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序号 专利名 申请号 申请日 公开(公告)号 公开(公告)日 发明人
101 水稻抗褐飞虱基因BPH39的分子标记及其应用 CN202011548180.9 2020-12-24 CN112575109A 2021-03-30 胡杰; 邹玲; 陈志伟; 吴为人
本发明提供了水稻抗褐飞虱基因BPH39的分子标记及其应用,通过构建BPH39的近等基因系和高世代回交群体的重组交换单株分析,构建了覆盖BPH39的局部高密度物理图谱,并将基因精细定位在30 kb的区间。在此区间的两个分子标记ZL1607和ZL2137与BPH39距离最近,利用这两个标记筛选目的基因的单株可靠性最高。此外,与其紧密连锁的其它分子标记,I1540、I32‑4、ZL6061均能用于筛选该目的基因的单株,可大大提高抗褐飞虱水稻品种或品系的选择效率,缩短育种年限。
102 一种利用闭颖基因抑制转基因水稻花粉漂移的方法 CN201110168578.4 2011-06-22 CN102273400A 2011-12-14 倪大虎; 杨剑波; 杨亚春; 宋丰顺; 李莉; 倪金龙; 汪秀峰; 陆徐忠; 张毅
本发明公开了一种利用闭颖基因抑制转基因水稻花粉漂移的方法。将水稻或其近缘物种闭颖基因导入转基因水稻,育成的转基因水稻品种能够正常结实,但颖壳不开张,花药不外露,可以有效防止转入的外源基因通过自身花粉漂流到其他品系或其近缘物种,造成基因污染。此方法通过选育闭颖性状的转基因品种,达到阻止转基因水稻花粉漂移,降低生态环境风险。闭颖基因可选用已经标记或克隆的ld(t)(lodiculeless spikelet)、cl7等基因,或者选择在以后研究中发现的导致闭颖性状的其他闭颖基因。
103 猪GIGYF2基因中一个可用于溯源的SNP标记及其检测方法 CN201010573253.X 2010-12-03 CN102485892A 2012-06-06 唐雪明; 吴潇; 张小波; 赵凯; 朱宏; 谭芙蓉; 王金斌; 魏曼曼; 陈凯
本发明涉及一种猪GIGYF2基因中一个可用于溯源的SNP标记及其检测方法。所述的SNP标记位于猪GIGYF2基因中一段基因组DNA片段中,是通过DNA池(pool)测序获得。所述的猪GIGYF2基因中一段基因组DNA片段,如SEQ ID NO 1所示,共452bp,包含部分23内含子,且其第187位碱基处有一个碱基突变187A→187C。在包括10个猪品种或品系的试验群体中,分析本发明的SNP标记在试验群体中等位基因的分布情况,发现该标记在不同的品种或品系中的等位基因频率接近,多态性丰富,品种或品系间等位基因频率分布差异小,并且杂合度都大于0.3,初步判定本发明的SNP标记可用作猪肉产品DNA溯源。
104 一种批量计算近缘物种间基因组编码区SNP位点的方法 CN201810819911.5 2018-07-24 CN109243531A 2019-01-18 郭月; 刘静; 杜建厂; 胡茂龙; 浦惠明; 张洁夫; 龙卫华; 张维; 周晓婴
本发明公开了一种批量计算近缘物种间基因组编码区SNP位点的方法。本发明所提供的计算近缘物种间基因组编码区SNP位点(coding SNP,cSNP)的方法综合运用了基于Blast成对比对结果后进行聚类搜索直系同源基因的InParanoid程序,基于比对两套DNA编码区序列(cds序列)的Crossmatch载体屏蔽软件,以及结合Perl脚本语言编程等方法。实验证明,本发明所提供的批量计算近缘物种间cSNP位点的方法比较系统,检测近缘物种间cSNP的重复效果好,速度快,易实现批量化、自动化和流程化。
105 一种批量计算近缘物种间基因组编码区SNP位点的方法 CN201810819911.5 2018-07-24 CN109243531B 2021-11-26 郭月; 刘静; 杜建厂; 胡茂龙; 浦惠明; 张洁夫; 龙卫华; 张维; 周晓婴
本发明公开了一种批量计算近缘物种间基因组编码区SNP位点的方法。本发明所提供的计算近缘物种间基因组编码区SNP位点(coding SNP,cSNP)的方法综合运用了基于Blast成对比对结果后进行聚类搜索直系同源基因的InParanoid程序,基于比对两套DNA编码区序列(cds序列)的Crossmatch载体屏蔽软件,以及结合Perl脚本语言编程等方法。实验证明,本发明所提供的批量计算近缘物种间cSNP位点的方法比较系统,检测近缘物种间cSNP的重复效果好,速度快,易实现批量化、自动化和流程化。
106 一种小麦新品种的选育方法 CN201510140236.X 2015-03-27 CN104719129A 2015-06-24 阮仁武; 李中安; 易泽林; 张建奎
一种小麦新品种的选育方法,本发明利用含有mslb-Rht3基因的连锁的矮秆不育小麦品系与其他优良品种进行杂交、回交,连续3-5代回交建立优良品种矮秆不育的近等基因系,选育出稳定的含有mslb-Rht3的矮秆优良小麦品系,然后用中秆可育品系自交,让染色体重组交换,解除mslb-Rht3的连锁,获得含有Rht3矮秆基因的小麦优良品系,再利用建立的小麦不育近等基因系与含有育种所需目标性状的小麦品种(系)进行杂交、回交,连续3-5代用含有育种所需目标性状株系与同品种(系)进行回交、自交,在回交、自交后代中选择具有所需目标性状的优良中秆植株或高秆植株进行育种选育。本发明提供的育种方法不仅育种效率高,而且省时省工。
107 一种小麦新品种的选育方法 CN201510140236.X 2015-03-27 CN104719129B 2018-03-02 阮仁武; 李中安; 易泽林; 张建奎
一种小麦新品种的选育方法,本发明利用含有mslb‑Rht3基因的连锁的矮秆不育小麦品系与其他优良品种进行杂交、回交,连续3‑5代回交建立优良品种矮秆不育的近等基因系,选育出稳定的含有mslb‑Rht3的矮秆优良小麦品系,然后用中秆可育品系自交,让染色体重组交换,解除mslb‑Rht3的连锁,获得含有Rht3矮秆基因的小麦优良品系,再利用建立的小麦不育近等基因系与含有育种所需目标性状的小麦品种(系)进行杂交、回交,连续3‑5代用含有育种所需目标性状株系与同品种(系)进行回交、自交,在回交、自交后代中选择具有所需目标性状的优良中秆植株或高秆植株进行育种选育。本发明提供的育种方法不仅育种效率高,而且省时省工。
108 目标区域捕获方法及其生物信息处理方法和系统 PCT/CN2011/077861 2011-08-01 WO2013016864A1 2013-02-07 朱昱其; 金鑫; 李莹; 李英睿

本发明公开了一种目标区域捕获方法及其生物信息处理方法和系统。所述目标区域捕获方法包括利用目标区域捕获芯片捕获目标区域捕获芯片指定使用物种的近源物种的基因片段,并对所述近源物种的基因片段进行测序获得基因片段序列。本发明的方法和系统,将为单一物种设计的基因芯片用于其它近源物种的目标区域捕获,从而帮助筛选近源物种的全基因组数据。

109 一种基于转录组测序的基因定位的方法 CN202311619002.4 2023-11-30 CN117604087A 2024-02-27 陈文杰; 覃夏燕; 宁德娇; 陈淑芳; 郭小红; 汤复跃; 韦清源; 韦荣昌; 梁江; 陈渊
本发明公开了一种基于转录组测序的基因定位的方法,将目标性状差异大的植物材料A和植物材料B杂交创建近等基因系或残留异质系群体,利用基于重测序的转录组测序方法来实现正向遗传学定位的目的,同时还能利用其差异表达基因分析结果筛选候选基因,并分析差异目的性状个体的基因调控网络差异,大大节约了成本。
110 玉米基因ZmEREB102在提高玉米产量中的应用 CN202110392603.0 2021-04-13 CN113004383B 2022-03-15 张祖新; 简逸楠; 宁强
本发明属于植物基因工程技术领域,具体涉及玉米基因ZmEREB102在提高玉米产量中的应用,所述基因编码的氨基酸序列为SEQ ID NO.2所示。该基因位于玉米第7染色体,控制玉米穗长、每行籽粒数和每穗籽粒数。在近等基因系之间和自然群体中该基因的表达水平与穗长和每行籽粒数负相关。利用CRISPR/Cas9技术敲除该基因、抑制基因表达,能增加干旱胁迫和正常环境下玉米自交系的穗长和每行籽粒数。
111 玉米基因ZmEREB102在提高玉米产量中的应用 CN202110392603.0 2021-04-13 CN113004383A 2021-06-22 张祖新; 简逸楠; 宁强
本发明属于植物基因工程技术领域,具体涉及玉米基因ZmEREB102在提高玉米产量中的应用,所述基因编码的氨基酸序列为SEQ ID NO.2所示。该基因位于玉米第7染色体,控制玉米穗长、每行籽粒数和每穗籽粒数。在近等基因系之间和自然群体中该基因的表达水平与穗长和每行籽粒数负相关。利用CRISPR/Cas9技术敲除该基因、抑制基因表达,能增加干旱胁迫和正常环境下玉米自交系的穗长和每行籽粒数。
112 利用深度学习的碱基编辑基因剪刀的效率和结果预测系统和方法 CN202310489065.6 2023-05-04 CN116978444A 2023-10-31 金炯凡; 金那惠
本发明涉及利用深度学习的碱基编辑基因剪刀的效率和结果预测系统等,根据所述系统,可以选择用于高效碱基编辑的碱基编辑剪刀和单向导核糖核酸(single‑guide RNA:sgRNA),而无需对具有各种前间隔序列邻近基序(protospacer‑adjacent motif:PAM)兼容性的63个碱基编辑剪刀执行过多的试验。因此,所述系统可有效用于所有应用基因编辑的领域,例如通过基因编辑执行疾病治疗等。
113 甘蓝型油菜MI CMS系统恢复基因Rfm的分子标记及其应用 CN201810436261.6 2018-05-09 CN108342506B 2021-08-13 龙卫华; 浦惠明; 高建芹; 胡茂龙; 张洁夫; 陈松
本发明公开了甘蓝型油菜MI CMS系统恢复基因Rfm的分子标记及其应用,属于作物分子育种领域。通过利用油菜单核苷酸多态性(SNP)芯片与Rfm基因近等基因系杂交来确定Rfm基因所处的基因组物理区间,进而以油菜基因组序列为基础开发简单序列重复(SSR)标记,筛选获得与Rfm恢复基因最为连锁的标记并实践中应用。本发明开发的分子标记不仅可以进行MI CMS系统恢复系的分子标记辅助育种,加快恢复系选育进程,提高育种效率;还可以鉴定MI CMS系统杂交种种子的纯度,准确率高。
114 甘蓝型油菜MI CMS系统恢复基因Rfm的分子标记及其应用 CN201810436261.6 2018-05-09 CN108342506A 2018-07-31 龙卫华; 浦惠明; 高建芹; 胡茂龙; 张洁夫; 陈松
本发明公开了甘蓝型油菜MI CMS系统恢复基因Rfm的分子标记及其应用,属于作物分子育种领域。通过利用油菜单核苷酸多态性(SNP)芯片与Rfm基因近等基因系杂交来确定Rfm基因所处的基因组物理区间,进而以油菜基因组序列为基础开发简单序列重复(SSR)标记,筛选获得与Rfm恢复基因最为连锁的标记并实践中应用。本发明开发的分子标记不仅可以进行MI CMS系统恢复系的分子标记辅助育种,加快恢复系选育进程,提高育种效率;还可以鉴定MI CMS系统杂交种种子的纯度,准确率高。
115 近视相关易感基因的分子标记及其检测引物组和应用 CN202010903371.6 2020-09-01 CN111893179A 2020-11-06 张煜婷; 聂苏秦; 张存柱; 孙蕊娟
本发明适用于生物技术及眼科健康领域,提供了一种近视相关易感基因的分子标记及其检测引物组和应用,该分子标记的检查引物组包括人基因组DNA的24个高度近视及病理性近视相关易感基因的37个SNP位点的多重PCR扩增上下游引物对和单碱基延伸引物。本发明可利用多重PCR扩增技术进行样本核酸质谱检测,实现双反应孔一次性检测37个SNP位点,其通过高度近视易感性基因与遗传风险的关联性分析,利用高度近视遗传风险评估体系提供了一种专门针对中国人群的高度近视遗传风险水平评估方法,该方法具有检测通量高、效率高、准确度高、且成本较低等优点,适合规模化人群筛查。
116 近视相关易感基因的分子标记及其检测引物组和应用 CN202010903371.6 2020-09-01 CN111893179B 2022-07-22 张煜婷; 聂苏秦; 张存柱; 孙蕊娟
本发明适用于生物技术及眼科健康领域,提供了一种近视相关易感基因的分子标记及其检测引物组和应用,该分子标记的检查引物组包括人基因组DNA的24个高度近视及病理性近视相关易感基因的37个SNP位点的多重PCR扩增上下游引物对和单碱基延伸引物。本发明可利用多重PCR扩增技术进行样本核酸质谱检测,实现双反应孔一次性检测37个SNP位点,其通过高度近视易感性基因与遗传风险的关联性分析,利用高度近视遗传风险评估体系提供了一种专门针对中国人群的高度近视遗传风险水平评估方法,该方法具有检测通量高、效率高、准确度高、且成本较低等优点,适合规模化人群筛查。
117 PRSS56蛋白表达和酶活调控在近视治疗中的应用 CN202210942937.5 2022-08-08 CN115896141A 2023-04-04 王红艳; 周翔宇; 王为民; 曾炜佳
本发明涉及PRSS56蛋白表达和酶活调控在近视治疗中的应用。本发明通过全基因组连锁分析、单倍型分析、全基因组测序联合Sanger测序验证的方法,针对两个遗传性高度近视大家系和236例儿童早发高度近视病例进行致病位点检测和验证,结合家系的遗传模式,突变基因频率和动物模型等数据,证实在PRSS56基因翻译起始上游启动子区域c.‑187G>T,c.‑187G>C,c.‑297C>T,c.‑378G>A,c.‑382C>T和c.‑421G>A突变可导致遗传性高度近视的发生,该突变为常染色体杂合突变,基于此提供了检测以上突变位点的遗传性高度近视筛查试剂盒和高度近视动物模型。应用本发明的动物模型和试剂盒能为遗传性高度近视的早期诊断、鉴别诊断及药物治疗提供科学依据,有利于早期预防和治疗,提高患者生存质量。
118 一种发掘水稻柱头外露特异性启动子的方法 CN201410653386.6 2014-11-17 CN104351044A 2015-02-18 周国华
本发明提供了一种发掘水稻柱头外露特异性启动子的方法,通过性状差异极端的亲本进行杂交,在其F4~F5自交后代中持续选择差异显著的个体,分别将其与非柱头外露的常规品种杂交,再回交,每代选择非轮回亲本的柱头外露性状,连续回交6~7代后,即成为遗传背景一致,但在柱头外露性状上极端差异的近等基因系;通过选取近等基因系适当时期的柱头为材料,进行全基因组表达芯片杂交,检测其时空表达模式,确选差异表达基因,进而克隆其上游的特异性启动子。本发明方法可靠,技术路线可行,是发掘水稻柱头这类特殊器官特异表达启动子的有效技术方法。
119 一种鸡保种群个体选配优化的方法 CN201610422017.5 2016-06-13 CN106086172B 2019-09-17 韩威; 朱云芬; 李国辉; 王洪志; 张会永; 盛中伟; 殷建玫; 邹剑敏; 王克华; 苏一军
本发明公开了一种鸡保种群个体选配优化的方法,提取鸡保种群留种公、母鸡个体血液DNA,通过简化基因组测序技术进行测序,并与GenBank数据库参考鸡种进行序列比对,找到存在于不同个体上的SNP位点。通过这些SNP位点的等位基因频率和基因型频率计算出个体自身近交系数和个体间亲缘关系系数,根据统计量的值优化个体选配,避开近交系数过高个体及家系内亲缘关系系数过高交配组合,从而达到降低保种群近交水平和维持遗传多样性总量稳态的目的。通过本发明,能有效解决鸡品种资源保护过程中存在的依靠系谱信息无法进行个体精细选配的难题,能有效降低保种群近交水平,进而达到维持遗传多样性稳态,提高保种效果和保种效率的目的。
120 一种鸡保种群个体选配优化的方法 CN201610422017.5 2016-06-13 CN106086172A 2016-11-09 韩威; 朱云芬; 李国辉; 王洪志; 张会永; 盛中伟; 殷建玫; 邹剑敏; 王克华; 苏一军
本发明公开了一种鸡保种群个体选配优化的方法,提取鸡保种群留种公、母鸡个体血液DNA,通过简化基因组测序技术进行测序,并与GenBank数据库参考鸡种进行序列比对,找到存在于不同个体上的SNP位点。通过这些SNP位点的等位基因频率和基因型频率计算出个体自身近交系数和个体间亲缘关系系数,根据统计量的值优化个体选配,避开近交系数过高个体及家系内亲缘关系系数过高交配组合,从而达到降低保种群近交水平和维持遗传多样性总量稳态的目的。通过本发明,能有效解决鸡品种资源保护过程中存在的依靠系谱信息无法进行个体精细选配的难题,能有效降低保种群近交水平,进而达到维持遗传多样性稳态,提高保种效果和保种效率的目的。