一种用于调控mRNA高表达的UTR及其应用转让专利
申请号 : CN202310793276.9
文献号 : CN116536318B
文献日 : 2023-09-12
发明人 : 左涛 , 刘凯 , 夏源蔚
申请人 : 江苏耀海生物制药有限公司
摘要 :
权利要求 :
1. 一种5’‑UTR,其特征在于,所述5’‑UTR的核酸序列如SEQ ID NO.5所示。
2.一种表达盒,其特征在于,包含权利要求1所述5’‑UTR。
3. 根据权利要求2所述的表达盒,其特征在于,进一步地,所述表达盒还包含启动子、目标基因、3’‑UTR和Poly A元件中的一种或多种;其中,所述启动子为T7启动子。
4. 根据权利要求3所述的表达盒,其特征在于,所述T7启动子的序列如SEQ ID NO.6所示,所述3’‑UTR的序列如SEQ ID NO.8所示,所述Poly A的序列如SEQ ID NO.9所示。
5.一种重组载体,其特征在于,包含权利要求1所述5’‑UTR或权利要求2‑4任一项所述表达盒。
6. 根据权利要求5所述的重组载体,其特征在于,所述重组载体按照T7启动子、5’‑UTR、目标基因、3’‑UTR和Poly A顺序,通过基因合成方式得到组合的表达框,再通过无缝克隆方式构建至pTNT质粒载体。
7.一种宿主细胞,其特征在于,包含权利要求1所述5’‑UTR,或权利要求2‑4任一项所述表达盒,或权利要求5或6所述重组载体。
8.一种重组菌,其特征在于,包含权利要求1所述5’‑UTR,或权利要求2‑4任一项所述表达盒,或权利要求5或6所述重组载体。
9.一种用于mRNA体外转录的重组质粒的构建方法,其特征在于,包含如下步骤:(1)质粒线性化,所述质粒为pTNT质粒;
(2)通过基因合成方式组合启动子序列、权利要求1所述5’‑UTR的序列、ORF序列、3’‑UTR的序列、Poly A的序列,得到表达框;
(3)通过无缝克隆方式将所述表达框构建至步骤(1)得到的线性化质粒,获得包含所述
5’‑UTR的用于mRNA体外转录的重组质粒。
10.根据权利要求9所述的构建方法,其特征在于,进一步地,所述方法还包含下述一个或多个步骤:步骤(4)获得线性化的所述重组质粒:采用Xba I限制性酶切位点酶切实现所述重组质粒线性化,用于后续mRNA体外转录;
步骤(5)以线性化的所述重组质粒为模板进行体外转录;
步骤(6)对体外转录得到的mRNA进行纯化;
步骤(7)对纯化的mRNA进行细胞转染;
步骤(8)对转染细胞进行荧光观察;
步骤(9)对转染细胞进行细胞裂解和Western Blot检测。
11.权利要求1所述5’‑UTR,或权利要求2‑4任一项所述表达盒,或权利要求5或6所述重组载体,或权利要求7所述宿主细胞,或权利要求8所述重组菌用于mRNA体外转录的用途。
说明书 :
一种用于调控mRNA高表达的UTR及其应用
技术领域
背景技术
(Untranslated Regions)即非翻译区,是mRNA分子两端的非编码片段。 5’‑UTR从mRNA起点
的甲基化鸟嘌呤核苷酸帽延伸至AUG起始密码子,3’‑UTR从编码区末端的终止密码子延伸
至多聚A尾(Poly A)的末端。
转录mRNA的模板必须包含T7启动子序列、5’‑UTR序列、ORF序列、3’‑UTR序列、Poly A序列。
研究表明5’‑UTR在mRNA翻译过程中至关重要,包括核糖体募集,扫描和起始密码子选择。另
外5’‑UTR对于mRNA的稳定性也有重要影响。
在合成外源mRNA时加入修饰核苷酸,可以减轻mRNA转染细胞后触发的天然免疫反应。但修
饰核苷酸的加入亦反过来影响mRNA的二级结构,从而对mRNA在细胞中的翻译效率造成影
响。在过往研究中使用到用于调控翻译表达的UTR序列包括:来自CMV(Cytomegalovirus,人
类巨噬细胞病毒 )的增强子序列,人alpha‑globin (α‑珠蛋白)5’‑UTR、人生长激素UTR序
列、非洲爪蟾蜍beta‑globin(β‑珠蛋白) UTR等。
植物内的表达,5’‑UTR核苷酸前导序列,其包含有利于基因表达的元件,如重复的CAA三核
苷酸元件,其与重复的CT二核苷酸元件组合。CN106480035A(公开日2017年03月08日)公开
了一种5’‑UTR元件及其在生产中的应用,获得高效增强基因表达的核酸序列,以及在L‑丙
氨酸发酵生产中的应用。CN104321432A(公开日2015年01月28日)公开了一种人工核酸分
子,所述人工核酸分子包含至少一个源自TOP基因的5’‑UTR元件,至少一个可读框和任选地
至少一个3’‑UTR元件,所述3’‑UTR元件包含优选源自提供稳定mRNA的基因诸如白蛋白基因
的3’‑UTR,或源自提供稳定mRNA的基因的3’‑UTR的变体的核酸序列。CN106148344A(公开日
2016年11月23日)公开了一种具有增强基因表达能力的马铃薯花粉特异表达基因SBgLR的
5’‑UTR序列及其应用,SBgLR基因的5’‑UTR序列可以提高不同类型启动子的表达活性,可在
基因工程和基因功能研究中用于提高目标基因的表达。
控目的基因高效表达、具有通用性的用于mRNA生产的5’‑UTR。
发明内容
明的5’‑UTR具有通用性,适于调控不同目的基因的高表达,可广泛应用于mRNA体外转录以
及工业化大规模mRNA生产。本发明进一步提供了包含所述5’‑UTR的表达盒、重组载体、细
胞、重组菌、载体的构建方法,以及5’‑UTR的用途等。
“AGTATT”核酸,对编码人α珠蛋白的HBA1基因的5’‑UTR序列进行改造,筛选获得具有优异效
果的两种5’‑UTR,即5’‑UTR 序列2(AGGAAATAACTCTTCTGGTCCCCACAGACTCAGAGAGAACCCGCCA
CCATGG(SEQ ID NO.4)),以及5’‑UTR 序列3(AGGAAATAACTAGTATTCTTCTGGTCCCCACAGACTCA
GAGAGAACCCGCCACCATGG(SEQ ID NO.5))。
同目标基因的高表达调控具有一定的普适性。相对于其他改造的5’‑UTR(即5’‑UTR 序列1,
AGGACTCTTCTGGTCCCCACAGACTCAGAGAGAACCCGCCACCATGG(SEQ ID NO.3)),Western Blot结
果从条带灰度来看,使用5’‑UTR序列3的目标蛋白EGFP表达蛋白量和使用5’‑UTR序列2的目
标蛋白EGFP表达蛋白量,大于使用5’‑UTR序列1的目标蛋白EGFP表达蛋白量。
UTR序列2表达EGFP绿色荧光蛋白>使用5’‑UTR序列1表达EGFP绿色荧光蛋白,即使用5’‑
UTR序列3、5’‑UTR序列2可调控目的基因高表达。
GFP+%为69.07%,使用5’‑UTR序列2表达EGFP绿色荧光蛋白GFP+%为62.27%,使用5’‑UTR序列
1表达EGFP绿色荧光蛋白GFP+%为52.53%,即使用5’‑UTR序列3调控目的基因高表达效果最
好,5’‑UTR序列2其次,均显著优于其他改造的5’‑UTR(即5’‑UTR 序列1)。
附图说明
UTR序列3的内参GAPDH mRNA目的蛋白Western Blot结果。
具体实施方式
得以下3种5’‑UTR序列。
(下划线),5’‑UTR序列3的具体序列如下:
中,T7启动子序列如SEQ ID NO.6所示;所述5’‑UTR序列的核苷酸序列为SEQ ID NO.3,或
SEQ ID NO.4,或SEQ ID NO.5所示;所述EGFP基因序列如SEQ ID NO.7所示;所述3’‑UTR序
列的核苷酸序列如SEQ ID NO.8所示;所述PolyA序列的核苷酸序列如SEQ ID NO.9所示。
EGFP ATGGTGAGCAAGGGCGAGGAGCTGTTCACCGGGGTGGTGCCCATCCTGGTCGAGCTGG
ACGGCGACGTAAACGGCCACAAGTTCAGCGTGTCCGGCGAGGGCGAGGGCGATGCCAC
CTACGGCAAGCTGACCCTGAAGTTCATCTGCACCACCGGCAAGCTGCCCGTGCCCTGG
CCCACCCTCGTGACCACCCTGACCTACGGCGTGCAGTGCTTCAGCCGCTACCCCGACC
ACATGAAGCAGCACGACTTCTTCAAGTCCGCCATGCCCGAAGGCTACGTCCAGGAGCG
CACCATCTTCTTCAAGGACGACGGCAACTACAAGACCCGCGCCGAGGTGAAGTTCGAG
GGCGACACCCTGGTGAACCGCATCGAGCTGAAGGGCATCGACTTCAAGGAGGACGGCA
ACATCCTGGGGCACAAGCTGGAGTACAACTACAACAGCCACAACGTCTATATCATGGC
CGACAAGCAGAAGAACGGCATCAAGGTGAACTTCAAGATCCGCCACAACATCGAGGAC
GGCAGCGTGCAGCTCGCCGACCACTACCAGCAGAACACCCCCATCGGCGACGGCCCCG
TGCTGCTGCCCGACAACCACTACCTGAGCACCCAGTCCGCCCTGAGCAAAGACCCCAA
CGAGAAGCGCGATCACATGGTCCTGCTGGAGTTCGTGACCGCCGCCGGGATCACTCTC
GGCATGGACGAGCTGTACAAGTGA(SEQ ID NO.7)
3’‑UTR CTCGAGCTGGTACTGCATGCACGCAATGCTAGCTGCCCCTTTCCCGTCCTGGGTACCC
CGAGTCTCCCCCGACCTCGGGTCCCAGGTATGCTCCCACCTCCACCTGCCCCACTCAC
CACCTCTGCTAGTTCCAGACACCTCCCAAGCACGCAGCAATGCAGCTCAAAACGCTTA
GCCTAGCCACACCCCCACGGGAAACAGCAGTGATTAACCTTTAGCAATAAACGAAAGT
TTAACTAAGCTATACTAACCCCAGGGTTGGTCAATTTCGTGCCAGCCACACCCTGGAG
CTAGC(SEQ ID NO.8)
Poly A AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGCATATGACTAAAAAAAAAAAAAAAAAA
AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA(SEQ ID
NO.9)
EGFP‑1(使用5’‑UTR为SEQ ID NO.3),pTNTR‑EGFP‑2(使用5’‑UTR为SEQ ID NO.4),pTNTR‑
EGFP‑3(使用5’‑UTR为SEQ ID NO.5)。
marker,用小刀裁剪PVDF膜至合适的条带。
列2,5’‑UTR序列3。Western Blot结果可知,从条带灰度来看,使用5’‑UTR序列3的目标蛋白
EGFP表达蛋白量>使用5’‑UTR序列2的目标蛋白EGFP表达蛋白量>使用5’‑UTR序列1的目
标蛋白EGFP表达蛋白量。
5’‑UTR序列3。Western Blot结果可知,从条带灰度来看,使用5’‑UTR序列3的内参GAPDH表
达蛋白量>使用5’‑UTR序列2的内参GAPDH表达蛋白量>使用5’‑UTR序列1的内参GAPDH表
达蛋白量。
列2,5’‑UTR序列3。转染48h,荧光强度来看,使用5’‑UTR序列3表达EGFP绿色荧光蛋白>使
用5’‑UTR序列2表达EGFP绿色荧光蛋白>使用5’‑UTR序列1表达EGFP绿色荧光蛋白,即使用
5’‑UTR序列3、5’‑UTR序列2可调控目的基因高表达。
10099141C),用1mL的PBS洗去残留的原培养基。往细胞瓶中加入适量商品化胰酶(Gibco,货
号2186958),静置大约20秒,于倒置显微镜下观察到细胞收缩突起变圆时,加入1mL含血清
的新鲜培养基终止消化,用巴氏管反复吹打细胞使其脱壁并分散制成细胞悬液。室温
1500rpm离心5min,完全弃去上清液,一个孔的细胞约用1mL PBS重悬细胞,加20µl到细胞计
数板上。荧光细胞需要提前用空白细胞进行归零校准。程序选择细胞计数仪单色1程序,分
别对每个孔进行命名。计数结束需拷excel数据做柱状图分析。
使用5’‑UTR序列3表达EGFP绿色荧光蛋白GFP+%(69.07%)>使用5’‑UTR序列2表达EGFP绿色
荧光蛋白GFP+%(62.27%)>使用5’‑UTR序列1表达EGFP绿色荧光蛋白GFP+%(52.53%),即使
用5’‑UTR序列3、5’‑UTR序列2可调控目的基因高表达。
5’‑UTR序列2 293 62.27 2.18E+05 468 3.51E+05 16.74 8.49 原始浓度
5’‑UTR序列3 293 69.07 2.53E+05 495 3.71E+05 16.63 4.22 原始浓度
他不同形式的变化或变动。这里无需也无法对所有的实施方式予以穷举。凡在本公开的精
神和原则之内所作的任何修改、等同替换和改进等,均应包含在本公开权利要求的保护范
围之内。