一种嗜热β-葡萄糖苷酶突变体-M36N及其编码基因和应用转让专利

申请号 : CN201610060528.7

文献号 : CN105567662B

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发明人 : 姚斌柏映国夏伟石鹏君罗会颖黄火清王亚茹苏小运王苑

申请人 : 中国农业科学院饲料研究所

摘要 :

本发明涉及基因工程和遗传工程领域,具体地,本发明涉及一种嗜热β‑葡萄糖苷酶突变体M36N及其编码基因和应用。本发明提供的突变体是通过改变酶蛋白的催化口袋loop特殊氨基酸残基的极性构建自嗜热真菌篮状菌Talaromyces leycettanus JCM12802的高温酸性β‑葡萄糖苷酶BGL3A。在此改造条件下,突变体的对纤维二糖的亲和力比野生型(突变前)提高2.2倍,催化效率提高2.3倍,且最适反应pH值和温度不变。

权利要求 :

1.一种高催化效率β-葡萄糖苷酶突变体,其特征在于,所述β-葡萄糖苷酶突变体的氨基酸序列如SEQ ID NO.1所示。

2.高催化效率β-葡萄糖苷酶突变体基因,其特征在于,编码权利要求1所述高催化效率β-葡萄糖苷酶突变体。

3.根据权利要求2所述的高催化效率β-葡萄糖苷酶突变体基因,其特征在于,其核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示。

4.包含权利要求2所述高催化效率β-葡萄糖苷酶突变体基因的重组载体。

5.包含权利要求2所述高催化效率β-葡萄糖苷酶突变体基因的重组载体pPIC9r-A-M36N,将所述高催化效率β-葡萄糖苷酶突变体基因插入到质粒pPIC9r上的EcoR I和Not I限制性酶切位点之间,得到重组载体pPIC9r-A-M36N。

6.包含权利要求2所述高催化效率β-葡萄糖苷酶突变体基因的重组菌株。

7.根据权利要求6所述的重组菌株,其特征在于,所述重组菌株为重组毕赤酵母GS115。

8.一种制备高催化效率β-葡萄糖苷酶的方法,包括以下步骤:

1)用权利要求4所述重组载体转化宿主细胞,得重组菌株;

2)培养重组菌株,诱导重组β-葡萄糖苷酶的表达;

3)回收并纯化所表达的高催化效率β-葡萄糖苷酶。

9.权利要求1所述高催化效率β-葡萄糖苷酶突变体用于降解纤维二糖的应用。

说明书 :

一种嗜热β-葡萄糖苷酶突变体-M36N及其编码基因和应用

技术领域

[0001] 本发明涉及基因工程和遗传工程领域,具体地,本发明涉及一种嗜热β-葡萄糖苷酶突变体M36N及其编码基因和应用。

背景技术

[0002] 当今,以木质纤维素为原料、用纤维素酶水解纤维素生成葡萄糖,进而发酵为燃料乙醇成为应对当今世界能源危机、环境污染等问题的重要出路。纤维素的降解是三类酶协同作用的结果,包括:内切纤维素酶(endo-1,4-β-D-glucanase,EC 3.2.1.4,简称EG),这类酶首先作用于纤维素分子内部的非结晶区,随机水解β-1,4-糖苷键,将长链纤维素分子切割产生大量带非还原性末端的小分子纤维素;外切纤维素酶(exo-1,4-β-D-glucanase或cellobiohydrolase,EC3.2.1.91,简称CBH),这类酶作用于纤维素线状分子末端,水解β-1,4糖苷键,每次降解产生一个纤维二糖分子;β-葡糖苷酶(β-D-glucosidase,EC 3.2.1.21,简称BG),这类酶作用于纤维二糖或纤维寡糖的非还原端,产生葡萄糖分子。其中BG通常不直接作用于纤维素,但是它可以降解对纤维素降解起抑制作用的纤维二糖,所以它是快速降解纤维素过程中所必须的酶类。因此对β-葡萄糖苷酶的深入研究受到人们越来越多的关注,特别是β-葡萄糖苷酶的分子改良研究。
[0003] 本发明针对酶分子具体结构进行分析和改良,以达到提高催化效率的目的。本发明所提供的高温酸性β-葡萄糖苷酶突变体对于纤维二糖底物的催化效率得到了极大地提高。

发明内容

[0004] 本发明的目的是提供了一种高催化效率β-葡萄糖苷酶突变体M36N。
[0005] 本发明的再一目的是提供编码上述高催化效率β-葡萄糖苷酶突变体M36N的基因。
[0006] 本发明的再一目的是提供包含上述突变体基因的重组载体。
[0007] 本发明的另一目的是提供包含上述基因的重组菌株。
[0008] 本发明以来源于嗜热真菌篮状菌Talaromyces leycettanus JCM12802的酸性β-葡萄糖苷酶为母本,采用分子生物学技术对酸性β-葡萄糖苷酶序列进行区域替换后表达。
[0009] 根据本发明的高催化效率β-葡萄糖苷酶突变体,是β-葡萄糖苷酶的催化活性通道loop区域替换后得到的突变体,即β-葡萄糖苷酶的36位氨基酸由甲硫氨酸“M”突变为天冬酰胺“N”
[0010] 所述高催化效率β-葡萄糖苷酶突变体的氨基酸序列如SEQ ID NO.1所示。
[0011] YGFGGSGWDAAYGRAKAALNKLNQTEKVGIVTGVKWNGGPCVGNTYKPSSIDYPSLCLQDSPLGVRFANPVTAFPAGINAGATWDRSLINARGAAMGAEAKGLGVNVQLGPVAGPLGKNPNSGRIWEGFSNDPYLSGVAMEETIAGMQGSGVQACAKHYIGNEQEHNRETISSNIDDRTLHELYVWPFMNAVKANVASVMCSYNEVNGSWSCENDALLNGLLKTELGFPGYIMSDWNAQHTTVNSANSGLDMTMPGSDFNNPPGSIYWGPNLEAAVANGSVPQSRLDDMVTRILASWYLVGQDEGYPPVAFSSWNGGKANVDVTGDHKSVVRAVARDSIVLLKNDNNALPLRKPKSLAIIGQDATVNPAGPNACSDRGCDTGTLAMGWGSGTAQFPYIVGPLDAIQSQAAADGTNITTSTTDDTTAAASAAASAGTAIVFINSDSGEGYITVEGNAGDRNNLDPWHNGNELVQAVAAVNKNVIVVVHSVGPVILEAILAQPNVKAIVWPGLPGQESGNALVDVLYGSTSPSGKLPYTIAKQFSDYGTTWTTSLVDDFTEGLFIDYRHFDENNITPRYEFGYGLSYTTFKYSDLDVNVQARPGAAEGPIVPGGVKELFDTVGTVTVTVQNSGKVAGAEVAQLYIGLPDSAPSTPPKQLRGFQKLHLAPGQREGATFELTRRDISYWDVQQQKWVVPSGTFKVYVGSSSRDIREQGSFRI
[0012] 所述高催化效率β-葡萄糖苷酶突变体的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示。
[0013] TATGGCTTCGGCGGCTCTGGCTGGGACGCCGCTTATGGCAGAGCAAAGGCTGCGCTGAACAAGCTCAACCAGACCGAGAAGGTTGGTATCGTCACCGGTGTCAAGTGGAACGGCGGCCCTTGTGTTGGCAACACCTACAAGCCCAGTTCGATTGACTACCCTTCTCTGTGTTTGCAAGACTCTCCTCTCGGGGTGCGTTTTGCCAACCCTGTGACTGCCTTCCCGGCTGGTATCAACGCCGGCGCCACATGGGATAGATCTCTCATCAACGCCCGTGGTGCGGCCATGGGCGCTGAGGCCAAGGGCCTCGGTGTGAACGTCCAGCTTGGCCCCGTCGCTGGTCCTCTCGGCAAGAATCCCAATAGTGGCAGAATCTGGGAAGGGTTCTCGAATGATCCCTATCTCAGCGGTGTTGCGATGGAGGAAACCATCGCCGGAATGCAAGGATCTGGTGTGCAGGCCTGCGCCAAGCACTATATTGGTAACGAGCAAGAGCACAACCGTGAAACCATCAGCTCCAACATCGATGACCGCACTCTGCACGAGCTCTACGTCTGGCCGTTCATGAACGCCGTCAAGGCCAACGTCGCCTCCGTCATGTGCTCGTACAACGAGGTCAATGGTTCCTGGTCCTGTGAGAATGATGCTCTTCTCAACGGTCTGTTGAAGACTGAGCTCGGATTCCCCGGATACATCATGAGCGATTGGAACGCGCAGCACACCACGGTCAACAGCGCCAACTCGGGTCTCGATATGACCATGCCTGGCAGTGACTTCAACAACCCTCCTGGCAGCATCTACTGGGGGCCCAACCTCGAAGCCGCCGTCGCCAATGGCTCCGTTCCGCAGTCCCGTTTGGACGACATGGTCACTCGTATCCTTGCGTCTTGGTACTTGGTTGGCCAGGATGAGGGCTACCCACCGGTCGCCTTCAGCTCCTGGAATGGCGGCAAGGCCAATGTTGACGTGACGGGCGATCACAAGAGCGTCGTCAGAGCTGTGGCTCGTGACTCTATCGTTCTTCTGAAGAACGACAATAACGCTTTGCCTCTGCGCAAGCCCAAGAGCCTCGCGATCATCGGCCAGGATGCAACTGTCAACCCTGCCGGGCCCAACGCTTGCTCTGATCGCGGCTGCGACACCGGTACTCTCGCCATGGGTTGGGGCAGTGGTACCGCTCAGTTCCCATACATCGTCGGCCCTCTCGATGCTATCCAGTCTCAGGCTGCCGCTGATGGCACTAACATCACCACCAGCACGACCGATGATACCACCGCGGCAGCTTCTGCAGCCGCCTCCGCCGGAACCGCCATCGTCTTCATCAACTCCGACTCTGGTGAAGGTTACATCACCGTCGAGGGCAACGCTGGTGACCGCAACAACCTCGACCCCTGGCACAACGGCAACGAGCTCGTCCAGGCCGTTGCGGCTGTGAACAAGAATGTCATTGTCGTTGTCCACAGCGTCGGTCCCGTGATCTTGGAGGCTATCCTTGCACAGCCCAACGTCAAGGCCATTGTGTGGCCCGGTCTCCCTGGACAAGAGAGCGGCAATGCCCTGGTCGATGTTCTGTACGGCTCCACCTCCCCCAGCGGCAAGTTGCCCTATACCATTGCCAAGCAGTTCAGCGACTATGGCACCACCTGGACGACCTCCCTGGTCGATGACTTCACCGAGGGTCTGTTCATTGACTACCGCCACTTTGACGAGAACAACATTACTCCCAGATACGAGTTCGGATACGGCTTGTCTTACACCACCTTCAAATACTCCGACCTGGACGTCAACGTCCAGGCCCGCCCCGGCGCAGCCGAAGGCCCCATCGTCCCCGGCGGCGTCAAGGAACTTTTCGACACCGTCGGCACCGTCACCGTCACCGTCCAGAACAGCGGCAAGGTTGCCGGCGCGGAAGTTGCCCAGCTGTACATCGGCCTTCCCGACTCTGCCCCGTCGACCCCTCCCAAGCAGCTCAGAGGATTCCAGAAGTTGCACCTCGCGCCCGGCCAGAGAGAGGGCGCCACTTTCGAACTCACCCGCCGAGACATCAGCTACTGGGACGTTCAGCAGCAGAAGTGGGTTGTTCCTAGCGGTACGTTCAAGGTCTATGTTGGAAGCTCGAGCAGGGACATTAGGGAGCAGGAATCTTTCCGTATTTGA
[0014] 本发明还是提供一种制备高催化效率β-葡萄糖苷酶的方法:
[0015] 1)采用over-lap PCR的方法扩增高催化效率β-葡萄糖苷酶突变体基因序列;
[0016] 2)将催化效率β-葡萄糖苷酶突变体序列片段克隆到表达载体pPIC 9r上,重组载体命名pPIC9r-A-M36N;
[0017] 3)将突变体重组载体转化毕赤酵母GS115,诱导表达,获得突变株,优选为GS115/A-M36N。
[0018] 本发明还提供了包含上述β-葡萄糖苷酶突变体基因的重组载体,优选为pPIC9r-A-M36N。将本发明的β-葡萄糖苷酶突变体基因插入到表达载体合适的限制性酶切位点之间,使其核苷酸序列可操作的与表达调控序列相连接。作为本发明的一个最优选的实施方案,优选为将β-葡萄糖苷酶基因插入到质粒pPIC9r上的EcoR I和Not I限制性酶切位点之间,得到重组表达质粒pPIC9r-A-M36N。
[0019] 本发明还提供了包含上述β-葡萄糖苷酶基因的重组菌株,优选为重组菌株GS115/A-M36N。
[0020] 本发明还提供了上述高催化效率β-葡萄糖苷酶突变体的应用,例如在果蔬汁工业中的应用。
[0021] 本发明首先所要解决的技术问题是克服现有技术的不足,提供一种性质优良的、适合于在食品工业中应用新的β-葡萄糖苷酶。本发明的重组高催化效率β-葡萄糖苷酶突变体最适pH为4.5,最适温度为75℃,与野生型的一致,但是亲和力比野生型提高2.2倍,催化效率提高2.3倍。

附图说明

[0022] 图1:高催化效率β-葡萄糖苷酶突变体与野生型的最适pH。
[0023] 图2:高催化效率β-葡萄糖苷酶突变体与野生型的最适温度。

具体实施方式

[0024] 试验材料和试剂
[0025] 1、菌株及载体:表达宿主Pichiapastoris GS115,表达质粒载体pPIC9r为本实验室保存。
[0026] 2、酶类及其它生化试剂:内切酶购自Fermentas公司,连接酶购自Promaga公司,纤维二糖购自Sigma公司。其它都为国产分析纯试剂(均可从普通生化试剂公司购买得到)。
[0027] 3、培养基:
[0028] (1)LB培养基:0.5%酵母提取物,1%蛋白胨,1%NaCl,pH 7.0
[0029] (2)YPD培养基:1%酵母提取物,2%蛋白胨,2%葡萄糖
[0030] (3)MD固体培养基:2%葡萄糖,1.5%琼脂糖,1.34%YNB,0.00004%Biotin[0031] (4)MM固体培养基:1.5%琼脂糖,1.34%YNB,0.00004%Biotin,0.5%甲醇[0032] (5)BMGY培养基:1%酵母提取物,2%蛋白胨,1%甘油(V/V),1.34%YNB,0.00004%Biotin
[0033] (6)BMMY培养基:1%酵母提取物,2%蛋白胨,1.34%YNB,0.00004%Biotin,0.5%甲醇(V/V)
[0034] 实施例1高催化效率β-葡萄糖苷酶突变体编码基因A-M36N的克隆
[0035] 本发明以来源于嗜热真菌篮状菌Talaromyces leycettanus JCM12802的酸性β-葡萄糖苷酶(其氨基酸序列如SEQ ID NO.3)为母本,采用分子生物学技术对酸性β-葡萄糖苷酶序列进行区域替换后表达。
[0036] SEQ ID NO.3如下所示:
[0037] YGFGGSGWDAAYGRAKAALNKLNQTEKVGIVTGVKWMGGPCVGNTYKPSSIDYPSLCLQDSPLGVRFANPVTAFPAGINAGATWDRSLINARGAAMGAEAKGLGVNVQLGPVAGPLGKNPNSGRIWEGFSNDPYLSGVAMEETIAGMQGSGVQACAKHYIGNEQEHNRETISSNIDDRTLHELYVWPFMNAVKANVASVMCSYNEVNGSWSCENDALLNGLLKTELGFPGYIMSDWNAQHTTVNSANSGLDMTMPGSDFNNPPGSIYWGPNLEAAVANGSVPQSRLDDMVTRILASWYLVGQDEGYPPVAFSSWNGGKANVDVTGDHKSVVRAVARDSIVLLKNDNNALPLRKPKSLAIIGQDATVNPAGPNACSDRGCDTGTLAMGWGSGTAQFPYIVGPLDAIQSQAAADGTNITTSTTDDTTAAASAAASAGTAIVFINSDSGEGYITVEGNAGDRNNLDPWHNGNELVQAVAAVNKNVIVVVHSVGPVILEAILAQPNVKAIVWPGLPGQESGNALVDVLYGSTSPSGKLPYTIAKQFSDYGTTWTTSLVDDFTEGLFIDYRHFDENNITPRYEFGYGLSYTTFKYSDLDVNVQARPGAAEGPIVPGGVKELFDTVGTVTVTVQNSGKVAGAEVAQLYIGLPDSAPSTPPKQLRGFQKLHLAPGQREGATFELTRRDISYWDVQQQKWVVPSGTFKVYVGSSSRDIREQGSFRI
[0038] 以Talaromyces leycettanus JCM12802基因组DNA为模板,在β-葡萄糖苷酶的催化活性通道loop区域处设计区域替换引物,采用over-lap PCR的方法扩增高催化效率β-葡萄糖苷酶突变体编码基因A-M36N。
[0039] 表1.高催化效率β-葡萄糖苷酶突变体PG63X特异性引物
[0040]
[0041]
[0042] 实施例2高催化效率β-葡萄糖苷酶突变体的制备。
[0043] 将表达载体pPIC9r进行双酶切(EcoR I+Not I),同时将编码高催化效率β-葡萄糖苷酶突变体的基因A-M36N双酶切(EcoR I+Not I),切好的编码成熟高催化效率β-葡萄糖苷酶突变体的基因片段与表达载体pPIC9r连接,获得含有高催化效率β-葡萄糖苷酶突变体基因A-M36N的重组质粒pPIC9r-A-M36N并转化毕赤酵母GS115,获得重组酵母菌株GS115/A-M36N。
[0044] 取含有重组质粒的GS115菌株,接种于300mL BMGY培养基的1L三角瓶中,置于30℃,220rpm摇床培养48h;后将培养液3000g离心5min,弃上清,沉淀用100mL含有0.5%甲醇的BMMY培养基重悬,并再次置于30℃,220rpm条件下诱导培养。每隔12h补加0.5mL甲醇,使菌液中的甲醇浓度保持在0.5%,同时取上清用于酶活性检测。
[0045] 重组高催化效率β-葡萄糖苷酶突变体最适pH为4.5,最适温度为75℃,与野生型的一致,但是亲和力比野生型提高2.2倍,催化效率提高2.3倍。
[0046] 实施例3重组高催化效率β-葡萄糖苷酶突变体和野生型的活性分析[0047] β-葡萄糖苷酶活性的测定:在405nm下测定酶水解底物pNPG所生成的产物对硝基苯酚(pNP)的量。
[0048] 反应步骤:125μl 2mM pNPG底物与125μl缓冲液混匀,加入250μl适当稀释的酶液,于75℃反应10min,加入1.5mL 1M的Na2CO3终止反应,使用分光光度计测定OD405值。
[0049] 酶活单位的定义:1个β-葡萄糖苷酶活性单位(U)定义为在给定反应条件下,每分钟分解底物pNPG生成1μmol对硝基苯酚(pNP)所需的酶量。
[0050] 实施例4重组β-葡萄糖苷酶高催化效率突变体的性质测定
[0051] 1、重组高催化效率β-葡萄糖苷酶突变体和野生型的最适pH测定方法如下:
[0052] 将实施例2纯化的重组高催化效率β-葡萄糖苷酶突变体和野生型在不同的pH下进行酶促反应以测定其最适pH。底物多聚半乳糖醛酸用不同pH的0.1mol/L柠檬酸-磷酸氢二钠缓冲液中75℃下进行β-葡萄糖苷酶活力测定。结果(图1)表明,重组高催化效率β-葡萄糖苷酶突变体和野生型的最适反应pH一致,且在pH3.0-6.0范围内有相同的作用趋势。符合不改变最适pH值提高催化效率的目的。
[0053] 2、重组高催化效率β-葡萄糖苷酶突变体和野生型的最适温度测定方法如下:
[0054] 重组高催化效率β-葡萄糖苷酶突变体和野生型的最适温度的测定为在0.1mol/L柠檬酸-磷酸氢二钠缓冲液(pH 4.5)缓冲液体系及不同温度下进行酶促反应。酶反应最适温度测定结果(图2)表明,重组高催化效率β-葡萄糖苷酶突变体的最适温度与野生型保持一致(75℃)。
[0055] 3、重组高催化效率β-葡萄糖苷酶突变体和野生型的动力学参数测定方法如下:
[0056] 测定反应的一级反应时间。确定测定Km及Vmax的反应时间为5min。用不同浓度的纤维二糖为底物,在柠檬酸-磷酸氢二钠缓冲液(pH4.5)缓冲液体系中,75℃下测定酶活性,计算出其在75℃下的Km值。突变体及野生酶动力学参数如表2所示:
[0057] 表2.突变体及野生型对纤维二糖酶催化反应动力学参数
[0058]
[0059] 结果显示,重组高催化效率β-葡萄糖苷酶突变体最适pH为4.5,与野生型的一致,但是亲和力比野生型提高2.2倍,催化效率提高2.3倍。