一种甘蔗EST-SSR标记的制备方法及应用转让专利
申请号 : CN201710330651.0
文献号 : CN106916904B
文献日 : 2020-03-06
发明人 : 高轶静 , 周会 , 雷敬超 , 杨翠芳 , 周珊 , 段维兴 , 张保青 , 王泽平 , 张革民
申请人 : 广西壮族自治区农业科学院甘蔗研究所
摘要 :
权利要求 :
1.一种甘蔗EST-SSR标记引物组,其特征在于,所述EST-SSR标记引物为下述引物:EST1-2:上游引物序列:5’-ACCCTCCAGCCACCCTT-3’;下游引物序列:5’-GCATACACCATCCATCCCT-3’;
EST1-5:上游引物序列:5’-AGGCGGGACCGAACAA-3’;下游引物序列:5’-GACCTCATCTGCCGGACTG-3’;
EST1-6:上游引物序列:5’-ATTAGTGGCTCTGCCGTTAT-3’;下游引物序列:5’-CAATGGTAGAGTGAAAGTGGG-3’;
EST1-7:上游引物序列:5’-TCTGCCCAAGACGGTAA-3’;下游引物序列:5’-GCTGCCTGAGTTGCTGA-3’;
EST1-9:上游引物序列:5’-AACCTTCCTTCCGCTCCC-3’;下游引物序列:5’-GAATCTTGACCGCCTTTGG-3’;
EST1-12:上游引物序列:5’-TGCGAGCTGCGATGGA-3’;下游引物序列:5’-GGTTGGGACCTGGGTTG-3’;
EST1-15:上游引物序列:5’-CCAAACCCAAGGCTCA-3’;下游引物序列:5’-ATGCGACTAAAGGTTGAAGA-3’;
EST1-16:上游引物序列:5’-GGAATCCAAGCCAACG-3’;下游引物序列:5’-CCACGGCTGCTCTTCT-3’;
EST1-17:上游引物序列:5’-CCTTCACCTGGAATCGT-3’;下游引物序列:5’-CAAGCCCAACTCCTCAA-3’;
EST1-18:上游引物序列:5’-CATAACCACTTGGACCACC-3’;下游引物序列:5’-CCGTTGACCTGCGAAT-3’;
EST1-19:上游引物序列:5’-GAAGTTGATGCCAGATGGG-3’;下游引物序列:5’-TCCCTTCCTGCCAACTCT-3’;
EST1-21:上游引物序列:5’-CTCGGCGTCACCGTCAT-3’;下游引物序列:5’-GAGGGCTTCTCATCATCACTAG-3’;
EST1-22:上游引物序列:5’-AATCCGCCAGCACCTACCC-3’;下游引物序列:5’-GATCTCGTCGGGCAGGTCC-3’;
EST1-23:上游引物序列:5’-ATTCACTTCACTGCCCAAGC-3’;下游引物序列:5’-TAGGGACGGAGGGAGTAGG-3’;
EST1-24:上游引物序列:5’-ATGGAGGAGGCAAAGAGA-3’;下游引物序列:5’-AATGCGAACAAACAGACG-3’;
EST1-26:上游引物序列:5’-AGGCAAGAACCCCAAGC-3’;下游引物序列:5’-ATTCCACAACCAAAACCC-3’;
EST2-1:上游引物序列:5’-AACCGAACCTGAACTCC-3’;下游引物序列:5’-AGATGCCGACGACCTG-3’;
EST2-2:上游引物序列:5’-TCATCCAACGCCACCG-3’;下游引物序列:5’-ACTGCCCGCACCACATC-3’;
EST2-4:上游引物序列:5’-GCAGCTTTCTCGATTCCC-3’;下游引物序列:5’-CTCCACCAAACCCTCCCT-3’;
EST2-7:上游引物序列:5’-CATTGCTACTCGCATTCACC-3’;下游引物序列:5’-ACCACCAACAGCCTTCTCAT-3’;
EST2-8:上游引物序列:5’-ATCCGGGACCATGAATC-3’;下游引物序列:5’-TTGCCAAACGAACACG-3’;
EST2-9:上游引物序列:5’-GAACCACATCACCCTATACCA-3’;下游引物序列:5’-CAGCAGCTTCCAGTCATCAA-3’;
EST2-10:上游引物序列:5’-CAGGACTCGCTTCTCCG-3’;下游引物序列:5’-CATCATCTTCTTCGGCAAC-3’;
EST2-11:上游引物序列:5’-TAATCTGCTCTGCGTCTCC-3’;下游引物序列:5’-GGTGATCCAGGGCGTGT-3’;
EST2-13:上游引物序列:5’-AAGCATAATCAGGCAAAGG-3’;下游引物序列:5’-GCCAACTCCGTCTCCAC-3’;
EST2-14:上游引物序列:5’-GTGGGCGTGGTAGGGAT-3’;下游引物序列:5’-CTGCTCGTGCTCTTGCTC-3’;
EST2-15:上游引物序列:5’-ACGAGTAGGAGTAGGACGACG-3’;下游引物序列:5’-CCCATAGCCTGCCTGATAG-3’;
EST2-18:上游引物序列:5’-CTGAGAACGAAATGGGTG-3’;下游引物序列:5’-CCACCTTGCTTGGGAC-3’;
EST2-19:上游引物序列:5’-CGTGCTGGAACCGTAA-3’;下游引物序列:5’-GCCGCAGAAACAATCA-3’;
EST2-20:上游引物序列:5’-ATAAGATCCGTGGTAGGGTAA-3’;下游引物序列:5’-AGGGACGAAGGGAGTGC-3’;
EST2-21:上游引物序列:5’-GCGGAGGAGGGAGGACAA-3’;下游引物序列:5’-ATGAGTAGCGACTGTGCGAGTG-3’;
EST2-22:上游引物序列:5’-GTCATTTGAAGCATCAGCATTG-3’;下游引物序列:5’-TGAGGGTGGGAAAGAGCAG-3’;
EST2-23:上游引物序列:5’-CACCAACCCTAGATCCACCC-3’;下游引物序列:5’-ACGGCCCGAGGCAAGT-3’;
EST2-27:上游引物序列:5’-GCCGCAAACCATGCTGAAC-3’;下游引物序列:5’-GAGCATCATCCCTCCATTCACA-3’;
EST2-28:上游引物序列:5’-GCCAGCAAATCTCCCAC-3’;下游引物序列:5’-AAGGCTGAGTTAATAAGATGCA-3’;
EST2-32:上游引物序列:5’-GCGTAACATCTTCTTGCTG-3’;下游引物序列:5’-CGTTGTCGTCCCCACT-3’;
EST2-34:上游引物序列:5’-GCCGCACATCCGTTGG-3’;下游引物序列:5’-GAGGAAGAGGAGTTCGAGGG-3’;
EST2-35:上游引物序列:5’-GGTGATGGTGTCGCTTGTG-3’;下游引物序列:5’-ACCGTGCTGTCCCTGCT-3’;
EST3-3:上游引物序列:5’-ACCGAGTGGAGTAGTAGGC-3’;下游引物序列:5’-GGGTTGGAAGGAGGAAG-3’;
EST4-2:上游引物序列:5’-TCCTTCCCCGACTCTTCTCC-3’;下游引物序列:5’-GCATGAGCTGGCCACGC-3’;
EST4-3:上游引物序列:5’-GGCTTCCAGATTTCCTCTACTT-3’;下游引物序列:5’-GCAACGCAGCATTTCCA-3’;
EST4-5:上游引物序列:5’-GGTCGTTGCTCTTCAGTTGC-3’;下游引物序列:5’-CCTCTTCCGATTCTTTCCTTT-3’;
EST4-6:上游引物序列:5’-CGAATGGCAGGAACGA-3’;下游引物序列:5’-CGCCAGTTGAGGGAGA-3’;
EST4-8:上游引物序列:5’-TGTTCAGCTTGGCTACTGC-3’;下游引物序列:5’-TCCTGATTCCTTCCGTTG-3’;
EST4-9:上游引物序列:5’-CTGGATGACCGCCGTAT-3’;下游引物序列:5’-AGAACAAGTGGCAACAAGC-3’;
EST4-12:上游引物序列:5’-AGTCGTTCTCGGAGCTGTCG-3’;下游引物序列:5’-CCCTGGCGGCAGTTGTT-3’;
EST4-14:上游引物序列:5’-CAGTAGCAGCAACAGTAGTAAC-3’;下游引物序列:5’-TGCTACTACCAACCTCGTC-3’;
EST4-17:上游引物序列:5’-CCCTCGAACTCCTCTTCCTC-3’;下游引物序列:5’-AGGGGTTAGAATAGAACCCATG-3’;
EST4-19:上游引物序列:5’-CAGCCTCTTCTTTCCGTTCA-3’;下游引物序列:5’-TCAAACAGGAGCAGCAGAAAG-3’;
EST4-21:上游引物序列:5’-CTGGCTAACAAACAAGGGAC-3’;下游引物序列:5’-CACCGTCATTGAGACCAGATA-3’。
2.根据权利要求1所述的一种甘蔗EST-SSR标记引物组的应用,其特征在于,所述EST-SSR标记引物组应用于甘蔗和/或甘蔗近缘种属种质资源的遗传多样性分析。
3.根据权利要求1所述的一种甘蔗EST-SSR标记引物组的应用,其特征在于,所述EST-SSR标记引物组应用于甘蔗种质资源的可转移性分析和聚类分析。
4.根据权利要求3所述的一种甘蔗EST-SSR标记引物组的应用,其特征在于,所述甘蔗种质资源优选为桂糖35号。
说明书 :
一种甘蔗EST-SSR标记的制备方法及应用
【技术领域】
2 Guitang15(Saccharum sp.) 华南56-12×内江59-782
3 Guitang18(Saccharum sp.) CP65-357×F172
4 Guitang21(Saccharum sp.) 赣蔗76-65×崖城71-374
5 Guitang28(Saccharum sp.) CP80-1018×CP89-1475
6 Guitang29(Saccharum sp.) 崖城94-46×ROC22
7 Guitang32(Saccharum sp.) 粤糖91-976×ROC1
8 Guitang35(Saccharum sp.) ROC23×CP84-1198
9 Guitang37(Saccharum sp.) 湛蔗92-126×CP72-2086
10 Guitang43(Saccharum sp.) 粤糖85-177×GT92-66
11 Guifu98-296(Saccharum sp.) Guitang91-131经Coγ射线辐照诱变选育而成
12 ROC16(Saccharum sp.) F171×74-575
13 ROC25(Saccharum sp.) 79-6048×69-463
14 Yunzhe06-281(Saccharum sp.) 德蔗93-88×云瑞99-155
15 Yunzhe05-250(Saccharum sp.) 粤农73-204×CP72-1210
16 Badila(S.officinarum)
17 GXS85-30(S.spontaneum)
18 57NG208(S.robustum)
19 Nagans(S.bareri)
20 GuangXi bamboo cane(S.sinense)
21 GXB87-36(Erianthus arundinaceus)
22 GXN1(Narenga porphyrocoma)