基本信息:
- 专利标题： 一种单细胞测序数据的生成方法
- 申请号：CN202411113195.0 申请日：2024-08-14
- 公开(公告)号：CN119132389B 公开(公告)日：2025-09-19
- 发明人： 章天骄 , 赵中乾 , 汪国华
- 申请人： 东北林业大学
- 申请人地址： 黑龙江省哈尔滨市香坊区和兴路26号
- 专利权人： 东北林业大学
- 当前专利权人： 东北林业大学
- 当前专利权人地址： 黑龙江省哈尔滨市香坊区和兴路26号
- 代理机构： 哈尔滨奥博专利代理事务所(普通合伙)
- 代理人： 叶以方
- 主分类号： G16B20/20
- IPC分类号： G16B20/20 ; G16B25/10 ; G16B40/00 ; G06N5/04 ; G06N3/0455 ; G06N3/08
摘要：
本发明提出一种单细胞测序数据的生成方法，包括：S1：构建深度神经网络模型；S2：获取scRNA‑seq综合数据集；S3、对所述scRNA‑seq综合数据集进行预处理；S4：基于预处理后的scRNA‑seq综合数据集对深度神经网络模型进行训练；S5：基于训练后的深度神经网络模型对待测数据的特征进行加噪、去噪和重构，生成单细胞测序数据。本发明在多种测序平台的数据集上，深度神经网络模型都能生成高质量的scRNA‑seq数据。通过与其它最新的数据生成模型进行比较深度神经网络模型在多个评价指标上均表现出更优秀的性能。此外，深度神经网络模型还能够模拟伪时间尺度下的单细胞数据，为追踪细胞分化和发育轨迹、分析细胞间的通讯、揭示细胞的异质性等分析提供高质量的数据支持。
公开/授权文献:
- CN119132389A 一种单细胞测序数据的生成方法 公开/授权日：2024-12-13
IPC结构图谱:
| G | 物理 |
| --G16 | 特别适用于特定应用领域的信息通信技术 |
| ----G16B | 生物信息学，例如特别适用于计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关数据处理的信息与通信技术 |
| ------G16B20/00 | 特别适用于功能性基因组学或蛋白质组学的，例如基因型-表型关联的ICT |
| --------G16B20/20 | .等位基因或变异检测，例如单核酸多态性 |