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    • 5. 发明授权
    • 一种LncRNA学习系统
    • CN112102878B
    • 2024-01-26
    • CN202010973090.8
    • 2020-09-16
    • 张云鹏宁尚伟李霞
    • 张云鹏宁尚伟李霞
    • G16B20/00G16B30/10G16B30/20
    • 本发明涉及一种LncRNA学习系统,包括:数据获取模块,用于获取SNP数据集和LncRNA数据集;数据处理模块,用于识别出所述LncRNA数据集中每个LncRNA及附近的SNP得到SNP组;滑窗模块,用于基于滑窗法得到每个所述LncRNA的突变热点区域,组成突变热点区域组;显著性分析模块,用于基于超几何分布法对所述突变热点区域组进行显著性分析得到显著组数据;排秩模块,用于对所述显著组数据内的SNP进行打分和排秩,得到顺序SNP数据库;基于所述顺序SNP数据库构建LncRNA平台,用户通过所述LncRNA平台进行学习。本发明能准确识别出能使LncRNA发生改变的SNP,并基于此构建学习平台,以供研究者和医务人员进行研究学习。(56)对比文件Fan,J.Identification of SNP-containing regulatory motifs in themyelodysplastic syndromes model using SNParrays ad gene expression arrays.CHINESEJOURNAL OF CANCER.2013,第32卷(第4期),170-185.林梦洁;范D;郁芸;韩新焕.SLC26A4基因编码区功能特征及分子进化分析.南京医科大学学报(自然科学版).2013,(第11期),3-8.岁品品;邢旭东;王宏;崔颖.基于位置权重矩阵的核小体识别及功能分析.生物信息学.2016,(第01期),3-8.