上游引物5’TTGAGGCCCACTTATTAGCC,下游引物5’CCCCCATTATTCAAACTTCTG;

标记10Pchgms21,其上游引物5’ACCACCATTTTGGCTCTCTG,下游引物5’CATGCAACCCAAAACCATCT;

e、SSR一PCR扩增反应、电泳检测:SSR-PCR反应体系20μl反应体系包含:10 ×Taq 酶配套缓冲液,1.5 mmol/L MgCl2  , 0.25mmol/L dNTPS,SSR上下游引物各为0.2mol/μl,0.5U Taq DNA 聚合酶,DNA 模板30ng, 相应的扩增程序为:温度94℃预变性,4 min,然后是温度

94 ℃变性60s,温度55℃复性40 s,温度72 ℃延伸60s,共34个循环后,温度72 ℃延伸8 min 补齐,扩增产物中加入6倍的Loadingbuffer2.0μl,取2.5μl上样,用8%非变性聚丙烯酞胺凝胶电泳检测,银染显色;

f、统计分析:基于不加权配对组算术方法的聚类分析用NTSYS-pc 2.10e软件进行数据分析,选择清晰可辨的电泳带,样品有带则记为1,无带则记为0,构建二态数据矩阵;对原始矩阵用SimQual程序求SSM相似系数及遗传距离矩阵,并用SAHN程序中的UPGMA方法进行聚类分析,基于Wagner简约法的聚类分析用PHYLIP3.65软件包中SEQBOOT、MIX或CONSENSE程序作出一致性树图,并用TreeView1.6程序生成简约图,构建分子进化系统树。

说明书 :

一种基于SSR分子标记鉴别扁桃属植物种质的方法

技术领域

[0001] 本发明属于分子生物学的分子标记领域,具体涉及一种基于SSR分子标记鉴别扁桃属植物种质的方法。

背景技术

[0002] 扁桃,俗称巴旦杏,为蔷薇科李亚科桃属扁桃属植物,我国现有分布的扁桃属植物种质资源包括野生和栽培种共6种,主要分布在新疆天山以南的喀什地区;新疆准葛尔盆地西部的巴尔鲁克山、塔尔巴哈台山和阿尔泰山等山地;内蒙古乌拉山、大青山;宁夏贺兰山;青藏高原东端等地。分别是普通扁桃Amygdalus.communis  L.、新疆野扁桃Amygdalus.ledebouriana Schlecht.、蒙古扁桃Amygdalus.mongolica Moxim.、长柄扁桃Amygdalus.pedunculata Pall.、西康扁桃Amygdalus.tangutica Batal.、榆叶梅Amygdalus.triloba(Lindl)Ricker.。
[0003] 扁桃作为普通扁桃栽培种的历史十分悠久,大约在4000年前,扁桃在其原产地西亚地区就已被引种栽培。由于气候环境等条件的限制,目前在世界范围内只有中国新疆,美国加利福利亚州,西亚的伊朗,南欧的意大利西班亚等地有栽培。我国栽培普通扁桃已有1300多年的历史,主要分布在新疆天山以南喀什地区的英吉沙及莎车等地。由于长期的实生繁殖和自然演化,形成了丰富的资源,栽培品种、品系以及优良单株有近百个,这些资源形态各异,关系复杂,多数品种谱系不清,同名异物或同物异名的现象普遍,这给扁桃的分类、栽培以及品种选育带来很大困难。
[0004] 本发明重点立足于新疆的扁桃资源,包括分布于新疆的5个不同群体的新疆野扁桃的类型,同时对引进栽培的美国扁桃品种资源(即所谓的美国大杏仁)及分布于我国的扁桃属植物种进行SSR分子标记和聚类分析。SSR也称微卫星标记,是由长度为1-6个碱基的基元,串联重复而成的,广泛分布于基因组中。SSR是基因组中变异最为迅速的序列,其串联重复数的突变率很高,从而产生了很多等位基因,形成了SSR的高度多态性。SSR标记是基于PCR扩增的分子标记,呈共显性,引物由待检物种的基因组序列开发而来,物种特异性强,不易受内生及外源微生物基因组的影响,结果准确可靠,正是基于这些优点,国际植物品种权保护组织(UPOV)于2007年将SSR与最新发展的SNP标记一起确定为构建DNA指纹数据库的标记方法。
[0005] 本发明旨在研究我国扁桃类植物种质包括引进的各个种、品种之间的亲缘关系。建立一套简便、快速、可靠的扁桃属植物种质鉴定技术体系应用于该属种质资源的鉴定,进行种质及品种权利保护,对于维护育种者和生产者的利益,保障该产业健康发展,具有重要而现实的意义。

发明内容

[0006] 本发明的目的在于:提供一种基于SSR分子标记技术鉴别扁桃属植物种质的方法,该方法通过选择多态性高的SSR引物,对国内外55份扁桃属植物种质材料进行SSR-PCR扩增反应、电泳检测、统计分析。结果表明:使用筛选自核果类的100对SSR引物中的10对多态性强的引物对扁桃属植物种质材料,包括国内外栽培品种及不同种的55个个体样本的基因组DNA进行SSR-PCR扩增,获得了较好的扩增结果。10对引物共扩增出63条扩增条带,其中多态带60条,多态率为95.2%。通过进行相似系数和聚类分析,遗传相似系数为0.4133-0.9600,平均相似系数为0.6867;聚类分析将些类种质材料划分为6个大类,55份扁桃类植物种质间的遗传差异表明:不同种以及不同品种间的遗传距离不同,在相似系数小于0.68时,大多数栽培品种聚为一类,栽培品种中,同一种源区的大多数栽培品种能聚类在一起。
普通栽培扁桃与新疆野扁桃间的亲缘关系比长柄扁桃、蒙古扁桃、西康扁桃以及榆叶梅间的亲缘关系更近,为进一步区分扁桃类植物种质资源亲缘关系远近提供了重要途径。该方法较之常规的形态学、细胞学、生化标记鉴定等传统方法更为简便、直观、真实,可方便地应用于扁桃属植物种质区分、鉴定、查对、交换、管理、利用。其开放性更利于同行间的交流和共享,为进一步的优良育种目的提供鉴定技术体系。
[0007] 本发明提供一种基于SSR分子标记技术鉴别扁桃属植物种质的方法,按下列步骤进行:
[0008] 准备扁桃属植物种质材料:
[0009] a、早春季,选取健壮、无病虫害的扁桃属植物55份样本的新鲜嫩叶,每份样本以液氮冷冻后放入温度-70℃超低温冰箱中保存备用;
[0010] 扁桃属植物种质DNA的提取:
[0011] b、迅速加入1000μL,温度65℃预热的含2%十六烷基三甲基溴化铵,1.4M氯化钠,20mM四乙酸二氨基乙烯,100mM三羟甲基氨基甲烷,pH8.0的缓冲液和8%巯基乙醇的缓冲液,轻轻摇匀;置于温度65℃水浴锅中温浴60min,其间每隔10min轻轻上下晃动摇匀1次,使溶液充分裂解;采用台式离心机离心,温度21℃,转速10000r/min,时间15min,吸取上清液,将上清液平均分配转入另外两个新的1500μL离心管中,其中每个离心管中均含有480μL上清液;将每个含有上清液的离心管中加入等体积的氯仿:异戊醇=24:1,轻轻上下晃动摇匀,离心,温度21℃,转速10000r/min,时间15min,吸取上清液,将每个离心管中的上清液合并,转入另一个新的1500μL离心管中,离心管中含有600μL上清液;将装有600μL上清液的离心管中加入等体积的氯仿:异戊醇=24:1,轻轻上下晃动摇匀,离心,温度21℃,转速
10000r/min,时间15min,再吸取上清液,将上清液转入另一个新的1500μL离心管中,离心管中含有400μL上清液;将装有400μL上清液的离心管中加入2倍体积的冷冻无水乙醇,放入温度-20℃冷冻冰箱,时间30min,离心,温度21℃,转速10000r/min,时间15min后有清晰乳白色的DNA白絮沉淀,去除上部液体;再将乳白色的DNA白絮沉淀用浓度为70%的乙醇洗涤2-3次,自然风干后,溶于50μL含有10mM三羟甲基氨基甲烷,1mM四乙酸二氨基乙烯,pH8.0的缓冲溶液中,温度-20℃冰箱保存;
[0012] c、用1.5%的琼脂糖凝胶电泳检测DNA纯度;将步骤b得到的DNA浓度稀释至50ng/μl后,置于温度-20℃冰箱中备用;
[0013] d、SSR引物筛选:
[0014] 根据NCBI数据库上搜索,从来源于核果类果树作物的100对SSR引物中通过初筛和复筛,最终选出10对产物主带明显并且多态性较好的引物进行SSR微卫星分子标记分析,其中SSR 10对标记为:
[0015] 标记1BPPCT002,其上游引物5’TCGACAGCTTGATCTTGACC,下游引物5’CAATGCCTACGGAGATAAAAGAC;
[0016] 标记2BPPCT004,其上游引物5’CTGAGTGATCCATTTGCAGG,下游引物5’AGGGCATCTAGACCTCATTGTT;
[0017] 标记3BPPCT032,其上游引物5’TTAAGCCACAACATCCATGAT,下游引物5’AATGGTCTAAGGAGCACACG;
[0018] 标记4BPPCT036,其上游引物5’AAGCAAAGTCCATAAAAACGC,下游引物5’GGACGAAGACGCTCCATT;
[0019] 标记5BPPCT040,其上游引物5’ATGAGGACGTGTCTGAATGG,下游引物5’AGCCAAACCCCTCTTATACG;
[0020] 标记6Pchgms1,其上游引物5’GGGTAAATATGCCCATTGTGCAATC,下游引物5’GGATCATTGAACTACGTCAATCCTC;
[0021] 标记7Pchgms3,其上游引物5’ACGGTATGTCCGTACACTCTCCATG,下游引物5’CAACCTGTGATTGCTCCTATTAAAC;
[0022] 标记8Pchgms10,其上游引物5’CGTCACGCATCCTTTCATTT,下游引物5’GACACCTCCATTTGTATCAAAGC;
[0023] 标记9Pchgms11,其上游引物5’TTGAGGCCCACTTATTAGCC,下游引物5’CCCCCATTATTCAAACTTCTG;
[0024] 标记10Pchgms21,其上游引物5’ACCACCATTTTGGCTCTCTG,下游引物5’CATGCAACCCAAAACCATCT;
[0025] e、SSR一PCR扩增反应、电泳检测:SSR-PCR反应体系20μl反应体系包含:10×Taq酶配套缓冲液,1.5mmol/L MgCl2,0.25mmol/L dNTPS,SSR上下游引物各为0.2mol/μl,0.5UTaq DNA聚合酶,DNA模板30ng,相应的扩增程序为:温度94℃预变性,4min,然后是温度
94℃变性60s,温度55℃复性40s,温度72℃延伸60s,共34个循环后,温度72℃延伸8min补齐,扩增产物中加入6倍的Loadingbuffer2.0μl,取2.5μl上样,用8%非变性聚丙烯酞胺凝胶电泳检测,银染显色;
[0026] f、统计分析:基于不加权配对组算术方法的聚类分析用NTSYS-pc 2.10e软件进行数据分析,选择清晰可辨的电泳带,样品有带则记为1,无带则记为0,构建二态数据矩阵;对原始矩阵用SimQual程序求SSM相似系数及遗传距离矩阵,并用SAHN程序中的UPGMA方法进行聚类分析,基于Wagner简约法的聚类分析用PHYLIP3.65软件包中SEQBOOT、MIX、CONSENSE等程序作出一致性树图,并用TreeView1.6程序生成简约图,构建分子进化系统树。
[0027] 本发明所述的一种基于SSR分子标记鉴别扁桃属植物种质的方法,该方法中涉及的准备扁桃属植物种质材料:采自中国新疆塔城及阿勒泰地区不同分布居群的新疆野生扁桃5份(在布尔津、哈巴河、塔城、托里,裕民5个不同分布居群中心区中分别随机选取,分别编号为新疆野扁桃1号、2号、3号、4号、5号单株);采自中国新疆南疆喀什地区英吉沙及莎车县的新疆地方栽培扁桃品种30份;采自中国新疆南疆喀什地区莎车县从美国加利福尼亚州引进的优良栽培扁桃品种16份;采自新疆林业科学院林果资源圃的蒙古扁桃、西康扁桃、长柄扁桃以及榆叶梅等扁桃属植物的种质资源4份;总计55份样本材料,基本涵盖了扁桃属植物的种质资源。
[0028] 本发明所述的一种基于SSR分子标记鉴别扁桃属植物种质的方法,通过该方法所得结果与分析:
[0029] 采用本申请人前期的授权专利:“一种适用于干旱区果树作物基因组DNA提取技术的方法”(专利号:201310236983.4)提取各种扁桃属植物种质材料的DNA,条带清晰明亮,无降解现象,DNA质量完整性好,分光光度计检测发现OD260/OD280比值在1.8-2.0之间,浓度在350-700ng/μl,均能满足SSR-PCR的要求。
[0030] 使用筛选自核果类的100对SSR引物中的10对多态性强的引物对扁桃属植物种质材料,包括国内外栽培品种及不同种的55个体样本的基因组DNA进行SSR-PCR扩增,获得了较好的扩增结果。10对引物共扩增出63条扩增条带,其中多态带60条,多态率为95.2%。
[0031] 遗传差异及亲缘关系分析:遗传相似度及遗传距离的计算结果表明:扁桃属植物种质不同种以及不同品种间的基因型差异不同:在所有供试的扁桃栽培品种中,各基因型之间的遗传相似度较种间的普遍较大,而且变异也较大,其中晚丰品种与矮丰品种的遗传相似系数最大(0.9600),说明这两者间亲缘关系最近,而尖嘴黄巴旦品种和Thompson品种的遗传相似系数最小(0.4500),反映这两者间亲缘关系最远。
[0032] 对包括47个扁桃栽培品种(国内国外);新疆野扁桃1号、2号、3号、4号和5号;长柄扁桃、蒙古扁桃、西康扁桃、榆叶梅等在内的扁桃属植物种质种间进行遗传多样性分析,发现扁桃栽培品种与新疆野扁桃1号、2号、3号、4号和5号之间的遗传相似性系数在0.5067~0.7067之间,平均值为0.6067,大于扁桃栽培品种与长柄扁桃、蒙古扁桃及西康扁桃之间的相似性(0.4400~0.6133,均值为0.5266)。也就是说扁桃栽培品种与新疆野扁桃之间的亲缘关系比长柄扁桃、蒙古扁桃、西康扁桃之间的亲缘关系更近。
[0033] 榆叶梅种与扁桃属5种植物之间的遗传相似系数在0.4133-0.5433之间,均值为0.4783,亲缘关系更远,因此,聚类时被聚在了最外缘。
[0034] 聚类分析:以55个样本间的相似性系数构成矩阵进行聚类分析构建聚类图,结果表明:受试的所有国内外扁桃栽培品种在相似系数小于0.68时聚为一个大类,表明扁桃栽培品种具有相似的遗传背景。
[0035] 同时与扁桃栽培品种相近的扁桃类植物种在该相似系数(0.68)下被划分为扁桃栽培品种组(国内外栽培品种)、新疆野扁桃组(新疆野扁桃1号、2号、3号、4号和5号)、扁桃种组(长柄扁桃、蒙古扁桃、西康扁桃)以及榆叶梅。该结果基本说明了各个扁桃种或品种的基因型遗传背景的共同性和变异多样性。
[0036] 在栽培品种群中,来自美国加利福尼亚种源区的品种大部分可归为一类,此外主要为亚洲种源区的来源于同一地区(新疆英吉沙和莎车县)的品种比较容易归类在一起,但也有部分的交叉情况,该结果基本表明了扁桃各品种之间的亲缘关系及遗传变异情况。
[0037] 本发明的有益效果在于:本发明旨在通过SSR分子标记研究我国扁桃类植物种质包括引进的各个种、品种之间的亲缘关系。建立了一套简便、快速、可靠的扁桃属植物种质鉴定技术体系应用于该属种质资源的鉴定,进行种质及品种权利保护,为进一步的优良育种目的提供鉴定技术体系。对于维护育种者和生产者的利益,保障该产业健康发展,具有重要而现实的意义。

附图说明

[0038] 图1为本发明UPGMA法构建55份扁桃属植物的SSR聚类图,其中图中编号对应表1;
[0039] 图2为本发明Wagner简约法构建55份扁桃属植物的SSR聚类图,其中图中编号对应表1。

具体实施方式

[0040] 下面结合附图对本发明作进一步说明。
[0041] 实施例
[0042] 准备扁桃属植物种质材料:采自中国新疆塔城及阿勒泰地区不同分布居群的新疆野生扁桃5份(在布尔津、哈巴河、塔城、托里,裕民5个不同分布居群中心区中分别随机选取,分别编号为新疆野扁桃1号、2号、3号、4号、5号单株);采自中国新疆南疆喀什地区英吉沙及莎车县的新疆地方栽培扁桃品种30份;采自中国新疆南疆喀什地区莎车县从美国加利福尼亚州引进的优良栽培扁桃品种16份;采自新疆林业科学院林果资源圃的蒙古扁桃、西康扁桃、长柄扁桃以及榆叶梅等扁桃属植物的种质资源4份;总计55份样本材料,基本涵盖了扁桃属植物的种质资源,早春季,选取健壮、无病虫害的扁桃属植物55份样本的新鲜嫩叶,每份样本以液氮冷冻后放入温度-70℃超低温冰箱中保存备用(表1);
[0043] 表1.扁桃类植物种质材料信息
[0044]
[0045]
[0046] 注:★中国品种,◆国外品种,●种;
[0047] 扁桃属植物种质DNA的提取:迅速加入1000μL,温度65℃预热的含2%十六烷基三甲基溴化铵,1.4M氯化钠,20mM四乙酸二氨基乙烯,100mM三羟甲基氨基甲烷,pH8.0的缓冲液和8%巯基乙醇的缓冲液,轻轻摇匀;置于温度65℃水浴锅中温浴60min,其间每隔10min轻轻上下晃动摇匀1次,使溶液充分裂解;采用台式离心机离心,温度21℃,转速10000r/min,时间15min,吸取上清液,将上清液平均分配转入另外两个新的1500μL离心管中,其中每个离心管中均含有480μL上清液;将每个含有上清液的离心管中加入等体积的氯仿:异戊醇=24:1,轻轻上下晃动摇匀,离心,温度21℃,转速10000r/min,时间15min,吸取上清液,将每个离心管中的上清液合并,转入另一个新的1500μL离心管中,离心管中含有600μL上清液;将装有600μL上清液的离心管中加入等体积的氯仿:异戊醇=24:1,轻轻上下晃动摇匀,离心,温度21℃,转速10000r/min,时间15min,再吸取上清液,将上清液转入另一个新的1500μL离心管中,离心管中含有400μL上清液;将装有400μL上清液的离心管中加入2倍体积的冷冻无水乙醇,放入温度-20℃冷冻冰箱,时间30min,离心,温度21℃,转速10000r/min,时间15min后有清晰乳白色的DNA白絮沉淀,去除上部液体;再将乳白色的DNA白絮沉淀用浓度为70%的乙醇洗涤2-3次,自然风干后,溶于50μL含有10mM三羟甲基氨基甲烷,1mM四乙酸二氨基乙烯,pH8.0的缓冲溶液中,温度-20℃冰箱保存;
[0048] 用1.5%的琼脂糖凝胶电泳检测DNA纯度;将步骤b得到的DNA浓度稀释至50ng/μl后,置于温度-20℃冰箱中备用;
[0049] SSR引物筛选:
[0050] 根据NCBI数据库上搜索,从来源于核果类果树作物的100对SSR引物中通过初筛和复筛,最终选出10对产物主带明显并且多态性较好的引物进行SSR微卫星分子标记分析,其中SSR 10对标记为:
[0051] 标记1BPPCT002,其上游引物5’TCGACAGCTTGATCTTGACC,下游引物5’CAATGCCTACGGAGATAAAAGAC;
[0052] 标记2BPPCT004,其上游引物5’CTGAGTGATCCATTTGCAGG,下游引物5’AGGGCATCTAGACCTCATTGTT;
[0053] 标记3BPPCT032,其上游引物5’TTAAGCCACAACATCCATGAT,下游引物5’AATGGTCTAAGGAGCACACG;
[0054] 标记4BPPCT036,其上游引物5’AAGCAAAGTCCATAAAAACGC,下游引物5’GGACGAAGACGCTCCATT;
[0055] 标记5BPPCT040,其上游引物5’ATGAGGACGTGTCTGAATGG,下游引物5’AGCCAAACCCCTCTTATACG;
[0056] 标记6Pchgms1,其上游引物5’GGGTAAATATGCCCATTGTGCAATC,下游引物5’GGATCATTGAACTACGTCAATCCTC;
[0057] 标记7Pchgms3,其上游引物5’ACGGTATGTCCGTACACTCTCCATG,下游引物5’CAACCTGTGATTGCTCCTATTAAAC;
[0058] 标记8Pchgms10,其上游引物5’CGTCACGCATCCTTTCATTT,下游引物5’GACACCTCCATTTGTATCAAAGC;
[0059] 标记9Pchgms11,其上游引物5’TTGAGGCCCACTTATTAGCC,下游引物5’CCCCCATTATTCAAACTTCTG;
[0060] 标记10Pchgms21,其上游引物5’ACCACCATTTTGGCTCTCTG,下游引物5’CATGCAACCCAAAACCATCT;
[0061] 表2.SSR引物序列与名称
[0062]
[0063] SSR一PCR扩增反应、电泳检测:SSR-PCR反应体系20μl反应体系包含:10×Taq酶配套缓冲液,1.5mmol/L MgCl2,0.25mmol/L dNTPS,SSR上下游引物各为0.2mol/μl,0.5UTaq DNA聚合酶,DNA模板30ng,相应的扩增程序为:温度94℃预变性,4min,然后是温度94℃变性60s,温度55℃复性40s,温度72℃延伸60s,共34个循环后,温度72℃延伸8min补齐,扩增产物中加入6倍的Loadingbuffer2.0μl,取2.5μl上样,用8%非变性聚丙烯酞胺凝胶电泳检测,银染显色;
[0064] 统计分析:于不加权配对组算术方法(unweighted pair group method with arithmetic mean,UPGMA)算法的聚类分析用NTSYS-pc 2.10e(numerical taxonomy and multivariate analysis system,NTSYS)软件进行数据分析。选择清晰可辨的电泳带,样品有带则记为1,无带则记为0,构建二态数据矩阵;为了进一步比较和研究扁桃属植物种质资源不同种间及不同品种的遗传差异,对原始矩阵用SimQual程序求SSM相似系数及遗传距离矩阵,并用SAHN程序中的UPGMA方法进行聚类分析。基于Wagner简约法(Wagner Parsimony)的聚类分析用PHYLIP3.65(Phylogeny Inference Package)软件包中SEQBOOT、MIX、CONSENSE等程序作出一致性树图,并用TreeView1.6程序生成简约图,构建分子进化系统树;
[0065] 结果与分析:
[0066] 通过本发明所述方法中提取各种扁桃属植物种质材料的DNA,条带清晰明亮,无降解现象,DNA质量完整性好,分光光度计检测发现OD260/OD280比值在1.8-2.0之间,浓度在350-700ng/μl,均能满足SSR-PCR的要求;
[0067] 使用筛选自核果类的100对SSR引物中的10对多态性强的引物对扁桃属植物种质材料,包括国内外栽培品种及不同种的55个个体样本的基因组DNA进行SSR-PCR扩增,获得了较好的扩增结果。10对引物共扩增出63条扩增条带,其中多态带60条,多态率为95.2%;
[0068] 遗传差异及亲缘关系分析:遗传相似度及遗传距离的计算结果表明:扁桃属植物种质不同种以及不同品种间的基因型差异不同:在所有供试的扁桃栽培品种中,各基因型之间的遗传相似度较种间的普遍较大,而且变异也较大,其中晚丰品种与矮丰品种的遗传相似系数最大(0.9600),说明这两者间亲缘关系最近,而尖嘴黄巴旦品种和Thompson品种的遗传相似系数最小(0.4500),反映这两者间亲缘关系最远;
[0069] 对包括47个扁桃栽培品种(国内国外);新疆野扁桃1号、2号、3号、4号和5号;长柄扁桃、蒙古扁桃、西康扁桃、榆叶梅等在内的扁桃属植物种质种间进行遗传多样性分析,发现扁桃栽培品种与新疆野扁桃1号、2号、3号、4号和5号之间的遗传相似性系数在0.5067~0.7067之间,平均值为0.6067,大于扁桃栽培品种与长柄扁桃、蒙古扁桃及西康扁桃之间的相似性(0.4400~0.6133,均值为0.5266)。也就是说扁桃栽培品种与新疆野扁桃之间的亲缘关系比长柄扁桃、蒙古扁桃、西康扁桃之间的亲缘关系更近;
[0070] 榆叶梅种与扁桃属5种植物之间的遗传相似系数在0.4133-0.5433之间,均值为0.4783,亲缘关系更远,因此,聚类时被聚在了最外缘;
[0071] 聚类分析:以55个样本间的相似性系数构成矩阵进行聚类分析构建聚类图,基于UPGMA法(图1)与Wagner简约法聚类结果十分类似(图2)。结果表明:受试的所有国内外扁桃栽培品种在相似系数小于0.68时聚为一个大类,表明扁桃栽培品种具有相似的遗传背景;
[0072] 同时与扁桃栽培品种相近的扁桃类植物种在该相似系数(0.68)下被划分为扁桃栽培品种组(国内外栽培品种)、新疆野扁桃组(新疆野扁桃1号、2号、3号、4号和5号)、扁桃种组(长柄扁桃、蒙古扁桃、西康扁桃)以及榆叶梅。该结果基本说明了各个扁桃种或品种的基因型遗传背景的共同性和变异多样性。
[0073] 在栽培品种群中,来自美国加利福尼亚种源区的品种大部分可归为一类,此外主要为亚洲种源区的来源于同一地区(新疆英吉沙和莎车县)的品种比较容易归类在一起,但也有部分的交叉情况(表5):
[0074] 表5扁桃属植物间种及品种间的遗传相似度和遗传距离表
[0075]群体 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11
1 **** 0.8267 0.7733 0.7600 0.7467 0.6533 0.7467 0.7467 0.6600 0.8533 0.7200
2 0.1904 **** 0.7067 0.7200 0.7067 0.6667 0.7600 0.7867 0.6933 0.7333 0.6533
3 0.2570 0.3472 **** 0.8000 0.7867 0.7200 0.7067 0.6800 0.8000 0.7600 0.7333
4 0.2744 0.3285 0.2231 **** 0.7200 0.7867 0.6933 0.6400 0.7333 0.6933 0.7467
5 0.2921 0.3472 0.2400 0.3285 **** 0.8000 0.7867 0.7067 0.6933 0.7333 0.7867
6 0.4257 0.4055 0.3285 0.2400 0.2231 **** 0.8267 0.6667 0.6267 0.6667 0.6933
7 0.2921 0.2744 0.3472 0.3662 0.2400 0.1904 **** 0.7867 0.6933 0.7067 0.6533
8 0.2921 0.2400 0.3857 0.4463 0.3472 0.4055 0.2400 **** 0.7467 0.7067 0.6800
9 0.2744 0.3662 0.2231 0.3102 0.3662 0.4673 0.3662 0.2921 **** 0.8000 0.7200
10 0.1586 0.3102 0.2744 0.3662 0.3102 0.4055 0.3472 0.3472 0.2231 **** 0.7867
11 0.3285 0.4257 0.3102 0.2921 0.2400 0.3662 0.4257 0.3857 0.3285 0.2400 ****
12 0.3102 0.4463 0.2570 0.3857 0.2231 0.3102 0.3662 0.4055 0.2066 0.1904 0.1904
13 0.3285 0.3857 0.2744 0.3662 0.2400 0.2921 0.3472 0.4257 0.2570 0.2400 0.2066
14 0.2921 0.3857 0.2066 0.1904 0.3857 0.3285 0.3857 0.4673 0.2231 0.3102 0.3102
15 0.2400 0.2570 0.3662 0.3857 0.4055 0.4257 0.4463 0.3662 0.3102 0.2921 0.3662
16 0.3102 0.2921 0.3285 0.4673 0.4055 0.4673 0.3285 0.2921 0.3857 0.4055 0.4888
17 0.3472 0.4463 0.4463 0.4257 0.5798 0.4257 0.5798 0.4463 0.5108 0.4055 0.5333
18 0.3662 0.5108 0.2744 0.3285 0.2744 0.5333 0.4673 0.3857 0.2921 0.4257 0.2400
19 0.3472 0.4055 0.3662 0.3472 0.3285 0.3102 0.4888 0.2921 0.2744 0.3285 0.2921
20 0.3472 0.4888 0.3285 0.2400 0.4463 0.3857 0.4463 0.3662 0.2066 0.3285 0.3285
21 0.4055 0.5563 0.3857 0.4888 0.4257 0.4055 0.4257 0.4257 0.4463 0.3857 0.3472
22 0.4888 0.4673 0.3472 0.4463 0.3102 0.3285 0.4257 0.4257 0.4055 0.3857 0.3857
23 0.2400 0.2921 0.3285 0.3102 0.4055 0.5563 0.3662 0.3285 0.2744 0.3285 0.3662
24 0.3472 0.3662 0.3285 0.3857 0.3662 0.3857 0.4888 0.3285 0.3472 0.3285 0.3285
25 0.4888 0.5563 0.3102 0.2921 0.3857 0.3662 0.4673 0.6039 0.3285 0.3857 0.3857
26 0.5563 0.6286 0.5333 0.5563 0.4888 0.3857 0.4055 0.5333 0.5563 0.6286 0.5798
27 0.4055 0.5563 0.3102 0.2921 0.3857 0.4463 0.4257 0.5108 0.2921 0.3857 0.3472
28 0.4888 0.4673 0.4673 0.3662 0.3857 0.4463 0.5108 0.4673 0.3662 0.5108 0.3857
29 0.6039 0.4888 0.4888 0.5563 0.6286 0.5563 0.4888 0.4463 0.4257 0.7340 0.7340
30 0.3102 0.3285 0.4055 0.3857 0.4888 0.5563 0.3285 0.4463 0.3857 0.3662 0.4055
31 0.3662 0.5108 0.2744 0.2921 0.3857 0.4888 0.4673 0.4673 0.2570 0.3102 0.3102
32 0.4257 0.4888 0.4463 0.3857 0.5798 0.6539 0.5798 0.4463 0.3857 0.5333 0.4463
33 0.5563 0.5798 0.5333 0.5563 0.4888 0.4257 0.4888 0.2570 0.4673 0.5333 0.4463
34 0.4257 0.5798 0.4463 0.3857 0.6286 0.4673 0.4888 0.4463 0.4673 0.5798 0.4888
35 0.3857 0.4888 0.5333 0.5108 0.4463 0.4257 0.3285 0.3662 0.4257 0.4888 0.4055
36 0.4257 0.6799 0.4888 0.5108 0.5798 0.6039 0.5798 0.5333 0.3472 0.4055 0.3662
37 0.7066 0.7340 0.5798 0.4257 0.3472 0.3102 0.6286 0.4673 0.5108 0.5798 0.5798
38 0.4673 0.5333 0.4463 0.4673 0.6799 0.4257 0.5333 0.3662 0.5563 0.6286 0.5798
39 0.4257 0.5333 0.4055 0.4673 0.5798 0.4673 0.5798 0.4055 0.4673 0.4888 0.4888
40 0.4055 0.5108 0.4673 0.4888 0.5563 0.4888 0.6039 0.5563 0.5798 0.4673 0.4257
41 0.4257 0.4463 0.5333 0.5563 0.6286 0.5563 0.4888 0.3285 0.6039 0.6799 0.6286
42 0.2400 0.3285 0.3662 0.4673 0.3662 0.5108 0.4055 0.3662 0.4673 0.4055 0.4055
43 0.4888 0.6039 0.4257 0.4463 0.6539 0.4888 0.6039 0.4673 0.5798 0.6539 0.5108
44 0.3857 0.6286 0.4888 0.4673 0.6799 0.6539 0.7340 0.5798 0.4673 0.4055 0.4055
45 0.3662 0.4257 0.3857 0.4888 0.4673 0.6286 0.5108 0.3857 0.4888 0.5563 0.4673
46 0.3285 0.4673 0.4257 0.4055 0.4257 0.5333 0.5563 0.4257 0.4463 0.5563 0.3472
47 0.7340 0.8835 0.7066 0.7911 0.9502 0.8518 0.7621 0.6539 0.5798 0.7621 0.8210
48 0.5333 0.6039 0.6039 0.6799 0.6539 0.7911 0.6539 0.5563 0.5333 0.6039 0.5108
49 0.5563 0.5798 0.6286 0.6039 0.6286 0.5108 0.4888 0.5333 0.7621 0.5798 0.4888
50 0.5798 0.6539 0.6039 0.4888 0.6539 0.6286 0.6039 0.6539 0.6286 0.6039 0.5563
51 0.5798 0.4673 0.4673 0.4463 0.5108 0.4888 0.5563 0.6039 0.4055 0.3857 0.4673
52 0.6039 0.5333 0.4463 0.5108 0.5798 0.5108 0.5333 0.7340 0.4673 0.4888 0.4888
53 0.4888 0.4673 0.4673 0.4055 0.5563 0.4888 0.4673 0.6039 0.4463 0.3472 0.4257
54 0.6286 0.5563 0.4673 0.4888 0.5108 0.4463 0.4673 0.6039 0.4055 0.4673 0.4257
55 0.3857 0.4055 0.4888 0.6039 0.5333 0.6539 0.4888 0.4888 0.3857 0.3662 0.4888[0076] 续上表
[0077]群体 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22
1 0.7333 0.7200 0.7467 0.6867 0.7333 0.7067 0.6933 0.7067 0.7067 0.6667 0.6133
2 0.6400 0.6800 0.6800 0.7733 0.7467 0.6400 0.6000 0.6667 0.6133 0.5733 0.6267
3 0.7733 0.7600 0.8133 0.6933 0.7200 0.6400 0.7600 0.6933 0.7200 0.6800 0.7067
4 0.6800 0.6933 0.8267 0.6800 0.6267 0.6533 0.7200 0.7067 0.7867 0.6133 0.6400
5 0.8000 0.7867 0.6800 0.6667 0.6667 0.5600 0.7600 0.7200 0.6400 0.6533 0.7333
6 0.7333 0.7467 0.7200 0.6533 0.6267 0.6533 0.5867 0.7333 0.6800 0.6667 0.7200
7 0.6933 0.7067 0.6800 0.6400 0.7200 0.5600 0.6267 0.6133 0.6400 0.6533 0.6533
8 0.6667 0.6533 0.6267 0.6933 0.7467 0.6400 0.6800 0.7467 0.6933 0.6533 0.6533
9 0.8133 0.7733 0.8000 0.6333 0.6800 0.6000 0.7467 0.7600 0.8133 0.6400 0.6667
10 0.8267 0.7867 0.7333 0.7467 0.6667 0.6667 0.6533 0.7200 0.7200 0.6800 0.6800
11 0.8267 0.8133 0.7333 0.6933 0.6133 0.5867 0.7867 0.7467 0.7200 0.7067 0.6800
12 **** 0.9600 0.8533 0.7867 0.6533 0.6533 0.7733 0.8133 0.7867 0.8000 0.8000
13 0.0408 **** 0.8667 0.7733 0.6667 0.6400 0.7333 0.8000 0.8000 0.7867 0.8133
14 0.1586 0.1431 **** 0.7200 0.6400 0.6667 0.7600 0.7467 0.8533 0.7333 0.7067
15 0.2400 0.2570 0.3285 **** 0.6800 0.7600 0.6400 0.8133 0.7067 0.6667 0.7467
16 0.4257 0.4055 0.4463 0.3857 **** 0.7333 0.6400 0.6267 0.6800 0.6933 0.6933
17 0.4257 0.4463 0.4055 0.2744 0.3102 **** 0.5867 0.7600 0.6800 0.7200 0.7733
18 0.2570 0.3102 0.2744 0.4463 0.4463 0.5333 **** 0.7200 0.6933 0.7333 0.6533
19 0.2066 0.2231 0.2921 0.2066 0.4673 0.2744 0.3285 **** 0.8133 0.6933 0.8267
20 0.2400 0.2231 0.1586 0.3472 0.3857 0.3857 0.3662 0.2066 **** 0.7200 0.7467
21 0.2231 0.2400 0.3102 0.4055 0.3662 0.3285 0.3102 0.3662 0.3285 **** 0.7333
22 0.2231 0.2066 0.3472 0.2921 0.3662 0.2570 0.4257 0.1904 0.2921 0.3102 ****
23 0.3472 0.3285 0.3285 0.3102 0.2400 0.3857 0.3285 0.3472 0.2400 0.3662 0.2921
24 0.2400 0.2231 0.2921 0.1744 0.3472 0.2066 0.4055 0.1128 0.2066 0.3285 0.1278
25 0.2231 0.2066 0.2066 0.4463 0.4463 0.4463 0.3472 0.3662 0.2231 0.2744 0.2066
26 0.3857 0.4463 0.5333 0.5108 0.4257 0.3857 0.4055 0.4673 0.4673 0.3285 0.3285
27 0.2921 0.3472 0.2400 0.4055 0.4888 0.5333 0.2400 0.3662 0.2231 0.3857 0.3472
28 0.4055 0.3857 0.4257 0.4463 0.4055 0.5333 0.4673 0.4055 0.3285 0.5563 0.3857
29 0.5563 0.5798 0.4463 0.5108 0.3102 0.4673 0.4463 0.5563 0.4257 0.4888 0.4888
30 0.3857 0.3285 0.3662 0.3472 0.2744 0.5563 0.4055 0.5108 0.3857 0.4463 0.4463
31 0.2231 0.2744 0.2400 0.4055 0.4888 0.4463 0.1431 0.3662 0.3285 0.2400 0.3472
32 0.4257 0.4463 0.4055 0.2744 0.4673 0.4257 0.4055 0.3102 0.3857 0.4055 0.4055
33 0.5563 0.6286 0.5798 0.6039 0.4257 0.4673 0.5333 0.3857 0.4257 0.4463 0.4888
34 0.4673 0.4463 0.3285 0.3857 0.4257 0.3472 0.4888 0.4257 0.2400 0.2921 0.5333
35 0.4257 0.3662 0.4888 0.4257 0.4257 0.4673 0.4888 0.4257 0.3857 0.4055 0.5798
36 0.2744 0.3285 0.3285 0.3472 0.5108 0.3472 0.4055 0.3857 0.3102 0.2921 0.4463
37 0.4673 0.4673 0.7340 0.4673 0.5333 0.6286 0.3472 0.5108 0.6286 0.4257 0.3102
38 0.5108 0.5333 0.4055 0.3472 0.4257 0.2744 0.5333 0.3472 0.4257 0.4055 0.5333
39 0.4673 0.4888 0.4055 0.3857 0.5108 0.3472 0.4888 0.3472 0.4257 0.5333 0.5333
40 0.3662 0.3102 0.3102 0.3662 0.4463 0.2570 0.4673 0.3285 0.3662 0.3472 0.4257
41 0.7066 0.6799 0.5798 0.4257 0.3102 0.3102 0.5798 0.4673 0.5108 0.5798 0.4888
42 0.4673 0.4463 0.4888 0.3472 0.3472 0.3472 0.4055 0.3857 0.5108 0.5798 0.3662
43 0.5333 0.5108 0.4257 0.4055 0.3662 0.2921 0.4673 0.4055 0.4055 0.4257 0.5108
44 0.3472 0.3662 0.3662 0.3857 0.4257 0.2400 0.4463 0.3857 0.3102 0.3285 0.4055
45 0.5333 0.5108 0.4673 0.4463 0.3285 0.3662 0.4257 0.4888 0.4463 0.6039 0.4673
46 0.3662 0.3857 0.3857 0.3285 0.4055 0.3662 0.2744 0.3662 0.4463 0.3857 0.5108
47 0.7340 0.7066 0.7066 0.8518 0.5333 0.7340 0.7066 0.8518 0.6286 0.6039 0.8210
48 0.5333 0.5108 0.6039 0.5798 0.4888 0.6286 0.5108 0.6286 0.5333 0.5563 0.6039
49 0.7066 0.6286 0.6799 0.7621 0.6039 0.6039 0.6286 0.7066 0.6539 0.5333 0.6799
50 0.6286 0.6539 0.5563 0.6799 0.5798 0.4888 0.4673 0.7340 0.5798 0.4257 0.6539
51 0.3662 0.3472 0.4257 0.4888 0.5333 0.5333 0.5563 0.4888 0.3662 0.4673 0.5108
52 0.3857 0.3662 0.3662 0.5108 0.5563 0.6039 0.4888 0.6539 0.4673 0.4463 0.5798
53 0.4463 0.4257 0.4257 0.5333 0.5798 0.6286 0.5563 0.5798 0.4055 0.4673 0.5563
54 0.3662 0.3472 0.3857 0.5798 0.6286 0.6286 0.4257 0.5333 0.4055 0.4257 0.5563
55 0.4257 0.4463 0.4888 0.4673 0.3472 0.5563 0.5333 0.6539 0.4673 0.5798 0.6799[0078] 续上表
[0079]群体 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33
1 0.7867 0.7067 0.6133 0.5733 0.6667 0.6133 0.5467 0.7333 0.6933 0.6533 0.5733
2 0.7467 0.6933 0.5733 0.5333 0.5733 0.6267 0.6133 0.7200 0.6000 0.6133 0.5600
3 0.7200 0.7200 0.7333 0.5867 0.7333 0.6267 0.6133 0.6667 0.7600 0.6400 0.5867
4 0.7333 0.6800 0.7467 0.5733 0.7467 0.6933 0.5733 0.6800 0.7467 0.6800 0.5733
5 0.6667 0.6933 0.6800 0.6133 0.6800 0.6800 0.5333 0.6133 0.6800 0.5600 0.6133
6 0.5733 0.6800 0.6933 0.6800 0.6400 0.6400 0.5733 0.5733 0.6133 0.5200 0.6533
7 0.6933 0.6133 0.6267 0.6667 0.6533 0.6000 0.6133 0.7200 0.6267 0.5600 0.6133
8 0.7200 0.7200 0.5467 0.5867 0.6000 0.6267 0.6400 0.6400 0.6267 0.6400 0.7733
9 0.7600 0.7067 0.7200 0.5733 0.7467 0.6933 0.6533 0.6800 0.7733 0.6800 0.6267
10 0.7200 0.7200 0.6800 0.5333 0.6800 0.6000 0.4800 0.6933 0.7333 0.5867 0.5867
11 0.6933 0.7200 0.6800 0.5600 0.7067 0.6800 0.4800 0.6667 0.7333 0.6400 0.6400
12 0.7067 0.7867 0.8000 0.6800 0.7467 0.6667 0.5733 0.6800 0.8000 0.6533 0.5733
13 0.7200 0.8000 0.8133 0.6400 0.7067 0.6800 0.5600 0.7200 0.7600 0.6400 0.5333
14 0.7200 0.7467 0.8133 0.5867 0.7867 0.6533 0.6400 0.6933 0.7867 0.6667 0.5600
15 0.7333 0.8400 0.6400 0.6000 0.6667 0.6400 0.6000 0.7067 0.6667 0.7600 0.5467
16 0.7867 0.7067 0.6400 0.6533 0.6133 0.6667 0.7333 0.7600 0.6133 0.6267 0.6533
17 0.6800 0.8133 0.6400 0.6800 0.5867 0.5867 0.6267 0.5733 0.6400 0.6533 0.6267
18 0.7200 0.6667 0.7067 0.6667 0.7867 0.6267 0.6400 0.6667 0.8667 0.6667 0.5867
19 0.7067 0.8933 0.6933 0.6267 0.6933 0.6667 0.5733 0.6000 0.6933 0.7333 0.6800
20 0.7867 0.8133 0.8000 0.6267 0.8000 0.7200 0.6533 0.6800 0.7200 0.6800 0.6533
21 0.6933 0.7200 0.7600 0.7200 0.6800 0.5733 0.6133 0.6400 0.7867 0.6667 0.6400
22 0.7467 0.8800 0.8133 0.7200 0.7067 0.6800 0.6133 0.6400 0.7067 0.6667 0.6133
23 **** 0.7867 0.7467 0.6533 0.6933 0.7467 0.6800 0.8133 0.7200 0.7333 0.6000
24 0.2400 **** 0.7200 0.6533 0.6667 0.7200 0.6267 0.6800 0.6667 0.7067 0.6533
25 0.2921 0.3285 **** 0.6933 0.8133 0.7067 0.6133 0.6933 0.7867 0.6400 0.5867
26 0.4257 0.4257 0.3662 **** 0.6667 0.6400 0.7600 0.5733 0.6667 0.6000 0.6000
27 0.3662 0.4055 0.2066 0.4055 **** 0.6533 0.6133 0.6933 0.7867 0.6667 0.5867
28 0.2921 0.3285 0.3472 0.4463 0.4257 **** 0.7200 0.6933 0.5733 0.6133 0.6667
29 0.3857 0.4673 0.4888 0.2744 0.4888 0.3285 **** 0.6267 0.6400 0.6000 0.6267
30 0.2066 0.3857 0.3662 0.5563 0.3662 0.3662 0.4673 **** 0.6933 0.6800 0.5467
31 0.3285 0.4055 0.2400 0.4055 0.2400 0.5563 0.4463 0.3662 **** 0.6667 0.4800
32 0.3102 0.3472 0.4463 0.5108 0.4055 0.4888 0.5108 0.3857 0.4055 **** 0.6000
33 0.5108 0.4257 0.5333 0.5108 0.5333 0.4055 0.4673 0.6039 0.7340 0.5108 ****
34 0.4257 0.3857 0.4055 0.4673 0.3662 0.4888 0.3857 0.4673 0.4888 0.3472 0.3472
35 0.4257 0.4673 0.5798 0.5108 0.5333 0.5333 0.5563 0.3857 0.4888 0.4257 0.4673
36 0.4257 0.3857 0.3662 0.4257 0.4463 0.4888 0.5108 0.5108 0.3285 0.3472 0.4673
37 0.5563 0.3857 0.6286 0.5563 0.5333 0.6286 0.5108 0.5563 0.5798 0.3472 0.3472
38 0.6039 0.4257 0.6799 0.6039 0.4888 0.5798 0.5563 0.5563 0.4888 0.3857 0.3857
39 0.6039 0.4257 0.6799 0.6039 0.4888 0.5798 0.5563 0.5563 0.4888 0.3857 0.3857
40 0.4888 0.2570 0.4257 0.5333 0.5563 0.4673 0.5798 0.4463 0.4673 0.4888 0.4888
41 0.4257 0.4257 0.6799 0.4257 0.5333 0.5798 0.3472 0.5108 0.6286 0.4257 0.3857
42 0.3472 0.3472 0.6286 0.5563 0.5333 0.5333 0.6039 0.3472 0.4055 0.3857 0.6039
43 0.5333 0.4055 0.5563 0.5333 0.5108 0.5563 0.4463 0.4888 0.5108 0.4055 0.4055
44 0.4257 0.3472 0.4055 0.4673 0.4463 0.4463 0.5563 0.4673 0.4055 0.3857 0.5108
45 0.4055 0.4055 0.6039 0.6286 0.4673 0.5108 0.4888 0.4055 0.5108 0.4055 0.4888
46 0.4055 0.4055 0.5108 0.4888 0.4673 0.4257 0.4888 0.4463 0.3857 0.3285 0.4888
47 0.6286 0.7911 0.7066 0.7340 0.8835 0.6539 0.7340 0.6286 0.7066 0.7340 0.5798
48 0.4888 0.5798 0.6039 0.6799 0.7066 0.7066 0.5798 0.5333 0.4673 0.5798 0.6799
49 0.6539 0.6539 0.7340 0.6539 0.7340 0.7911 0.6539 0.6539 0.5333 0.8210 0.5563
50 0.6286 0.6286 0.5563 0.5798 0.5108 0.7066 0.6286 0.6286 0.4257 0.6799 0.5798
51 0.4888 0.4888 0.3857 0.6286 0.6039 0.5563 0.6799 0.4888 0.4257 0.5798 0.6799
52 0.7066 0.6039 0.4055 0.5563 0.4055 0.6799 0.6539 0.5108 0.3662 0.6539 0.8835
53 0.4888 0.5333 0.3857 0.6286 0.4673 0.6539 0.7911 0.4055 0.3472 0.5333 0.7340
54 0.6286 0.5798 0.4257 0.5798 0.4257 0.6539 0.6799 0.5333 0.3857 0.5798 0.6799
55 0.3857 0.5563 0.5333 0.6039 0.6286 0.5798 0.6039 0.4257 0.5333 0.6539 0.6539[0080] 续上表
[0081]群体 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44
1 0.6533 0.6800 0.6533 0.6533 0.6267 0.6533 0.6667 0.6533 0.7867 0.6133 0.6800
2 0.5600 0.6133 0.5067 0.6400 0.5867 0.5867 0.6000 0.6400 0.7200 0.5467 0.5333
3 0.6400 0.5867 0.6133 0.5867 0.6400 0.6667 0.6267 0.5867 0.6933 0.6533 0.6133
4 0.6800 0.6000 0.6000 0.5467 0.6267 0.6267 0.6133 0.5733 0.6267 0.6400 0.6267
5 0.5333 0.6400 0.5600 0.4800 0.5067 0.5600 0.5733 0.5333 0.6933 0.5200 0.5067
6 0.6267 0.6533 0.5467 0.5733 0.6533 0.6267 0.6133 0.5733 0.6000 0.6133 0.5200
7 0.6133 0.7200 0.5600 0.6133 0.5867 0.5600 0.5467 0.6133 0.6667 0.5467 0.4500
8 0.6400 0.6933 0.5867 0.7467 0.6933 0.6667 0.5733 0.7200 0.6933 0.6267 0.5600
9 0.6267 0.6533 0.7067 0.6000 0.5733 0.6267 0.5600 0.5467 0.6267 0.5600 0.6267
10 0.5600 0.6133 0.6667 0.5333 0.5333 0.6133 0.6267 0.5067 0.6667 0.5200 0.6667
11 0.6133 0.6667 0.6933 0.4800 0.5600 0.6133 0.6533 0.5333 0.6667 0.6000 0.6667
12 0.6267 0.6533 0.7600 0.4933 0.6000 0.6267 0.6933 0.4933 0.6267 0.5867 0.7067
13 0.6400 0.6933 0.7200 0.4800 0.5867 0.6133 0.7333 0.5067 0.6400 0.6000 0.6933
14 0.7200 0.6133 0.7200 0.5600 0.6667 0.6667 0.7333 0.5600 0.6133 0.6533 0.6933
15 0.6800 0.6533 0.7067 0.6533 0.7067 0.6800 0.6933 0.6533 0.7067 0.6667 0.6800
16 0.6533 0.6533 0.6000 0.7067 0.6533 0.6000 0.6400 0.7333 0.7067 0.6933 0.6533
17 0.7067 0.6267 0.7067 0.7333 0.7600 0.7067 0.7733 0.7333 0.7067 0.7467 0.7867
18 0.6133 0.6133 0.6667 0.5333 0.5867 0.6133 0.6267 0.5600 0.6667 0.6267 0.6400
19 0.6533 0.6533 0.6800 0.6267 0.7067 0.7067 0.7200 0.6267 0.6800 0.6667 0.6800
20 0.7867 0.6800 0.7333 0.6000 0.6533 0.6533 0.6933 0.6000 0.6000 0.6667 0.7333
21 0.7467 0.6667 0.7467 0.5600 0.6667 0.5867 0.7067 0.5600 0.5600 0.6533 0.7200
22 0.5867 0.5600 0.6400 0.5600 0.5867 0.5867 0.6533 0.6133 0.6933 0.6000 0.6667
23 0.6533 0.6533 0.6533 0.6267 0.5733 0.5467 0.6133 0.6533 0.7067 0.5867 0.6533
24 0.6800 0.6267 0.6800 0.6267 0.6800 0.6533 0.7733 0.6533 0.7067 0.6667 0.7067
25 0.6667 0.5600 0.6933 0.4800 0.5333 0.5067 0.6533 0.5067 0.5333 0.5733 0.6667
26 0.6267 0.6000 0.6533 0.6267 0.5733 0.5467 0.5867 0.6533 0.5733 0.5867 0.6267
27 0.6933 0.5867 0.6400 0.5867 0.5867 0.6133 0.5733 0.5867 0.5867 0.6000 0.6400
28 0.6133 0.5867 0.6133 0.5333 0.5333 0.5600 0.6267 0.5600 0.5867 0.5733 0.6400
29 0.6800 0.5733 0.6000 0.7067 0.6000 0.5733 0.5600 0.7067 0.5467 0.6400 0.5733
30 0.6267 0.6800 0.6000 0.6000 0.5733 0.5733 0.6400 0.6000 0.7067 0.6133 0.6267
31 0.6133 0.6133 0.7200 0.5333 0.5600 0.6133 0.6267 0.5333 0.6667 0.6000 0.6667
32 0.7067 0.6533 0.7067 0.6533 0.7067 0.6800 0.6133 0.6533 0.6800 0.6667 0.6800
33 0.7067 0.6267 0.6267 0.7333 0.7067 0.6800 0.6133 0.6800 0.5467 0.6667 0.6000
34 **** 0.7867 0.7867 0.7333 0.8400 0.7600 0.7733 0.7067 0.5733 0.8267 0.7600
35 0.2400 **** 0.7333 0.7067 0.7333 0.7067 0.6933 0.7067 0.7067 0.7467 0.6533
36 0.2400 0.3102 **** 0.6000 0.7067 0.7067 0.8000 0.5733 0.6000 0.6933 0.8400
37 0.3102 0.3472 0.5108 **** 0.8133 0.7867 0.6400 0.9200 0.7067 0.7467 0.5733
38 0.1744 0.3102 0.3472 0.2066 **** 0.8667 0.7733 0.7600 0.6800 0.9333 0.7333
39 0.2744 0.3472 0.3472 0.2400 0.1431 **** 0.7733 0.7333 0.7333 0.8267 0.7067
40 0.2570 0.3662 0.2231 0.4463 0.2570 0.2570 **** 0.6400 0.6667 0.7867 0.8267
41 0.3472 0.3472 0.5563 0.0834 0.2744 0.3102 0.4463 **** 0.7600 0.7733 0.5733
42 0.5563 0.3472 0.5108 0.3472 0.3857 0.3102 0.4055 0.2744 **** 0.7200 0.6533
43 0.1904 0.2921 0.3662 0.2921 0.0690 0.1904 0.2400 0.2570 0.3285 **** 0.7733
44 0.2744 0.4257 0.1744 0.5563 0.3102 0.3472 0.1904 0.5563 0.4257 0.2570 ****
45 0.3285 0.3285 0.4463 0.2570 0.2921 0.2231 0.3472 0.2231 0.1586 0.2744 0.3285
46 0.3285 0.3285 0.3285 0.3662 0.2231 0.2921 0.3102 0.3285 0.2570 0.2066 0.2921
47 0.5798 0.6286 0.5798 0.5798 0.5798 0.5798 0.6539 0.6799 0.6799 0.6039 0.5798
48 0.5333 0.5333 0.4463 0.6799 0.6286 0.5333 0.5108 0.6286 0.4463 0.5108 0.4463
49 0.5563 0.5108 0.6039 0.6039 0.7066 0.5563 0.4888 0.6039 0.5108 0.6286 0.6539
50 0.4888 0.6286 0.5333 0.6799 0.6286 0.5798 0.5563 0.7340 0.6286 0.5563 0.4888
51 0.4888 0.3662 0.4463 0.8518 0.5798 0.5798 0.4673 0.9163 0.6286 0.5563 0.4055
52 0.4673 0.4257 0.4673 0.7621 0.5563 0.5563 0.4463 0.8210 0.6539 0.5333 0.4257
53 0.5333 0.4055 0.4463 0.7911 0.6286 0.5798 0.4673 0.7911 0.5798 0.6039 0.4888
54 0.4463 0.3285 0.4463 0.7911 0.5333 0.4888 0.4673 0.8518 0.6286 0.5108 0.4055
55 0.5108 0.3472 0.4257 0.6039 0.5563 0.6039 0.4888 0.6539 0.5108 0.5333 0.4257[0082] 续上表
[0083]
[0084] 说明:*上为遗传相似度(I);*下为遗传距离(D);附录Ⅷ编号1-55对应正文中表1[0085] 以上结果表明了扁桃各品种之间的亲缘关系及遗传变异情况。