基本信息:
- 专利标题： 一种细胞类型划分的推断方法
- 申请号：CN202311554149.X 申请日：2023-11-21
- 公开(公告)号：CN120032719A 公开(公告)日：2025-05-23
- 发明人： 章天骄 , 任吉祥 , 汪国华
- 申请人： 东北林业大学
- 申请人地址： 黑龙江省哈尔滨市香坊区和兴路26号
- 专利权人： 东北林业大学
- 当前专利权人： 东北林业大学
- 当前专利权人地址： 黑龙江省哈尔滨市香坊区和兴路26号
- 主分类号： G16B35/20
- IPC分类号： G16B35/20 ; G16B40/00 ; G06N3/042 ; G06N3/0464 ; G06F18/2413 ; G06F18/23
摘要：
本发明公开提供一种细胞类型划分的推断方法，属于生物信息学领域，该方法利用零膨胀负二项(ZINB)模型对scRNA‑seq数据进行降噪。随后，该方法采用自适应图对比表示学习方法，使用近似个性化传播的神经预测图卷积作为图对比学习的编码器。这确保了每个单元的表示不仅捕获了它的单个特征，而且反映了它在图中的位置以及它与其他单元的关系。图对比学习利用节点之间的关系来捕获单元之间的相似性，更好地表示数据的潜在连续性和复杂拓扑结构。最后，利用Kullback‑Leibler散度对学习到的低维潜在表征进行聚类。
IPC结构图谱:
| G | 物理 |
| --G16 | 特别适用于特定应用领域的信息通信技术 |
| ----G16B | 生物信息学，例如特别适用于计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关数据处理的信息与通信技术 |
| ------G16B35/00 | 特别适用于核酸、蛋白质或肽计算机模拟组合表达库的ICT |
| --------G16B35/20 | .表达库筛选 |