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1. 发明公开

CN115691681A 单细胞t-SNE图前端可视化方法、装置、设备及介质审中-实审
公开(公告)号：CN115691681A
公开(公告)日：2023-02-03
申请号：CN202211318289.2
申请日：2022-10-26
申请人：广州基迪奥生物科技有限公司
发明人：周煌凯 , 高川 , 艾鹏 , 张从曦 , 孙鹏鹏
IPC分类号： G16B45/00 , G16B5/00
摘要：本发明实施例公开了一种单细胞t‑SNE图前端可视化方法、装置、设备及介质，涉及生物信息技术领域，该方法包括：S1，接收输入文件并确定细胞点总数量，在细胞点总数量大于第一预设阈值时，执行步骤S2，反之，执行步骤S5；S2，根据每个细胞亚群的细胞点数量以及第一预设条件对细胞亚群进行筛选，形成第一细胞亚群集合和第二细胞亚群集合；S3，设置基础细胞点数量，对第一细胞亚群集合中每个细胞亚群的细胞点进行合并；S4，确定目标细胞点数量，如果目标细胞点数量大于第一预设阈值，则重复执行步骤S2‑S3；S5，使用Canvas进行图形绘制。本发明实施例可以缩短图形渲染的时间，提高了使用者的使用体验。

2. 发明公开

CN115691682A 基因深度信息数据压缩方法、装置、电子设备及存储介质审中-实审
公开(公告)号：CN115691682A
公开(公告)日：2023-02-03
申请号：CN202211318287.3
申请日：2022-10-26
申请人：广州基迪奥生物科技有限公司
发明人：周煌凯 , 高川 , 艾鹏 , 罗玥 , 孙鹏鹏
IPC分类号： G16B50/00 , G16B30/00 , G06F16/174
摘要：本发明实施例公开了一种基因深度信息数据压缩方法、装置、电子设备及存储介质，涉及生物信息技术领域，该方法包括：接收各个样本的测序文件并将测序文件转换成bam文件；使用SAMtools将各个样本的bam文件转换成深度信息文件；对深度信息文件进行压缩，得到压缩文件，其具体包括：通过基因的位置信息对深度信息进行过滤，得到第一深度信息处理文件；将深度信息相同的连续位点进行合并；将每个基因的各区间深度信息进行整合成一行，得到每个样本的第二深度信息处理文件；将所有样本的第二深度信息处理文件合并成一个文件，得到压缩文件。本发明实施例可以在保证基因基本信息以及深度信息完整的情况下，大幅度降低了存储消耗。

3. 发明公开

CN115083523A 一种双向同源比对的非模式物种细胞注释方法审中-实审
公开(公告)号：CN115083523A
公开(公告)日：2022-09-20
申请号：CN202210727902.X
申请日：2022-06-22
申请人：广州基迪奥生物科技有限公司
发明人：周煌凯 , 高川 , 艾鹏 , 张从曦 , 孙鹏鹏
IPC分类号： G16B30/10 , G06F11/36
摘要：本发明公开了一种双向同源比对的非模式物种细胞注释方法，属于细胞注释技术领域，主要包括以下步骤：将非模式物种的基因组和模式物种的基因组进行双向同源比对，保留在两个方向上都配对一致的基因对；在模式物种的标记基因数据库中，将双向同源比对的基因对中的非模式物种的基因替代双向同源比对的基因对中与非模式物种同源的基因，得到非模式物种的表达量矩阵；通过软件调用非模式物种的表达量矩阵的基因数据进行注释，得到非模式物种细胞类型的注释结果。采用该双向同源比对的非模式物种细胞注释方法，可以精确对非模式物种的基因进行同源比对，得到与模式物种同源的基因，利用模式物种的标记基因数据库实现对非模式物种的细胞注释。

4. 发明公开

CN118016154A 一种融合转座酶建库的DAP-seq实验方法审中-公开
公开(公告)号：CN118016154A
公开(公告)日：2024-05-10
申请号：CN202311676774.1
申请日：2023-12-08
申请人：广州基迪奥生物科技有限公司
发明人：周煌凯 , 王建晖 , 高川 , 徐毓璇 , 孙鹏鹏
IPC分类号： G16B25/10 , C12Q1/6806 , C40B50/06 , G16B30/10
摘要：本申请公开了一种融合转座酶建库的DAP‑seq实验方法，利用Tn5转座酶结合未被转录因子(TF)结合保护的DNA片段区域，产生酶切效应，并完成建库，配合对应的生物信息分析方法，锁定转录因子结合位点(TFBS)和结合基序(motif)。本申请所述的融合转座酶建库的DAP‑seq实验方法是利用转录因子结合位点未被转录因子结合保护的特性，采用Tn5转座酶酶切未被转录因子结合保护的DNA片段区域并完成建库，配合对应的生物信息分析方法，实现了TFBS的精确定位和直接锁定高可信的motif序列。

5. 外观设计

CN308034763S 带生信云平台图形用户界面的显示屏幕面板有权
公开(公告)号：CN308034763S
公开(公告)日：2023-05-12
申请号：CN202230354134.9
申请日：2022-06-10
申请人：广州基迪奥生物科技有限公司
设计人：周煌凯 , 高川 , 艾鹏 , 邓美英 , 孙鹏鹏
摘要： 1.本外观设计产品的名称：带生信云平台图形用户界面的显示屏幕面板。
2.本外观设计产品的用途：用于显示与交互；该显示屏幕面板用于电脑显示器、平板电脑、手机。
3.本外观设计产品的设计要点：在于显示屏幕面板中的生信云平台图形用户界面。
4.最能表明设计要点的图片或照片：主视图。
5.本外观设计产品为平面产品，省略后视图;本外观设计产品为平面产品，省略左视图;本外观设计产品为平面产品，省略右视图;本外观设计产品为平面产品，省略俯视图;本外观设计产品为平面产品，省略仰视图。
6.图形用户界面的用途：用于Omicshare生信云平台进行组学数据分析，参数调整，图标实时交互分析，提高数据分析管理效率。
7.图形用户界面在产品中的区域：主视图为登录及开始使用Omicshare生信云平台进行组学数据分析界面。
8.图形用户界面的人机交互方式：图形化界面。
9.图形用户界面的变化状态说明：主视图为登录及开始使用Omicshare生信云平台进行组学数据分析的界面。
点击主视图左侧由“个人中心”开始自上而下第四模块“工具中心”后显示变化状态图1；点击变化状态图1中间从左至右第三模块“动态交互”后显示变化状态图2；点击变化状态图2最下排从左至右第二模块“动态KEGG富集分析”后显示变化状态图3；点击变化状态图3中上部“1：目的基因文件Tip：”行的后方“示例文件”后显示变化状态图4；点击主视图左侧由“个人中心”开始自上而下第六模块“我的项目”后显示变化状态图5；点击变化状态图5“动态KEGG富集分析”行的右侧蓝色双向下拉箭头后显示变化状态图6；点击变化状态图6“操作”下方第三个紫色查看按钮后显示变化状态图7；点击变化状态图7中部第三行第二模块“数目统计图”后显示变化状态图8，可选择图形、字体、下载参数；点击变化状态图8中部第三行第三模块“显著性柱状图”后显示变化状态图9，可选择图形、字体、下载参数；点击变化状态图9中部第三行第四模块“显著性气泡图”后显示变化状态图10，可选择图形、字体、下载参数；点击主视图由“个人中心”开始自上而下第五模块“我的数据”后显示变化状态图11；点击变化状态图11“上传”按钮后显示变化状态图12。

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